崇禎六年底，民軍進入河南以後，當地饑民紛紛蟻附，民軍實力陡然增長。在此後的一個月內，民軍在河南中西部地區橫衝直撞，接連攻克了一系列州縣。
河南是大明朝柔軟的腹部，統治力量薄弱，加上思想準備不足，官軍被打了個措手不及。
十二月，官軍在捱了一系列組合拳之後，漸漸清醒過來，對民軍發起了反撲。新任河南巡撫玄默率湯九洲、左良玉兩大帥在舞陽、保安、泌陽三次打敗民軍。
民軍人數雖多，但都是些烏合之衆，戰鬥力不強，只能避實擊虛，無法與官軍進行野戰爭鋒。在被官軍痛毆幾次之後，民軍在平原無法立足，開始向河南西部和湖廣的山區轉移。
山區是民軍的避風港，每當民軍受傷的時候，就會躲進深山老林裡休養，等到恢復元氣之後再出來活動。官軍在平原地區雖然能戰勝民軍，但是沒有力量進山圍剿，一旦民軍進入山中，官軍只能望山興嘆。
這是長期困擾官軍的一個問題，也是明末民變長期得不到解決的一個主要原因。
能否解決這個問題，決定了這場戰爭的勝負，也決定了明朝的命運。
然而，當局者並沒有認清這個問題，也沒有朝解決這個問題的方向去努力，文官集團往往紙上談兵，提出一些與解決問題毫無益處的戰略，做出一些不切實際的佈局，使問題長期得不到解決，國家長期消耗下去，最終被活活拖垮。
這是後話，暫且不提。
民軍大規模向山區轉移，急壞了一個人，此人就是鄖陽撫治蔣允儀。
鄖陽位於陝西、河南、四川、湖廣四省交界處，屬於四不管地區，轄區內崇山峻嶺，是落草爲寇的好去處，自古以來就容易產生匪患，號稱“盜賊藪淵”。
民軍在向山區轉移的時候，鄖陽是必經之地，也是理想的目的地，於是這裡很快就成了民軍的總部基地。
蔣允儀看到大量民軍聚集到鄖陽地區，料到民軍早晚會對鄖陽城發起攻擊，自己既無力阻止民軍進入，也很難保證鄖陽城門不失，他己經看到，自己的悲劇很快就要上演，於是他大聲疾呼。
他向皇帝上疏訴苦：鄖陽是個窮苦的地方，他到任兩年來幹了不少工作，又是修城，又是積米，又是製造武器，又是練兵，取得了不小的成績。但是由於鄖陽底子太薄，這點成績只能免強維持局面。就像是一個窮苦人家，弄了一斗米就能度過災年一樣，只能維持生計，幹不了別的事情。
言外之意就是民軍進入鄖陽我無力阻攔，鄖陽失守我也負不了責任。
雖然蔣允儀表示“臣不愧死，亦應憤死”，“所惜者皇上封疆耳”，但是從他說話的意思看，爲自己解套，打預防針的意圖在憂國憂君這個高尚的外衣下，呼之欲出。
蔣允儀說得很委婉，但是他說得有道理，小小的鄖陽確實對付不了如潮水般涌來的民軍。不過他的道理並沒有被接受，因爲崇禎是一個只看結果，不看原因的人，他沒有功夫研究原因，而是非常直接、毫不留情地追究責任，他最擅長的事情就是辦人。
陝西出了問題，辦胡廷宴，主撫出了問題，辦楊鶴，山西出了問題，辦宋統殷，河南出了問題，辦樊尚燝。民軍一路流竄，大明的總督、巡撫掉了一地。
按照這個規律，現在民軍流竄到鄖陽，該辦蔣允儀了。
果不其然，沒過多久，崇禎下令把蔣允儀革職拿問，同時啓用大名兵備道盧象升爲右僉都御史兼鄖陽撫治。
