到舊金山之後，斯普魯恩斯就被解除了一切指揮權限搭上了前往美國東海岸的列車，返回馬里蘭州的巴爾迪摩市，那也是他的故鄉。此時，斯普魯恩斯並不知道米切爾正率領第五艦隊走向毀滅，相關的消息要到第二天的晚上纔回送到。實際上，此時斯普魯恩斯也沒有心情去“關心”第五艦隊了，他只是想早點回到家裡，過一段清靜的日子。
當時，斯普魯恩斯已經轉入了預備役（按照美軍的規矩，沒有現役指揮權的將領都自動轉入預備役編制，在其接到下一道任命之前，都爲預備役將領），基本上沒有什麼事好做。在回到了巴爾迪摩之後，斯普魯恩斯也只能通過報紙瞭解前線的情況，可是當時美國國內的報紙在戰爭報道方面嚴重失實，根本就沒有準確的報道戰況與戰鬥結果，這主要是政府爲了穩定民心，在控制了傳媒之後有意編造的一些虛假報道。
對於第五艦隊成功擊退了唐帝國的主力艦隊，並且守衛了夏威夷羣島的報道，斯普魯恩斯一點都不相信，因爲就在這篇報道出來之前，斯普魯恩斯接到了特納打給他的電話，知道第五艦隊遭受了慘敗，除了特納的第52特混艦隊之外，其他兩支特混艦隊全軍覆沒，六艘+戰列艦，以及除了幾艘驅逐艦之外的其他所有護航戰艦全部戰沉。相反。唐帝國地主力艦隊卻沒有損失一艘航母，護航戰艦的損失也微乎其微。美國海軍獲得的不是一次重大的勝利，而是一次慘痛的失敗。
如果是在幾年前，這次慘敗還能夠激發斯普魯恩斯的鬥志，讓他主動要求重返艦隊，可是現在，斯普魯恩斯不但沒有一絲的激情，反而覺得有所解脫。至少這次慘敗證明了米切爾的冒險行動是完全錯誤地。當然，已經無法去追究米切爾的責任了，這名衝動的將領已經跟隨艦隊一起沉入了大海。
不久，斯普魯恩斯就收到了尼米茲的電報。當時尼米茲仍然爲美軍太平洋戰區司令官，太平洋艦隊總司令。電報中，尼米茲要求斯普魯恩斯做好隨時返回艦隊的準備工作。他正在爲斯普魯恩斯回到太平洋艦隊而努力。另外，新的一批戰艦即將完工，太平洋艦隊很快就會恢復實力，而缺少地是一位能夠主宰全局的指揮官。對於尼米茲這封電報，斯普魯恩斯仍然沒有太多的激情，因爲他知道，米切爾的失敗在很大的程度上並不會改變他此時的窘境。
如果米切爾的冒險行動成功了的話，斯普魯恩斯回到太平洋艦隊，或者是回到太平洋戰區的可能性還要稍微大一點。到時候，尼米茲肯定會組織戰略反擊。在米切爾繼續負責指揮第五艦隊的同時，尼米茲需要一名優秀地戰區參謀長。而斯普魯恩斯是最佳的選擇。可問題是，現在米切爾已經失敗了。尼米茲也沒有能力組織戰略反擊，甚至連防禦都顯得格外吃力，同時總統會追究海軍地責任，米切爾已經陣亡，特納成功的保全了第52特混艦隊，能夠承擔責任地只有尼米茲本人|尼米茲連自保都有問題的情況下，又怎麼把斯普魯恩斯弄回太平洋艦隊呢？
斯普魯恩斯的判斷相當準確。他並沒有收到任何讓他返回太平洋戰區，或者是太平洋艦隊的命令。甚至很少有電話找他。此時，斯普魯恩斯已經不對太平洋戰場抱太大的希望，同時也不對自己能夠返回海軍抱太大的希望，至少他仍然是海軍上將，每個月的薪俸會準時送到，家裡的生活也不是問題。在沒有其他事好做地情況下，斯普魯恩斯開始着手爲撰寫回憶錄做準備。當然，從根本上，斯普魯恩斯不會把海軍，把戰場上的變化拋在腦後，就算表面上他不再關心戰爭地事情，可是實際上，他每天都會閱讀巴爾迪摩的地方報紙，以及海軍的內部報紙，還設法弄到了《華盛頓郵報》與《紐約時報》，在無法接觸到更真實可信的戰報時，他只能通過這些報紙，加上自己的分析判斷來推測前方的戰鬥情況。
