太極宮眼下紛亂處處。
東宮統領謝淑芳第一時間得知秦王在玄武門起事謀害太子，當下率領兩千東宮侍衛趕往東門，無數侍衛擁擠在宮門前拍門，要求進入。無數手掌拍擊着大門，但是守門的侍衛卻拒絕了謝淑芳進門的要求，並放箭驅逐。
無奈下，謝淑芳率人馬趕到玄武門與北衙禁軍會合一出。
在宮門處，北衙禁軍與兩千東宮侍衛在謝淑芳的率領下猛攻玄武門。
雖城門緊閉，苦無攻城器械，但是數千人馬，想盡各種辦法攀上城牆，玄武門上常何死守在那，掌管着宿衛軍的雲麾將軍敬君弘率數百宿衛前來幫忙，死守玄武門。
謝淑芳見不僅常何，連李淵的心腹敬君弘，都是叛向秦王了不由暗暗心驚。李世民竟是策反了這麼多人幫他。謝淑芳當下對城樓上道：“敬兄，事未見分曉，姑且觀察事態變化，何必急於投靠秦王。”
敬君弘似沒有聽見謝淑芳的勸降一般，繼續死守城池，最後直至戰死。
另一面雍州治中高士廉、右候車騎將軍三水人侯君集，高士廉與其外甥長孫無忌一併，率領長安吏卒將囚犯盡釋，披蓋鎧甲，直接馳至宮門，壯大李世民聲勢。
在宮牆內，裴寂，封德彝，陳叔達，竇誕，顏師古等人卻齊齊跪在李淵面前沒有說話。城牆外，喊殺聲震耳欲聾。
李淵陡然看向陳叔達喝道：“告訴我，這件事是秦王幹得嗎？”
陳叔達跪下緊張地淚道：“回稟陛下，微臣不知，此事與微臣絲毫干係也沒有啊。”
李淵指向陳叔達喝道：“廢物，給朕滾。”
“是，是。”陳叔達垂下頭。
李淵當下道：“李重九大舉入侵是假的。李神通竟是聯合了秦王一起來騙朕，秦王究竟還是聯絡了多少人，這宮裡還有多少人是他的心腹？”
話說到一半。但聽得宮牆之外，一陣歡呼。
一人大喝道：“太子已是服誅。這是太子首級，你們看見了嗎？還不快速速退去！”
聲音一出外週一片喧譁，而李淵頓覺得腳步不穩，差一點摔在地上，左右一併上前攙扶道：“陛下，還請保重龍體。”
李淵爲人攙扶下，坐在椅上，不久一名大將。身披鎧甲，手握染血之長予，率領幾十名侍衛直入宮殿。
衆侍衛一併上前阻攔，但見這名大將將頭盔一摘，遠遠跪下道：“末將侯君集，拜見陛下，吾皇萬歲萬萬歲！”
李淵見了侯君集當下道：“今日作亂之人到底是誰，愛卿何故到此？”
侯君集道：“秦王因爲太子和齊王作亂，起兵誅殺了太子，齊王已是逃至武德殿。秦王殿下擔心驚動陛下。故派臣擔任警衛。”
李淵聽了心底又悲又喜，悲得是李建成被殺，喜的是李元吉還活着。
李淵道：“你告訴秦王。齊王無論犯了多大的罪，都是他的手足，不可以傷害他，你讓秦王來見朕。”
侯君集道：“是的，陛下，眼下太子亂黨正在長安作亂，末將也是奉秦王之命，來請示陛下，下面一步該如何做呢？”
宇文士及先道：“陛下。太子和齊王本來就沒有參與舉義兵反抗隋朝之事，又沒有爲天下立下功勞。他們嫉妒秦王功勞大。威望高，便一起策劃陰謀。現在。秦王已經聲討並誅殺了他們，秦王功蓋宇宙，天下歸心，陛下如果能夠決定立他爲太子，將國家大事委託於他，就不會再生事端了。”
方纔被李淵斥責的陳叔達，這時候站起身來道：“陛下，太子陰狠狡詐，這樣的人如何能爲儲君，秦王寬宏有度，是堯舜之君，懇請陛下立秦王爲太子。”
顏師古也是上前道：“陛下，楊文幹之事，太子已是失德在前，微臣從未聽說過犯下謀逆大罪的儲君，將來還能爲天子的，所以秦王撥亂反正，正是順應民心之舉。”
竇誕也是道：“陛下，眼下趙國大軍壓境，秦王曾兩次擊敗過李重九。李重九忌憚秦王，故而設計一直謀害秦王。但越是如此，我們越是要讓秦王主事，如此大唐的將來纔有救啊。”
李淵聽了目眶泛淚，這些人方纔都不說，但現在卻一個勁地替秦王說好話，衆臣之中只有裴寂，蕭瑀二人沒有出聲。李淵望向他們蕭瑀避開了自己的目光，而裴寂則是搖了搖頭，一言不發。
李淵無奈地道：“諸卿，說的好，傳位給秦王，這正是朕素來的心願啊！”
宇文士及等人聽李淵口頭答允都是大喜，侯君集朗聲道：“懇請陛下下旨，宣佈太子，齊王一黨爲叛逆，由秦王住持一切之事。”
