顓頊繼承人皇之位，被衆尊爲黑帝，統領人族，有軒轅黃帝打下的基礎，又有截教弟子鼎力相助，再加上顓頊本身才能，人族穩步發展前進，越發興盛起來，如果一直這樣保持下去，顓頊絕對會成爲一代明君，即使比不上神農，軒轅這些證得人皇果位皇者，也是人族少有大賢。只是隨着時間推移，顓頊變得野心勃勃起來，一心做出超越軒轅黃帝之功績，所以他把主意打在大巫九鳳帶領的九黎部落上，軒轅黃帝在位是一直沒能收服這支部落，若是自己將其收服或剷除，那麼至少有這方面勝過軒轅黃帝。
顓頊找來多寶道人商量此時，頓時把多寶道人嚇了一跳，自從經歷上次刑天的打擊之後，多寶實在不願再去招惹巫族，連忙勸導顓頊放棄此事，只是顓頊被超越軒轅黃帝的功績迷昏了頭，一意孤行，非做不可，多寶只得答應下來，幫忙想辦法，不過多寶道人特別聲明不會親自動手，一切還要靠顓頊自己。
多寶和顓頊經過多番商議，總算拿出一個計劃來，要想徹底剷除九黎，首先要對付九鳳，顓頊以人皇身份向九鳳求親，聲明原與九黎和平共處，此時九黎部落之人在深山老林過得甚是艱難，而且巫族駐地那邊的資源也越來越少，若是能與人皇結親，那麼這一切都很得到改善，爲了巫族，爲了九黎，九鳳大巫想也沒想就答應下來，只是她哪裡知道自己已走進多寶和顓頊設下的陷井。
多寶道人知道九鳳答應婚事之後，便去了北俱盧洲的妖族駐地，與白澤，鬼車，盤王等幾個妖族高層秘談一番之後，從盤王手中拿到了一幅以蠱蟲屍體秘製的毒藥，巫妖之間的仇恨由來已久，能夠打擊巫族的機會妖族從來不會放過，更何況這次不用自己出手。
成親當日九鳳喝下毒酒，全身痠軟無力，十成功力發揮不出一成，又被顓頊提前埋伏好的衆多人族高手圍攻，形勢岌岌可危，就在九鳳即將喪命之際，一直追隨九鳳的兩個大巫忽然全身帶傷的殺了過來，救緩九鳳，原來兩位大巫也身中劇毒，被人圍攻，自知絕無倖存可能，便決定拼上性命設法救出九鳳，兩名大巫衝到圍攻九鳳的人族高手之中同時自爆，將包圍圈破開一個缺口，九鳳趁機衝了出去，然後化爲九頭鳳凰形態的大巫真身疾速向巫族駐地飛去，顓頊等人追之不及，最終被九鳳逃掉。
九鳳勉強飛回南部瞻洲的巫族駐地便昏了過去，祖巫祝融親自出手，費盡心力纔將九鳳體內的蠱毒焚化掉，將九鳳救回，九鳳醒來之後將自己的遭遇一說，頓時整個巫族羣情激憤，一個個吵着要去找顓頊算帳，不過被祝融阻止了，沒辦法勢比人強，現在己經不是當初巫妖稱霸天地的時代了，人族實力已經超過巫族，所以巫族受了委屈也只能忍着。
九鳳回到巫族駐地之後，祝融原本不打算再讓她出去的，巫族的頂級大巫已經沒幾個了，除了后羿就屬九鳳三五個大巫實力最強，而後羿偏偏因爲射殺九隻金烏而被整個妖族惦記，不敢讓后羿離開駐地，生怕被妖族暗害了，九鳳這類大巫在巫族之中更顯珍貴，實在損失不得。只是祝融忽略了女人任性，幾天後的一個夜晚，九鳳違反祝融的禁令，偷偷離開了駐地。
雙翅扇動，九鳳在漆黑的夜空飛翔，腦中想起顓頊醜惡的嘴臉，想起爲救自已而死的兩位大巫，仇恨之火在九鳳胸中燃燒，越燒越旺，縱然傾四海之水也不能將之熄滅，心中狂吼着:我要報仇。九鳳雖然恨意滔天，但還沒有因此失去理智，她明白自己現在去找顓頊絕對會被多寶等人斬殺，而且顓頊身爲人皇，因果牽扯太大，若真的殺了他，一定會給巫族招來大難。在巫族駐地的幾天，九鳳一直思考報仇之事，總算想到了一個辦法，既然不能親自出手，那就從人族內部做手腳，她身爲巫族大巫，有諸多限制，但九黎部落中的人卻沒有，因爲說到底他們也是人族，只要運用好這支人馬，絕對能給顓頊帶來大麻煩，至於之後會怎樣九鳳也顧不得了。
九鳳回到九黎之後，立即招來九黎高層議事，將自己被顓頊算計之事道出，並宣佈與顓頊開戰。九鳳這些年領導九黎發展，深受衆人愛戴，開戰之議一出，立刻引起整個九黎的支持，在九鳳的安排下，分成十幾支隊伍，借山林地勢之利，頻頻出擊，偷襲人族部落，造成巨大傷亡，整個人族人心惶惶，顓頊幾次派兵圍剿，只是九黎人馬甚是警覺，一發現不對立即撤退進入山林之中，顓頊的兵馬也曾追入山林，只是隨後便就九黎借地利優勢襲擊，損失慘重，吃了幾次敗仗也就不敢追了。
顓頊被九黎弄得萬分頭痛，去找多寶道人救助，卻遭到拒絕，因爲修行之人不能隨便對普通人出手，否則殺戮過重，業力纏身，那就麻煩了。不久之後，顓頊毒害九鳳之事傳了出來，而且特別出明九黎襲擊人族部落乃是爲九鳳報仇，討回公道，如此一來顓頊威望大跌，整個人族都對他不滿起來，質疑他的領導能力，無奈之下，顓頊只得退去人皇之位，在東海金鰲島附近一座仙島隱居，託庇於截教，從此以後潛心修煉，追求仙道。而多寶道人也夠義氣，沒有因爲顓頊失去利用價值而將他置之不理，還專門向通天教之求得一對先天寶劍騰空，畫影送他，另外還有一套功法，可謂仁至義盡。
顓頊被逼退位之後九鳳的怒火消了許多便不再讓人襲擊人族部落，只是仇恨已經結下了，在之後的日子裡，九黎其他人族部落衝不斷，時有爭鬥，彼此傷亡慘重，仇恨越積越多，之後幾位人皇對他毫無辦法，而且因爲顓頊毒害九鳳之事多寶也參與其中，人族開始對截教門下不待見起來，而截教之人也不願忍氣吞聲，紛紛返回金鰲島，很長一段時間，人族發展的興盛之勢被打斷，直到堯帝時期才得以改善。
堯出生時霞光萬丈，紫氣瀰漫，其異像立刻被聖人發覺，五聖立刻明白擁有人皇紫氣之人出世了，五聖商議一番之後，決定由接引聖人的弟子藥師道人負責教導堯，受西方教衆生平等教義影響，堯帝一開始就對九黎表現出自已善意，經過努力最終得到九黎認可，與其它人族部落和平共處，自此人族再次進入一個高速發展時期，堯帝也因此威望大增，受人族愛戴。