事實上，蔣允儀並非庸碌之輩，他在鄖陽任上頗有政績，深得民心，因此，當錦衣衛抓捕蔣允儀的時候，當地老百姓哭聲一片。
崇禎不講程序正義，只知道殺雞駭猴，殺一儆佰。所有被他處理過的人，都覺得自己很冤，不管他換人的結果如何，他的做法必然會失去人心，長此以往，沒有人再會爲朱家王朝賣命了。隨着時局逐漸艱危，這種做法的負面作用也越來越大，以至於明朝滅亡之際，崇禎成了真正的“孤家寡人”。
好在接替蔣允儀出任鄖陽撫治的盧象升也不是等閒之輩，盧象升進士出人，爲人忠義，政績突出，歷年的考覈都是“治行卓異”，最爲難得的是，盧象升雖然是一個文人，卻勇武有膽略，有“了卻君王天下事”之志，因此被吏部會推出任鄖陽撫治這一個極具挑戰性的職務（只有艱苦的差事纔沒有人走後門）。
盧象升受命於危難之時，但他還並不是挑大樑的，真正的中流砥柱是新任五省總督陳奇瑜。
陳奇瑜是山西保德人，萬曆四十四年進士，當過洛陽知縣、禮科給事中、陝西副使等職，崇禎五年，延綏巡撫張福臻的部下發生譁變，被崇禎罷免，當時任陝西右布政使的陳奇瑜接替張福臻出任延綏巡撫。
陳奇瑜上任時正趕上洪承疇在陝西對民軍大開殺戒，陳奇瑜乘風破浪，指揮部下剿殺了截山虎、一條龍、開山鷂、馬紅狼、隔溝飛、一塊鐵等，戰績不俗，使延綏一帶“諸渠魁略盡”。
光說不練假把式，光練不說傻把式。
陳奇瑜當過禮科給事中，嘴上功夫相當了得，據說當年楊漣彈劾魏忠賢二十四大罪時，陳奇瑜也跟風彈劾。
因此陳奇瑜不僅幹得好，而且說得比干得還要好。他在給皇帝的奏疏中說道，在皇上的英明領導下，將士們爭先效命，擒斬了匪首一百七十七人，亂民全部被驅散，以前斬木揭竿而起的人，現在都扛起鋤頭種地去了。崇禎聽了十分高興，對陳奇瑜讚賞有加。
陳奇瑜受到皇帝的表揚，如同吃了興奮劑，幹活更加賣力，緊接着又率軍斬殺了盤距在延水關的鑽天哨、開山斧、金翅鵬、一座城，掃除了陝西境內的最後一股民軍。
陳奇瑜戰果輝煌，威震關陝，光芒甚至蓋過了大名鼎鼎的洪承疇，成爲大明政界和軍界的一顆新星。
崇禎七年初，民軍進入中原以後，轉戰於河南、湖廣、四川等地。鑑於民軍的流動性，爲統一事權，彌補兵部搖控指揮的不足，更好地圍剿民軍，廷臣紛紛建議設立五省總督，總統陝西、山西、河南、湖廣、四川五省軍務。
崇禎本不想讓大臣掌握過大的權力，但是由於民軍到處流竄，牽涉甚多，他原先提高當事各省巡撫事權的做法明顯不合時宜，因此不得不同意設立五省總督。
在人選問題上，以資歷、聲望、事功論，似乎非洪承疇莫屬，然而崇禎認爲洪承疇負責三邊邊防的重任，不能分散注意力。
這只是一個藉口，在陝西境內屢有戰功，風頭正勁的延綏巡撫陳奇瑜早己簡在帝心。
崇禎七年正月，陳奇瑜被任命爲兵部右侍郎兼右僉都御史總督陝西、山西、河南、湖廣、四川軍務。二月陳奇瑜走馬上任後，立即指揮各路人馬殺向民軍。
戰果依舊輝煌。
四個月內陳奇瑜組織打了二十三仗，全部獲勝，民軍在平原站不住腳，只能以山區爲依託，轉戰於漢中、興安、鄖陽、房縣一帶。