李淵聽了點點頭道：“宇文愛卿，你就替朕擬旨吧！”
片刻之後，宇文士及出閣門出來宣佈敕令，並安撫東宮齊王府侍衛。東宮齊王府侍衛得知不會北追究後，當下四散而走。
與此同時，在太極宮南門，李元吉與數名親信，策馬逃出了太極宮。
他望着身後的宮殿，雙目淚流，他目光閃過方纔一幕，李世民親自騎馬拔箭追殺自己和李建成。
大唐的太子李建成，被他的二弟李世民，一箭射中栽倒在馬下。
李元吉看着自己的兄長，就這樣倒在了塵埃中，口噴鮮血，遠遠地望着自己伸出五指，而李世民策馬從後趕到用馬槊將自己兄長釘在了地上。
後來李世民還要殺自己，但是李元吉逼入樹林中，李世民連射數箭不中，李元吉憑着對武德殿的熟悉，繞過了這裡，得到了齊王府侍衛接應。李世民這才停止追擊，自己逃脫性命。
李元吉心知李建成一死，自己就大事已去，在這一刻他恍如喪家之犬，但一名侍衛提醒道：“殿下，趙國皇帝既是派人送信給殿下，說明對殿下有親近之心，不如改附於趙國，逃往趙地。”
李元吉對侍衛道：“孤與李重九不睦，李重九怎麼可能容孤？”
這侍衛道：“齊王殿下莫非忘了，齊王的姐姐可是李重九皇妃，作爲姐夫的怎麼可能不容殿下呢？在下就是李重九派在齊王殿下身邊之人，反正齊王殿下無處可去，我們的人可以安排，保證齊王平安離開長安。”
李元吉聽了不再猶豫，事實上也如對方所言，現在自己也無處可去，只是他不知這位侍衛，竟是什麼時候成了李重九的內應。
李元吉慘笑道：“只能這樣了，眼下父皇都保不住我性命，也只有趙國皇帝方可了。”
當下李元吉換了衣裝策馬離開了太極宮，但見長安城上人心惶惶。得知李建成斃命後，不少從前方敗退下來的東宮侍衛，齊王府侍衛四面劫掠長安內的商鋪。
長安一片混亂。
李元吉生怕爲人認出只能掩面而走。李元吉最後來到一處偏僻的貨棧裡，別將曹紋見了李元吉，當下好生安撫他一番後，讓李元吉藏身在米船內，神不知鬼不覺地離開了長安，一路上自有人護送輾轉送至幽京。
北海池內，李淵枯坐在大殿上，除了裴寂，蕭瑀二人，其餘大臣早就散在一邊去。他們相互攀談，隱隱還有笑聲傳來。
而李淵此刻一個人沉浸在悲痛之中，而這兩位臣子只能無言地陪着李淵的身邊。夕陽照去，將三人襯托得無比淒涼。
這時候外面鎧甲響動，外周大臣將領都是站起身來，熱情地道：“參見秦王！”
李淵聽了聲音，頓時收斂起悲傷之情，又重新恢復了大唐皇帝的威儀。
但見李世民大步走了進來，他的鎧甲披風很整潔，但可以看出是擦拭過了，上面還有一股血腥味揮之不去。而那沾染血腥是他的兄長李建成身上的。
李世民一見李淵即拜倒在地上道：“父皇，兒臣也是……”
“不必說了，”李淵站起身來將李世民扶起溫和地道，“這幾日來朕差一點有了投杼之惑，竟是質疑自己最親的骨肉。你是朕的好兒子，將來將大唐交給你不會有錯。”
李世民一愣，卻見李淵以好幾年沒有過的溫和語氣對他說話，這一幕好像回到了他十歲時，李淵親自教他騎馬時。李淵也是如此耐心地對李世民一句一句地交待着。
“這大唐是朕一手開創的，征討天下的霸業，也已是進入了第六年，雖天下羣雄大半俯首，但是李重九這頑兇猶在，父皇對他無可奈何，關中貧瘠，國力一天一天的下降，前幾次窮兵黷武，耗盡我大唐的國庫，卻依舊沒有撼動趙國分毫，這一切都是朕的過錯，朕不能用人，不用信人，最後連骨肉至親也棄朕而去。”
“父皇！”聽着李淵的話語，李世民心底的愧疚陡然涌出，淚水滴落，“若非太子逼迫兒臣，兒臣也不會……”
李淵擺了擺手道：“太子與你的對錯，再爭議下去也沒有用了，就算是太子是對了，他現在已是死了，那麼對的也是錯了。而你現在活着，那麼將來的擔子就由你來挑了。過去的事就不要再提了，朕會全力支持你，因爲只有團結，我李唐纔不會被李重九擊敗。你好好安葬太子吧，給羣臣天下一個交代吧，眼下你就是我大唐的天！”