超級核電站運行一個星期後，沒有發現任何安全故障，燕飛才關閉了霧隱島上的火力發電站和所有柴油發電機，全部憑藉超級核電站的發電能力支撐整個霧隱島的電力消耗。
霧隱島上空籠罩的雲霧越來越薄，隨時都有可能消散掉，燕飛就懷疑是這些火力發電廠和柴油發電機向着空氣中排放污染物的原因。所以在有了替代能源後，馬上就將這些污染源永遠關閉。他將要霧隱島建成生態島嶼，自然不會讓這些污染源長期存在。
霧隱島上的施工人員忽然間發現，他們的用電限制被取消了。同在華夏國內工作時一樣，他們已經能夠憑着自己的需要隨時用電了。接着他們發現霧隱島上的火力發電站和柴油發電機全部關停，他們就猜測是燕飛已經解決了電力的來源問題。只是燕飛也不對他們說這個事情，他們也只能私下進行猜測，但是卻沒有任何的結論。
到了這個時候，霧隱島的電力困境全部解決，同時島上的污染源消失，島上的環境也會變得越來越好。然後燕飛就開始製造第二條人造鯨魚，之前那條人造鯨魚每天只能從海水中提取1公斤的鈾元素，但是這一公斤鈾元素只能滿足超級核電站當天發電所需。如果不是之前儲備了30公斤鈾元素，這個超級發電站早就因爲原料不足而關機了。
一旦霧隱島上的用電量忽然增大，那麼鈾元素就會出現入不敷出的現象。所以燕飛必須要早做準備，提前儲備更多的鈾元素。爲了獲得更多的鈾元素，他纔會開始製造第二條人造鯨魚。
另外一邊，在解決了霧隱島上的能源危機之後，楊奇開始着手處理自己建立專業實驗室遇到的第二個現實問題，那就是實驗室計算能力不足的問題。
楊奇在有了思維儀後，能夠通過思維調動輔助智腦的龐大運算能力，在很短的時間裡得出自己想要的數據和結論，但是他實驗室裡的助手們卻無法使用輔助智腦，他們使用的依然是現實世界中的電腦，所以運算能力就有些不足。楊奇佈置下去的任務，他本來以爲很快可以得出結果的，但是因爲他的助手們使用的電腦的計算機能力不足，導致遲遲得不到計算結果，這也拖慢了楊奇進行科技推演的速度。
所以剛剛解決能源危機後，楊奇就決定給自己的實驗室組裝一臺超級電腦，用這臺超級電腦來解決自己實驗室面臨的計算能力不足的難題。
在之前燕飛生產並組裝核電站的那段時間裡，楊奇並沒有閒着，他一直在設計全新的超級計算機。本來現在最前沿的計算機技術是量子技術，但是量子領域博大精深，所有的科學家面對量子技術都是懵的，誰也無法得出一個具體的結論來。就算以楊奇的天才，加上科技推演系統，也無法將量子技術探究透徹，中間還存在很大的不確定性，所以暫時還無法將量子技術運用在超級計算機上面。
雖然無法直接使用量子技術，但是楊奇退而求其次，還是找到了另外一條捷徑，那就是——光子計算機。
光子計算機是一種由光信號進行數字運算、邏輯操作、信息存貯和處理的新型計算機。它由激光器、光學反射鏡、透鏡、濾波器等光學元件和設備構成，靠激光束進入反射鏡和透鏡組成的陣列進行信息處理，以光子代替電子，光運算代替電運算。
光的並行、高速，天然地決定了光子計算機的並行處理能力很強，具有超高運算速度。光子計算機還具有與人腦相似的容錯性，系統中某一元件損壞或出錯時，並不影響最終的計算結果。光子在光介質中傳輸所造成的信息畸變和失真極小，光傳輸、轉換時能量消耗和散發熱量極低，對環境條件的要求比電子計算機低得多。
相比量子計算機，光子計算機的工作原理已經被研究透徹，但是因爲生產技術達不到要求，所以還無法進行大範圍內推廣。但是對於楊奇來說，光子計算機的技術既然已經出現了，他就能在原有技術的基礎上進行完善，將光子計算機技術進行大範圍提升。同時燕飛還有黑金元素和精密產品生產能力，所以霧隱島已經有了生產光子電腦的基礎。
於是在這段時間裡，楊奇一直在設計這款堪稱超級黑科技的光子計算機技術。他不斷的提出新的設計構思，然後自己否定自己，接着又提出新的想法。然後他終於得到了一個成熟的光子計算機方案，接着他將這個光子計算機方法輸進科技推演系統，讓科技推演系統進行推演。
結果在這次推演中發現了幾個小的問題，燕飛繼續改進，然後再次進行推演，終於出現了一個完美的光子計算機制造技術。在科技推演系統的推演下，這臺光子計算機將成爲有史以來最爲完美的一臺計算機電腦。