民軍進入山區以後，官軍在難題面前表現畏縮，誰也不願意幹進山追剿這個髒活累活，都以把民軍驅逐到相鄰省份爲能事。
崇禎對這種踢皮球的行爲十分不滿，四月二十日親自下旨催戰，對各撫鎮予以口頭警告。
爲貫徹落實崇禎的指示精神，陳奇瑜策劃了一個關門打狗的戰略部署：他命令陝西巡撫遏守北線，鄖陽撫治盧象升遏守西線，河南巡撫玄默遏守東線，湖廣巡撫唐暉遏守南線。
關門容易打狗難，陳奇瑜親自擔起了打狗的任務，率軍入山追剿民軍。
不管戰況如何，陳奇瑜作爲一個領導，勇挑重擔、不怕狗急跳牆的精神還是十分難能可貴的。不像有些領導，只知道摘桃子。
陳奇瑜和盧象升首先重點對鄖陽附近山中的民軍進行剿殺，兩人督率官軍翻山越河，緣崖攀樹，對民軍展開跟蹤追殺，屢有斬獲。
在成績面前，陳奇瑜洋洋得意，他上疏向崇禎報告，由於他本人親自率軍入山搜剿，楚中大盜基本上被掃蕩乾淨。
陳奇瑜說的是事實，但是還有另外一個事實，大量的民軍從湖廣的山區轉移到了陝西漢南地區的山中。
崇禎從陝西三邊總督洪承疇那裡得到了“另外一個事實”，他認爲陳奇瑜活幹得不乾淨，指示陳奇瑜“儘速掃蕩”，於是陳奇瑜繼續率軍北上。
崇禎七年夏，民軍李自成、張獻忠、蠍子塊、張妙手等部在官軍的壓力下，誤入興安南面的車箱峽。
車箱峽，顧名思議，周圍懸崖絕壁，無法攀爬。民軍人馬斷糧，又趕上天降大雨，走投無路。在這種情況下，民軍再次祭出屢試不爽的必殺絕技——詐降。
也許陳奇瑜中了敵人的糖衣炮彈，也許他認爲民軍是真的被打服打怕了，也許他擔心民**急跳牆，也許是他想玩寇自重，不知出於什麼原因，陳奇瑜竟然不顧反對意見，同意招撫。
陳奇瑜把民軍請降的事情上疏請示朝廷，崇禎和兵部尚書張鳳翼經過思考，同意招撫。
在陳奇瑜的安排下，被困的三萬六千民軍成建制地安然走出了號稱天險的棧道。一路上與護送的士兵有衣同穿，有飯同吃，友好相處。可是剛走出棧道，民軍突然反叛，將安撫遣送官或殺頭、或割耳、或杖責、或捆綁擲之道旁，然後發兵連陷七縣，沿途燒殺擄掠，形勢一片大壞。
半年前的澠池渡事件再次重演。
一時間，陳奇瑜爲千夫所指，從香餑餑變成了臭狗屎，言官交章彈劾，陳奇瑜也爲自己百般辯解，將禍水引向他人，指責陝西巡撫練國事破壞撫局。
招撫失敗是否另有原因？陳奇瑜是否遭人暗算？我們己經不得而知了，但是我們可以知道，按照前面所說的規律，陳奇瑜落馬是必然的結果。
一陣太極拳之後，這年十一月，陳奇瑜被除名、戍邊。
雖然陳奇瑜的招撫是經過皇帝和兵部尚書批准的，但是招撫的過程中理應考慮到反叛的可能性並提前做好防犯工作，因此陳奇瑜還是要對這此事件負主要責任的。這次失誤暴露了他升遷過快，經驗不足的弱點。
雖然陳奇瑜犯了錯誤，但他任職期間在戰場上的表現還是可圈可點的，不應該一棍子打死，不如讓他戴罪立功，也許這樣的話，明朝可能不至於這麼快滅亡。
對陳奇瑜的處理反映了崇禎生性苛薄，用人上過於大起大落的弱點。
明朝滅亡後，南明唐王召陳奇瑜爲東閣大學士，陳奇瑜以道遠爲由沒有赴任，不久病死。
大明沒有再給他機會，他也沒有再給大明機會。