戰局的變化速度遠超過了斯普魯恩斯的預料。在“剷除”了第五艦隊這個障礙之後，唐帝國海軍迅速的攻打了考愛島。美軍陸戰隊，以及航空兵在考愛島進行了頑強的防禦，尼米茲也調動了一切可以調動的力量去對付唐帝國海軍的進攻。在前一個多月的時間裡，美國國內各大報紙上充斥着勝利的捷報，可斯普魯恩斯很清楚，在失去了艦隊的掩護之後，美軍是不可能守住考愛島的。也許唐帝國海軍的進攻準備並不充分，所以導致進攻考愛島的行動不太順利，可這只是個時間上的問題而已。
美軍在考愛島上的堅持並沒有能夠扭轉戰局。當時唯一的希望就是特納的第52特混艦隊（隨後就被正式升級爲第五艦隊）。可問題是，該艦隊在之前的作戰中損失了大批的飛行員，就算擁有完整的戰艦編制，而且補充的作戰飛機也迅速到位，可是在缺乏足夠的飛行員的情況下，艦隊根本就沒有作戰能力。結果，陸戰隊在考愛島上苦守數月，都沒有盼來艦隊。在做出了最艱苦的努力之後，尼米茲只得下達了撤退命令，美軍爭先恐後的撤出了考愛島。
就在考愛島淪陷之前，第五艦隊突然接到命令離開了舊金山，開始戰場。當時，美國國內報紙宣揚第五艦隊將再次獲得輝煌的勝利，並且最終扭轉太平洋的戰局。可實際上，斯普魯恩斯在看到相關的報道之後，立即就知道，特納無疑是在去送死。此時，太平洋戰場上，唐帝國海軍已經有兩支主力艦隊在執行作戰任務，實力是第五艦隊的五倍以上。另外，唐帝國海軍還部署了大量的支援艦隊，因此陸戰隊不需要主力艦隊的支持。第五艦隊在此時離開安全的舊金山港，無疑是泥牛入海，有去無回！
斯普魯恩斯的判斷一點都沒有錯，唐帝國海軍第一艦隊與第五艦隊圍殲特納指揮的第五艦隊的作戰行動沒有任何懸念，從始至終，特納甚至連還擊的機會都
:▊|國的報紙在承認第五艦隊遭受慘痛損失的同時，也誇張的擴大了戰果，宣稱在戰鬥中擊沉了唐帝國海軍八艘航母，十艘戰列艦，以及數十艘其他戰艦。對不知情的平民而言，這確實是一次偉大的“勝利”，可是對斯普魯恩斯來說，這簡直就是一個笑話，當時唐帝國海軍一共才九艘戰列艦，而且有四艘在大西洋上作戰，太平洋上只有五艘戰列艦，哪來的十艘戰列艦讓第五艦隊炸沉？
隨着太平洋艦隊最後一點實力被消滅掉，太平洋戰爭已經沒有任何懸念了。當時，斯普魯恩斯就意識到，唐帝國海軍在確定將獲得太平洋戰爭的勝利之後，肯定會提前採取行動，控制從太平洋進入大西洋的通道，也就是巴拿馬運河，並且將以巴拿馬運河爲突破點，將勢力延伸到美洲大陸，通過奪取中美洲地區，最終登陸美洲大陸，然後向北推進，從墨西哥攻入美國本土。
這時，斯普魯恩斯寫了一份極爲重要的報告，準備直接交給金上將。畢竟金上將對斯普魯恩斯還是很賞識的。也就是斯普魯恩斯的這份報告交出去之後不久，就傳來了唐帝國海軍陸戰隊攻打巴拿馬運河，並且最終成功的佔領了巴拿馬運河的消息。到此，斯普魯恩斯的推斷得到了證明，唯一讓他沒有想到地是。唐帝國海軍進軍巴拿馬運河的速度會這麼快，美軍根本就來不及做出防禦調整就丟掉了極爲關鍵的巴拿馬運河。隨着巴拿馬運河淪陷，以及唐帝國海軍成功的控制了南大西洋的制海權，太平洋戰場上的戰鬥已經沒有任何懸念了。美國海軍再也無法將艦隊派遣到太平洋去，也就不可能在太平洋上與唐帝國海軍對抗，瓦胡島淪陷只是遲早的事情。
