爲了感謝少年兩次對他的恩情，紅狼決定加入少年的隊伍。少年的隊伍從這一刻開始變成了四人，而這之後四人也被稱爲了最強獵人小隊。
在安頓好妮娜之後，他們又一次的出發了。這一次他們的任務不光是討伐賞金怪物和通緝犯，他們的目標裡面還多了一樣，那就是諾亞的電子軍隊。爲了能夠保證人類的生存環境，或者說是爲了能讓人類苟延殘喘下去，被稱爲最強獵人小隊的四人開始不停的狩獵諾亞的電子軍團。
在這一個月之後，五大要塞終於是徹底鞏固了下來，他們開始派出部隊對諾亞的電子軍團進行清理。甚至他們跟獵人中心總部進行了協商，將這些電子軍團的怪物們也歸類到了賞金怪物裡面，在這之後越來越多的賞金獵人加入了戰鬥，甚至就連一些隱退的獵人們也是陸陸續續再次出現在了這片大陸之上，人類的反抗從那一刻就開始了。
隨後的時間裡，大陸徹底陷入了一片混亂之中，各地都有着不同規模的交戰，而且晝夜不停。看着紛亂的戰火，少年四人略一商量決定再次前往地獄門一探究竟。畢竟那裡是諾亞的老巢，如果他們能夠有機會幹掉諾亞，那麼這一切就都結束了。
時隔多日，少年帶着他的夥伴再次來到了地獄門，只是這一次他們的陣容更加的強大，有了紅狼和他的紅色梅卡瓦的加入，少年覺得他們真的有能力能與諾亞一戰。
那時的地獄門因爲常年戰鬥的原因，周圍早已變的荒無人煙，有的只是最中間那座高聳入雲的高塔，而諾亞就在那其中。
少年一行人在很輕鬆的幹掉了守門的機械守衛之後進入了地獄門，在他們邁入地獄門的剎那，他們就迎來了諾亞的攻擊。高塔上面的炮臺不停的向着他們轟炸着。不過早有準備的少年開啓了s級戰車防護屏障，他們就這樣頂着漫天的炮彈衝到了高塔裡面。
這座高塔裡面曾經有着各國聯合組織的衆多研究人員來控制諾亞，而隨着諾亞的暴走，這裡的所有人逃的逃，散的散，被殺的被殺，留下的只有空蕩蕩的一片。
少年在前來這裡之前就已經調查清楚了，諾亞並不是藏在最高層，而是在最底下的負二層。不過他們卻遇到了難題，通往地下的大門早就被諾亞上了鎖，而開啓大門的四個鎖就需要四個密碼。
少年略一猶豫帶着自己的夥伴們開始一層層的在高塔內部搜索了起來，爲了以防萬一他們還順手除掉了高塔外圍的炮塔和裡面遊蕩的機械守衛
也不知是上天的眷顧還是怎麼，不久後少年一行人就在高塔的內部找到了三組像是密碼一樣的數字。爲了印證自己的猜測，少年帶着同伴回到了大門口開始輸入了密碼，結果就如同少年所想的一樣，大門上的鎖被解開了三個，唯一剩下的一個鎖在他們技師的努力之下也是被破解了開了。他們終於可以前往諾亞的所在了，感受着心中復仇的怒火，少年帶着夥伴們前往了地下一層。
此時的地下一層早就被諾亞放置滿了機械軍團，這導致少年一行人步步艱難，不過這也並沒有阻止少年想要復仇的願望。彈藥打光了就傳真回去補給，然後再次衝到地獄門，再打光了再回去補給，然後再衝到地獄門，少年就用這樣的方法清光了負一層的機械軍團，而這時他們終於是來到了前往負二層的通道口，那下面所在的就是諾亞了。
少年一行人做好了完全的準備之後，前往了底下負二層。而他們也如願以償的在這裡見到了諾亞，這個名爲人類最智能的計算機。
與負一層的荒涼不同，負二層到處都是電子儀器，而最裡面有着一個碩大的平臺，上面有着一個像是巨型眼球一樣的東西，它的旁邊有着無數的電路和小型電子儀器，少年一行人知道，這恐怕就是諾亞了。
少年一行人注意到諾亞的時候，諾亞自然也是早就注意到了他們。諾亞沒有選擇立刻對少年一行人進行攻擊，而是問了他們一個問題。
“人類製造我出來爲的是保護和改善地球的環境，可是不論我怎麼計算都發現，想要改善和保護地球的環境只有一個辦法，那就是除掉人類，人類纔是這一切的罪魁禍首。你們覺得，我做錯了嗎？”
少年聽到這個問題後突然愣住了，他一直覺得自己是爲了保護人類而戰，可是他從沒有思考過諾亞爲何會選擇毀滅人類，或者說他不願意思考，因爲他心裡也知道答案，所以他一直選擇了逃避。可當這個問題真正擺在面前的時候，少年沉默了，因爲他不知道自己該做出怎樣的抉擇。
就在這時，紅狼代替了少年給出了回答，“我不管人類的生死存亡，我要做的就是保護我重要的人，這纔是我來到這裡的目的！”
聽到紅狼的這句話之後，少年也終於是不再猶豫了，因爲他跟紅狼是一樣的想法，人類的生死存亡和人類的劣根性都跟他沒有關係，他要做的就是保護自己重要的人，這纔是他的本心。
於是戰鬥爆發了，諾亞用出了它所有的手段企圖殲滅眼前的這幾個人，可惜它畢竟只是一臺計算機，在它用盡了手段之後，最終還是被少年一行人給摧毀了。
帶着打敗諾亞的成就感和一絲失落感，少年一行人離開了地獄門。在互相道別之後，各自回到了自己的家鄉隱退了起來，紅狼也回到了妮娜的身邊。
不過又過了一個月之後，那名少年帶着技師和女戰士來到了紅狼的家找到了他。因爲他們發現隨着諾亞的消失，大陸上的機械軍團並沒有就此減少，反而還在緩緩增多。於是少年一行人再次離開了家鄉準備前往地獄門，等他們到達地獄門的時候被眼前的一幕驚呆了。地獄門前密密麻麻的守衛着衆多的機械軍團的怪物，而高塔上面的炮塔也全部被修復。
少年一行人愣住了，他們不明白爲何諾亞消失之後這些東西反而增多了。於是少年一行人又一次拼盡全力來到了地下二層，結果他們發現眼前的諾亞竟然完好無損。直到這時他們才得知，原來諾亞竟然還有自我修復功能，而諾亞的核心其實也並不是眼前的這個巨型眼球，而是在更深一層的地下三層。
少年一行人決定這一次要徹底摧毀諾亞，可是這一次他們沒有被上天所眷顧。諾亞早就準備好的機械大軍被它派了出來，面對着爲數衆多的機械大軍，就算是最強的獵人小隊也感到了一些力不從心。無奈之下，他們選擇了撤退，而在撤退之前諾亞告訴了他們一個秘密，“一個月之後，人類就會徹底的消失在這個世界上了！”
聽到諾亞這句毫無感情的聲音，少年一行人感到了一絲恐懼，他們不認爲諾亞會說謊，既然諾亞這麼說自然是已經在做着什麼準備了。爲了查清楚諾亞的手段，少年一行人開始不停的在這片大陸之上探查了起來。最終，他們發現了一絲端倪，原來諾亞爲了毀滅人類，竟然在每個大陸的各個地方埋設了數量衆多的爆炸裝置，而這些裝置如果統一引爆的話，恐怕這片大陸會頃刻間就沉入海底。