打倒了曉的入侵後，並不意味着事情已經完結了，反而有更多的麻煩事正等着木葉。
村子的重建，警備系統的激活，五代目不能執行職責等等一系列的問題，比起打倒佩恩，要麻煩和繁瑣一百倍不止。不過好在這一次佩恩因爲要防備花褚，並沒有將木葉完全摧毀，但也不容樂觀，整個木葉也只有火影大樓那半條街爲界往後的建築還保存完好，其中包括了木葉學校和醫院設施。
“昏迷”的綱手住進了醫院，被最高級別的護衛保護起來，與此同時，暫時接替綱手指揮的花褚下令，除了自來也，花褚，靜音之外，任何人都不得不經申請接近五代目火影。
除此之外，花褚還承擔了更多的工作，比如負責木葉的重建，警戒系統的激活。自己讓綱手避開，但不意味着花褚就輕鬆了。在綱手大人“昏迷”前，曾下令由花褚暫時接過工作，而且是自來也嘴裡說出來，沒有任何人懷疑，可見花褚在木葉的名望和地位已經不容置疑，只是花褚叫苦連天。
把指揮中心設在了木葉醫院，花褚就沒日沒夜的忙起來，只是這段時間沒什麼好消息。
由於木葉遭到破壞，火之國的各種強盜土匪也變得活躍起來，而更多的不知底細的流浪忍者也開始涌向火之國，給火之國的安全隱患增加了不少危機。
好在這些年，花褚也協助了綱手處理過不少事，遇到這些麻煩也不煩，而是一一安排完畢。
重建的總負責人交給了大和，因爲他是目前唯一的會使用木遁的人，警備系統的工作交給了卡卡西這位前暗部總隊長，同時命令在目前空曠的地方大量紮起帳篷，由村子給居民提供救助，同時讓人組織居民進行重建工作，將木葉重建劃分了三十三個區，按照五期依次重建。
於此同時，花褚立即給宇智波止水寫信，讓他立即利用手上的物力人力財力，招募了一大批信得過的能工巧匠以及大批的應急物質迅速送往木葉，同時以黑電惡魔的名義在火之國全境發出通告。在木葉穩定下來的這段時間內，任何敢鬧事的團隊組織，以後黑電惡魔花褚會一一上門拜訪，很快花褚的惡名就顯現出了效果。發出通告後的第四天，各處回報基本安穩下來。
除此之外，花褚還應長老的提議，以暫代火影職責負責人以及花褚個人的身份向火之國大名請求援助。據說火之國大名連信都不看，立即同意撥款八億兩援助木葉重建，讓長老們喜出望外，只有花褚一個人鬱悶。這筆援助，以後是要花褚還回去的，還外搭了一個人情。
“這幫老傢伙，倒是真的會利用一切可以利用的。”當花褚瞭解到長老們附加的救助款的數目之後，花褚都快吐血了，難怪之前問水戶和小春時他們不肯說，只說還在商議。
通過火之國大名的援助，他們不用付出任何代價，後果全是花褚承擔，而且還不欠花褚的人情，難怪一開始花褚說由自己出這筆錢的時候，兩位顧問拒絕了，說這件事應該由村子承擔之類，讓花褚一時間真的以爲這些傢伙在困難面前難得的團結了起來，但沒想到還是再打花褚的主意，而且高明得很。
不過也託了這筆援助款的福，重建工作非常順利，大量的工匠和物質涌入木葉，給木葉的管理帶來了壓力。花褚立即停掉了所有的外出任務，把大量的人手留在村子裡。當有人質疑這樣會有損木葉威信的時候，花褚只說了一句情況有變。
確實是有變，因爲花褚暗中將曉的情報發送了一份給其他四大國的影，隨後雷影要求進行五影會晤的邀請函。按照慣例，在五影會晤期間，會避免出境任務和敏感任務。另外，宇智波止水發回的一條消息也讓花褚很在意，那就是據他佈下的情報網回饋，發現了佐助的蹤跡，而且用最快的速度送到了花褚手裡。花褚經過標註之後發現，佐助一行人的目標地正是木葉的方向。爲了避免外出任務的人員會被明顯毀了約定的佐助遷怒，花褚索性停了所有外出任務。
“但願團藏真的能引走佐助，不然的話，我只有殺了佐助，即使日後他是對抗斑的主要力量也顧不得了。”花褚看着地圖上標註的那條線說道，然後不再理會，投入海量的工作中去了。
有了充足的人力物力財力，加上清晰的指揮，一週以來，木葉的重建熱火朝天的開展了。隨着重建的開始，木葉也逐漸穩定了下來。花褚所做的這一切，在綱手那裡受到了難得的讚賞。