解決了光子計算機的硬件問題，爲了讓這臺光子計算機能夠達到最佳運行狀態，楊奇開始進行軟件方面的準備。爲了達成這個目的，他甚至編寫了一個電腦操作系統出來。
普通的電腦系統完全通過代碼編寫來完成，比如著名的windows10，它的代碼足足有七千萬條之多，是由幾萬名經驗豐富的程序好手歷經數年的時間編寫而成的，堪稱人類編程史上最頂尖的傑作。所以想要編寫一套完整的電腦操作系統出來，不但需要投入大量的人力、物力和財力，還需要大量的時間。
這個電腦系統就算編寫出來了，能不能被市場接受還是一回事，所以重新編寫一個操作系統的風險非常大。正是考慮到這個原因，大家纔沒有耗費時間和精力去重新編寫一個新的電腦系統，導致全世界絕大多數的電腦操作系統都被米國科技公司所壟斷。他們只要不高興，全世界的電腦就會大罷工。
楊奇設計的是全新的光子計算機，運行原理和普通的計算機完全不同，所以Windows系統的操作程序已經無法支撐這臺光子電腦運行了。而且Windows系統是米國人的系統，裡面可能隱藏無數的殺機，楊奇也不敢放心使用別人的操作系統。
針對這個最爲現實的情況，楊奇乾脆另起爐竈，重新設計了一套全新的計算機語言出來。這就是之前楊奇爲人造鯨魚和超級核電站編寫的，以漢語爲編程基礎的計算機語言，楊奇將它命名爲漢語言。
漢語言不但在編寫程序的使用漢字語言，就是具體的內核算法也全部來了一個大升級，楊奇無中生有的創造出了一個全新的計算方法。如果沒有學過漢語言的邏輯方法，而且對漢語非常精通，根本就無法理解這種全新的漢語言。
和Windows系統使用的C++語言相比，楊奇漢語言更加的精煉和簡潔，它佔用空間資源更少，消耗能源更少，而且運行速度更快。這個漢語言是楊奇的傑作，在經過科技推演系統的確定後，它已經出現在科技樹上，成爲了計算機語言的一個非常重要的分支。
在利用輔助智腦解析了世界上所有的系統操作程序之後，楊奇已經掌握了所有的編程方法，所以才能別開生面的創造出漢語言來。然後他博採衆家之長，並加上最重要的創新，就編寫了一套適用於光子計算機的操作系統出來。
這套漢語言編寫的操作系統非常簡練，不過就算是這樣，它的代碼也足足有足足有五千萬行之多。如果依靠楊奇實驗室的人員用鍵盤來敲打這些代碼，至少需要花費十年以上的時間。
但是在有了思維儀之後，楊奇就能夠以思維的速度在輔助智腦中編寫系統代碼。楊奇頭腦反應非常快，一個小時就足足編寫了百萬行代碼。之所以編寫代碼的效率這麼高，不但是因爲思維的傳輸速度非常快，只要是想到的東西馬上就會在輔助智腦中顯示出來；同時也是因爲楊奇是漢語言的創造者，對漢語言非常熟悉，所以才能以如此高效的方法進行操作系統的編寫。
在燕飛完成超級核電站的修建之後，楊奇使用思維儀的時間就恢復到每天五個小時。楊奇將這五個小時全部用來編寫操作系統的代碼，每天能夠編寫500萬行的代碼。
楊奇一直這樣堅持了10天，然後這個長達5000萬行代碼的操作系統終於完成。接着楊奇利用科技推演系統對這個操作系統的代碼進行推演，結果就在裡面發現了上千處的BUG。
一般來說，每個剛剛出現的操作系統中就會存在大量的BUG，所以在新的操作系統上市之前都會進行內測，希望能夠發現裡面的BUG，並將它們改正。不過就算是這樣，一個新系統上市後也會被發現非常多的新BUG，使得這個新系統非常的不安全，甚至一些BUG從這個系統在市面上銷售到退市的時候都沒有被發現。
所以楊奇的系統儘管出現了一千多處BUG，但是他並不着急，而是慢慢的修改這些BUG。一直到三天後，楊奇才將這些BUG全部修復，這個光子電腦的操作系統就全部完成了。它雖然不是最先進的，功能也不一定完善，但是它一定沒有BUG，是最安全的系統。
相比之前人造鯨魚和超級核電站的智能控制系統，光子計算機的操作系統就複雜得多。所以智能控制系統能夠在很短的時間裡編寫出來，但是操作系統卻需要花費非常多的時間才能完成。
而就在楊奇研究光子計算機的時間裡，燕飛利用小型生產車間再次生產出一條人造鯨魚。這條人造鯨魚同樣完美，在安裝好智能控制系統之後，就已經進入海洋中，提取海水中的鈾元素去了。然後在得到楊奇傳過來的關於光子計算機的生產計劃後，就開始在小型生產車間中生產光子計算機。
