武舉考試後，新進的武進士進入講武堂，另編一班，名曰進士班。兩邊涇渭分明，彼此之間不大往來。這正是孫傳庭想要的結果，只有平衡纔是長遠之計，軍官全部來自一個地方，會使得軍隊中近衛軍勢力太大，這是很多人都不想看到的情況。
武舉後進行的是科舉考試，之所以提前這麼久，是要方便有些人落榜後可以進行京師大學堂的招生考試，葉向高爲主考，孫傳庭爲副主考，共錄取了進士同進士兩百一十三人，其中狀元餘煌，榜眼華琪芳，探花吳孔嘉。
發榜之日，衆考生的樣子可比三年前要平靜多了。東廠來報，沒有考上的痛哭的少了，榜下捉婿的也少了，考上以後歡呼雀躍的倒還是一樣，但周圍羨慕嫉妒的眼神少了很多。
朱由校很是高興，這說明隨着京師大學堂的開辦，士子們有了更多的上升渠道，大家不會再一起擠科舉這個獨木橋了。他知道，一個國家裡階層固化是最大的問題，必須讓各階層都知道，自己可以上升到更高的階層，這樣的國家纔會有活力。現在看來，自己的辦學在這個方面倒是起到了很好的作用。
天啓五年初，京師大學堂的招生考試終於開始了。因爲招生人數多，而且參考資格低，所以其熱鬧程度超過了科舉考試。
師範學堂和吏員學堂招生依舊如以前一樣，都是招收了一千二百名，研究院依舊是六百人，國文院招收了三百人。吏員學堂下面專門設立了一個法學院，專門招收法律學員，共招了六百人，院長是大理寺卿吳仁度。
翰林院已經按照皇帝的要求將《大明律》修繕完成，這個工作量並不大，只是在刑罰世輕世重方面，以及執法機關的改變方面，還有刑罰的類型方面進行了修改。
刑罰時輕時重全部廢除，執法機關變成了大理寺及下屬的各級法院，刑部只擁有偵查逮捕之權。刑罰的類型廢除了枷號刑，但充軍依舊保留，而且加入了充軍四千裡以上的刑罰，這是爲了開拓新殖民地做準備。其餘的笞、杖、徒、流、死刑依然保留，但規定除非謀逆，死刑都採用絞刑，以留全屍。
朱由校本來想把剮刑廢除掉，但得到了大臣們的一致反對。大家都認爲，即使不用，將這個刑罰列在《大明律》中，也是有威懾作用的。
而在《大明律》的修繕中，最讓大臣們滿意的一點就是不論是東廠還是錦衣衛，廉政公署還是經濟調查局，都和刑部一樣只具有調查逮捕之權，這讓魏忠賢非常不滿意，在朱由校面前抱怨了幾次，搞得朱由校很不耐煩，最後只好罵道：“你們抓了個人，問出了他的罪證，難道大理寺還敢爲他開脫嗎？再說，有些人你想讓他死在詔獄中，那還不是一句話的事。”
魏忠賢眉開眼笑道：“聖上這麼說奴婢就明白了，只要聖上想讓誰死，那誰就一定得死。”
朱由校點了點頭道：“廠臣，你這一點很讓朕滿意，即便你想要誰死，也要先告訴我，由我來決定，人命關天，不要讓它成爲別人攻擊你的藉口。”
魏忠賢趕緊道：“那當然是聖天子斷人生死，奴婢萬萬不敢自作主張。”
天啓五年二月初二，京師大學堂正式開學了。朱由校前往法學院，要進行開學演講。
法學院的禮堂（其實就是餐室）裡已經坐滿了新招的法律學員。見到皇帝和閣臣時，大家便要跪下行禮，被維持秩序的錦衣衛制止了。在錦衣衛的提示下，大家一起躬身作揖。
朱由校來到臺上，等吳仁度宣佈由皇帝陛下講話時，來到了喇叭前道：“各位學員，朕是大明皇帝，也是京師大學堂的山長。在京師大學堂中，大家見到朕是不用行跪拜禮的，這一點以後要記住。”
“今天朕非常高興，在各位大臣的努力下，我們的法學院終於成立了。以後全國各府州縣，都會有專業的斷案人員，那就是你們。”
“朕今天有幾點要說的，第一點就是，法律是剛性的，是朝廷意志的體現，是不容違反的。以往的案件中，我們首先考慮的是情和理，然後纔是法。這不行，有一句話叫法不容情，法律是冰冷的，是就是是，不是就是不是，沒有什麼情理可言。我們日後當上了法官，必須記住這一點，大明的法律在沒有修改之前，是一定要按法辦案的。朕簡單地歸結爲這麼幾個字：有法可依，這是制定法律的事，有法必依，執法必嚴，違法必究，這就是你們的事。至於考慮法律之外的情與理的事，那是朕的事。”
“第二個要強調的是，法律是幹什麼的？法律是管誰的？我們一直都認爲，法律是用來管老百姓的，這對不對呢？朕覺得，對也不對，老百姓也會觸犯法律，那法律就會管這批人，而法律其實最重要的是保障老百姓的權力，不讓官吏侵吞老百姓的利益。我大明法律在這一個方面是做得比較好的，每年被抓的官員人數雖然比不上老百姓，但如果從比例上來看，是遠遠高於老百姓的。”
“我國有句古話，王子犯法，與庶民同罪。這句話流傳極廣，但做得如何呢？古代有強項令，他的故事一直在今天都還有人在傳頌。那是不是說我國就做到了這一點呢？朕覺得不是，因爲之所以強項令的故事可以流傳千年，便是因爲這樣的人，這樣的事太少，因爲稀少所以顯得珍貴。朕提出一個口號，法律面前，人人平等。包括朕，朕也必須遵守法律。朕如果違反了法律，也要接受法律的審判。”
坐在下面的學員們面色奇怪地看着皇帝，慢慢地開始有人小聲談論起來。而朱由校身後的大臣們面色肅然，雖然限制皇帝的權力是他們的理想，但皇帝突然說自己也要接受法律的審判，讓他們一時不知如何是好。
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