隨着花褚指揮的成效一點點顯露，當初看好戲的人漸漸坐不住了，立即發起了花褚一直都在期待的事情，響應五影會晤，選出六代火影前往。
確實，花褚現在連代理火影都稱不上，但如果花褚真的去了，那就坐實了火影的職責，加上花褚的影響在木葉逐漸擴大，團藏已經坐不住了。
原本他是打算看花褚的笑話。在他看來，一個不滿歲（這裡二十歲成年）的小鬼，絕對收拾不了這攤爛攤子，加上自來也聲明瞭自己的退隱，那麼當花褚束手無策的時候，他團藏就會在這時站出來，取代綱手成爲新的首領，但是花褚的手段讓團藏逐漸發現了自己的想法落空了，卻卻無可奈何，當五影會晤的邀請函送到了長老團之後，團藏敏銳的發現這是他最好出手的機會了。
在商議的前夜，花褚結束了工作，活動着全身痠痛的骨骼和肌肉，走向綱手的病房，一邊抱怨道：“不行了，在這麼幹下去，我得累死不可。”
走進病房裡，只有自來也和綱手在病房裡說話，靜音自然不在。事實上，除了這三人，再出現第四個人綱手都會“失去意識”的躺在病牀上，由自來也照顧綱手。靜音當初提出照顧綱手，但被自來也用各種理由拒絕了，而花褚也趁機交給了靜音一堆工作。
如果靜音守在屋裡，花褚知道綱手一定會瘋的。
“啊，自來也大叔，師傅。你們恢復得怎麼樣？”合上隔音的門，花褚纔開口說道。
“花褚，辛苦你了。”綱手回頭道，“我到底還要這樣持續多久。天天悶在病房裡，我可受不了了。”
“別急綱手。花褚的計劃很成功，而且魚也上鉤了。你在忍耐一下就可以了。”自來也笑道，“正好也趁這段時間好好休息一下。”自來也動了動左臂。
“哎，自來也大叔，你悠着點。你的手纔剛接回去，別亂動。雖然說角都的那些線確實不錯，可是你的身體部位脫離太久了，要是出了問題恢復不了，你就自己想辦法吧。”花褚忙制止道。
“沒錯，自來也。你的手臂至少一個月不能動，否則就會影響恢復的。”綱手嚴肅的說道，同時看向花褚說道：“你的眼睛怎麼樣？”
花褚摸摸右眼的繃帶笑道：“啊。我感覺差不多了。明天就好了。沒想到當初得綁左眼，現在又是右眼，害的我寫輪眼的秘密很快就保不住了。”綱手招了招手，花褚走到牀邊，綱手一隻手放在花褚右眼處，一會之後點頭道：“啊。恢復得挺快的，已經沒事了。至於你的寫輪眼，現在已經能控制自如了，還要不再人面前使用，也不會顯現寫輪眼的特徵，倒是不用太擔心。你把繃帶拆下來我看看。”
花褚立即鬆開了繃帶，綱手仔細看了一下，突然笑道：“這下好了。任何人一看你的眼睛就知道有問題了。一隻黑眼珠，一隻泛着銀色的眼睛。”
“啊。”花褚立即跑到鏡子前看去，立即愁眉苦臉道：“這不是陰陽眼了嗎？長門這下可害苦我了。”
“好了。得了便宜還賣乖。那可是輪迴眼，傳說中最強瞳術的眼睛，你小子還嫌棄什麼！”自來也立即不滿道，要知道，當初他在輪迴眼下課時吃了不少苦頭，險些連命都丟了。
三人閒聊了一會之後，很快就進入了正題。
“明天你打算怎麼做？”綱手問道，事實上無論是花褚在木葉的特殊身份還是現在的職責，明天的商討會都一定有花褚出席。
“對呀，小鬼。我可是聽說了很多長老有意向讓你做代理火影，然後等到綱手醒過來爲止。這次，你可是把團藏逼到了絕境裡了。”自來也也說道。
“啊。不逼他讓他絕望，怎麼讓他跳出來！至於明天，我會只聽不說，然後拒絕選定六代，再同意團藏成爲代理火影，讓他踏上五影會晤的不歸路。”花褚說道，“這樣一來，當初向深作仙人承諾的就能實現了，妙木山和木葉之間的間隙就沒有了。”
“啊。等了這麼久，妙木山都沒有催促我們，但更讓我愧疚。木葉自己出了問題，卻傷害了妙木山，說起來是木葉欠妙木山的。”綱手有些愧疚道，自來也握着綱手的手說道：“別愧疚，我是最瞭解妙木山的，就是出了這樣的事，他們也不會遷怒你的。妙木山的蛤蟆是很講恩義的。”
“無論如何，也決不能讓團藏活着回來了。如果不能按照我們的計劃那樣除掉團藏，花褚，我命令你親自出手，除掉團藏。”綱手一臉殺氣說道。