也就是在唐帝國陸戰隊攻佔了巴拿馬運河之後三天，斯普魯恩斯接到了金上將打來的電話，隨即他就收拾起行李前往華盛頓地海軍部報道了。斯普魯恩斯的新身份是金上將的特殊顧問。他仍然屬於預備役編制。並沒有恢復現役將領的身份。可正是回到了海軍部，並且得到了金上將的特別照顧，斯普魯恩斯開始接觸絕密的戰場資料，並且參與到了美國海軍地戰略策劃工作中去。
在海軍部的這幾個月裡，斯普魯恩斯變得圓滑了很多，而且他主要涉及到的不是太平洋上的作戰行動。而是擴大，並且重組大西洋艦隊的工作。也正是從這個時候開始，奠定了斯普魯恩斯出任大西洋艦隊總參謀長的基礎。當時，金上將首先考慮的是讓斯普魯恩斯出任大西洋艦隊總司令，可是隨後不久，尼米茲就丟掉了瓦胡島，被迫撤回了美國本土，而所有以前太平洋艦隊的將領以及軍官都因爲太平洋戰爭的失敗而受到了牽連。斯普魯恩斯也是從太平洋艦隊出身的，考慮到這種身份，金上將回避了容易遭到否決地問題。就沒有提名斯普魯恩斯出任大西洋艦隊總司令，而是繼續由自己兼任大西洋艦隊總司令。並且以艦隊總司令的身份向總統提名由斯普魯恩斯出任艦隊總參謀長，這樣就更容易獲得總統地批准。
很明顯。在處理軍隊人事關係，並且使用官場手腕方面，60多歲的金上將要比斯普魯恩斯圓滑得多。如果當時金上將直接提名斯普魯恩斯出任大西洋艦隊總司令地話，很有可能遭到總統的否決。也正是繞了個彎子，最終總統批准了金上將的提名。26年底，斯普魯恩斯以金上將的特殊顧問身份出任大西洋艦隊總參謀長，並且去了諾福克軍港。在金上將不直接指揮大西洋艦隊作戰的時候，斯普魯恩斯成爲了大西洋艦隊的實際指揮官。
在斯普魯恩斯上任的時候。最新一批建成的戰艦已經交付給了大西洋艦隊。原本這批戰艦都是爲太平洋艦隊建造地，結果太平洋艦隊已經完蛋了。只能交付給大西洋艦隊，而大西洋艦隊的要求有有所不同，結果大部分艦艇被交回船廠，花了一兩個月地時間進行改造，到年底的時候纔再次交付海軍。
當時，美國海軍新獲得的戰艦中包括了六艘航母，分別是：CV-34“奧里斯坎尼”號，CV-35復仇”號，CV-44企業”號，CV-45“山”號，CV-46“硫黃島”號，以及CV-47“福吉谷”號。第一批四艘“蒙大拿”級戰列艦也相繼完成建造，並且加入了美國海軍，這四艘戰列艦分別是：BB-67“蒙大拿”號，BB-68俄俄”號，BB-69“緬因”號，BB-70“新罕布什爾”號。原本計劃同期建造的BB-71“路易絲安納”號因爲資源有限，沒有能夠順利建成。除此之外，還有十二艘“底特律”級巡洋艦，12艘“邁阿密”級巡洋艦，36驅逐艦同期服役。
這些戰艦足夠組成一支龐大的主力艦隊了，其規模並不在唐帝國海軍第一艦隊之下。可是，斯普魯恩斯並沒有因此而恢復信心，原因只有一個，當時美國海軍沒有足夠多的優秀官兵來操作使用這些戰艦，就更不可能讓這些戰艦扭轉戰局。
在此之前，美國海軍的精銳都集中在太平洋艦隊，大西洋艦隊主要承擔的是護航任務，甚至不需要派遣主力艦隊去支持英國人控制北海與地中海，也就一直沒有部署主力戰艦。現在，太平洋艦隊已經損失殆盡，僅存的官兵根本就無法滿足一支大型艦隊的需要，而要重新培訓官兵，不但麻煩，而且需要很多的時間。當時，斯普魯恩斯也沒有其他的選擇，出了訓練之外，他沒有第二個辦法可以提高艦隊的戰鬥力了。因此，在他到達了諾福克之後，做的第一件事情就是重新部署艦隊的訓練計劃，並且直接向金上將表態，如果要在訓練完成之前派遣大西洋艦隊出戰的話，他將辭去總參謀長的職務！