光子計算機有別於人類之前的所有計算機，所以它的生產過程非常複雜。不過好在生產它的原材料非常普遍，獲得它非常簡單。同樣的，生產這臺光子計算機，裡面也要加入黑金元素，只有黑金元素，才能大幅提升光子計算機的性能，讓它達到世界上最先進的水準。
所以就在楊奇將光子計算機的操作系統編寫出來之後，燕飛利用小型生產車間已經生產出了第一臺超級光子計算機。
按照楊奇的估算，這臺超級光子計算機的最高計算速度能夠達到恐怖的每秒十萬億億次。而且因爲光子計算機能夠進行並行計算，所以它的實際運算速度至少還要在這個基礎上提升一倍以上，也就是每秒二十萬億億次。
世界上最快的超級計算機本來是華夏的神威.太湖之光，它一直蟬聯世界上運算速度最快的超級計算機榜單第一名。直到18年才被米國的超級計算機Summit超越，Summit的峰值速度爲每秒20億億次。
也就是說，世界上運算速度最快的超級計算機的運算速度只有每秒20億億次，而楊奇設計的這臺超級光子計算機的運算速度爲每秒20萬億億次，這個光子計算機的運算速度足足是世界上最快計算機的萬倍以上，它已經超越了人類社會所有超級計算機的計算極限。
光子計算機現在的運算能力已經非常恐怖了，但是卻依然和輔助智腦的運算速度差得很遠。然後楊奇就有些懷疑，輔助智腦是量子計算機，而且是達到了非常高水準的量子計算機。光子計算機想要達到輔助智腦的運算水準，還有非常大的差距需要跨越。
不過就算是這樣，光子計算機的運算速度也遠勝世界上其它超級計算機了。其它的超級計算機都是各自國家的寶貝，他們紛紛在自己的超級計算機中進行各種模擬實驗，得出一些無法在現實世界中進行的禁忌實驗的數據，從而完善自己的科技水平。不過因爲普通超級計算機的運算能力有限，所以得出的數據中始終有一些錯誤存在，這就使得他們得到的模擬數據並不完全正確。
但是超級光子計算就就完全不存在這個問題，因爲它的計算能力非常強悍，所以它的模擬實驗更加真實，而且速度更快，數據錯誤也更少。用它來模擬核武器的爆炸，已經和真實的核武器爆炸差不了多少了，所以它收集的核爆數據也更加真實。
不但如此，楊奇還能將光子計算機當作地球模擬器使用。他只要在光子計算機的數據庫中建立一個地球模板，然後將真實地球的各種數據輸入進去，就能以在光子計算機裡形成一個極度仿真的地球。然後在這個仿真地球上進行各種虛擬實驗，比如在仿真地球上製造一場十級以上的地震，就可以觀察出超級地震的破壞能力；又或者安排一塊巨大的隕石來撞擊仿真地球，就可以觀察地球的防撞擊能力。
有了這個仿真地球，加上光子計算機的強悍運算能力，楊奇就可以以最小的代價得出更多的實驗數據，讓他能夠增強科技推演系統的推演能力，得出更多的真實科技。
而且光子計算機的技術還沒有到頂峰，它還會繼續進步，所以它的運算速度還會越來越快。而普通計算機的技術基本上到頂了，現在比拼的是生產工藝，它的計算能力越來越難以提升。所以普通計算機技術屬於夕陽產業，而光子計算機技術屬於前途無量的朝陽產業。
光子計算機前途無量，普通計算機已經開始走下坡路了。所以隨着時間的過去，科技的發展，光子計算機將遠遠將普通計算機甩在身後。唯一能和光子計算機媲美，甚至超越光子計算機的，就只有還沒有在世界上出現過的真正意義上的量子電腦了。
這臺超級光子計算機零部件非常多，足足達到了兩千萬個。就算以燕飛的體力，將它們完全組裝完成也消耗了整整十天時間。組裝完成後的光子計算機體型龐大，足足佔據了四個房間。不過好在它的能耗並不大，只有普通超級計算機的百分之一，以超級核電站的供電能力，還是非常輕鬆的。而且它散發的熱量很小，基本上不存在散熱問題。
光子計算機組裝完成後，楊奇控制輔助智腦連入光子計算機，開始將操作系統導入光子計算機中，然後超級光子計算機開機進行自動檢測。畢竟這是經過科技推演系統確認過的計算機科技，而且燕飛在生產的時候也嚴格按照生產標準來進行，所以這臺光子計算機很快就通過了檢測。
然後它開始正式運行，在楊奇的親自操控之下，發現超級光子計算機的運行非常完美，完全達到了設計的所有要求。毫不誇張的說，如果人類社會的計算機能力不出現大的突破的話，他們將永遠也超越不了楊奇這臺超級光子計算機。