崇禎八年，戰爭的陰雲終於逼近了西藏，黃教與紅教、苯教、白教之爭似乎已經到了決出勝負之時。
頓月多吉此時在康區的世俗權力到達了頂峰，原本對轄區內各教佛教徒寬容的政策開始有了轉變，因爲佛教徒教義不同的而相爭，頓月多吉嚴厲斥責了佛教僧人，尤其是噶瑪丹培的信徒。但這些斥責未導致頓月多吉與佛教的公開決裂。
顧實汗見明廷展現強勢實力，但似乎並沒有介入青海、西藏之爭，最多軍隊出邊境剿匪，與青海、西藏各土司、土王們也沒有太多解除，最多就是邊貿官員之間纔有些來往，想來明廷見這裡地區宗教鬥爭太複雜，想隔岸觀火，或者等鶴蚌相爭，漁翁得利，因此他悄悄的派出了使者前往西寧來見左良玉，想先試探一下明廷的態度。
來使以通商的名義來見西寧地區最高軍事長官的，和碩特部願意跟大明進行貿易來往，左良玉自然表示歡迎，但是他是軍事長官，貿易經濟上的事情不歸他關，自有朝廷工商部下設有茶馬司來管，因此不痛不癢的幾句話就把來使給打發了。
雖然應付的將來使對付過去，但是左良玉這三年來可是一直對青海、西藏以及漠西蒙古各部的動向是異常的關注，雖說不能是瞭如指掌，但基本上各部的動向還是非常清楚的，並且軍情司也在這些地區以行腳商人爲脈絡，建立了一個輻射大西北的情報網絡，黃教班禪羅桑卻告堅贊，前藏哲蚌寺、色拉寺主持派遣心腹喇嘛僧侶與顧實汗之間的密切來往，更是在軍情司的嚴密監控之下，黃教雖然有些實力，在普通百姓中也確實有些號召力，但是西藏掌權的卻是信仰紅教的藏巴汗，仇視黃教，佔據拉薩世俗政權，令黃教在前藏的生存環境越來越艱難，這就迫使的他們不得不向外尋找外援，漠西蒙古部和碩特部顧實汗是黃教的忠實信徒，而且有勇有謀，實力雄厚，好不容易說服顧實汗出兵幫助黃教重新奪回西藏的控制政權，而黃教的這一系列秘密謀劃自然令藏巴汗警覺起來，對黃教的壓迫力度頓時加強了起來，不但看是限制黃教僧侶的自由，而且班禪自己和達賴五世都被秘密的監控起來，又派人去聯合土謝圖汗，請他出兵拉薩，幫助他一舉滅掉黃教。
而這個時候顧實汗也同意當這個黃教護教法王，爲了解實際情況，一方面他先命商使刺探明廷的態度，一面喬裝改扮成朝佛的香客，從新疆途經青海進藏作實地調查，偵知敵情。
土謝圖圖汗之子阿爾斯蘭此時也率領的一萬蒙古騎兵向西藏進發，準備去援助藏巴汗，消滅黃教格魯派。
兩支隊伍驟然相遇，顧實汗雖然身邊就只有一百多名護衛，兩方又都是沒有挑明的對手，顧實汗以朝聖香客的身份覲見了阿爾斯蘭。
阿爾斯蘭也不是笨蛋，一個香客身邊跟着一百多位彪悍的護衛，這是尋常人能擁有的嗎？顧實汗沒有立即表明身份，但阿爾斯蘭卻不敢怠慢，言談之下，甚是歡心，遂邀請顧實汗一道同路去拉薩。
土謝圖汗雖然是喪家之犬，但實力大半猶存，因此率軍馳援察哈爾蒙古部的緣故，與明廷有了點關係，進入青海後，明廷也暗地裡給予不少照顧，讓其得以在青海迅速的站穩腳跟，畢竟這一路勢力還是有收服的可能，後金也是大明的敵人，敵人的敵人就是朋友嘛！
一路上，顧實汗說服阿爾斯蘭不要敵視黃教，阿爾斯蘭畢竟年輕，經受不住顧實汗花言巧語的蠱惑，不知道隨意更改信仰的後果，立刻改變了態度。他還率領的蒙古騎兵聆聽了五世達賴喇嘛阿旺羅桑嘉措的講經說法。
阿爾斯蘭的行爲被噶瑪噶舉派告到土謝圖汗處，土謝圖汗惱怒不已，遂命部將暗殺了阿爾斯蘭。
左良玉將西藏、青海發生的着一系列值得關注的事情都一一寫成詳細的奏摺，上奏給了朝廷。
左良玉的奏摺引起了軍機閣的重視，朱影龍對西藏的重視軍機閣的幾位大臣都是知道了，朝廷遲早有一天會介入西藏的鬥爭的，只是這個時間隨着左良玉的奏摺可能提前了。
不過孫承宗等人還有一個擔憂，那就是大明潛在的大敵後金實力這兩年增長太快，並且還擁有了攻城利器——火炮，雖然威力不能跟大明的比，但已經有了一絲威脅，而且軍力號稱八十萬。
早在努爾哈赤時期，在滿洲八旗中就有16個漢人牛錄。皇太極即位後，天聰三年即崇禎二年正月，將漢人牛錄撥出2000多人，正式成爲一個漢軍旗，命漢官佟養性統轄。天聰五年即崇禎四年五月，皇太極正式將“舊漢兵”定名爲漢軍，以黑旗爲標誌。因當時鑄造火炮者基本是漢人，而使用這些火器、大炮者也基本是漢人，得了毛文龍從凍僵島上裹挾的幾十萬軍民後，皇太極正是將漢軍擴充爲八旗，得步軍十餘萬，加上蒙古軍、朝鮮軍，皇太極這兩年大肆擴軍，共足見四族三十二旗，得軍隊約六十萬餘，對外號稱八十萬，其中後金、蒙古各約二十萬鐵騎，漢軍十二萬，還包括毛文龍手下三萬精銳，水師約三千，朝鮮軍八萬。
有這樣一個強鄰在，而且已經迫不及待的張開獠牙，瘋狂的吞噬着周圍的弱小勢力，壯大着自己的力量，眼見對手一天天強大，朝廷雖然採取了一些列措施抑制後金的步伐，但鞭長莫及，而且朝廷把精力放在了國內，軍費雖然每年都在增長，但防禦有餘，進攻卻不足，朝廷如果這個時候介入西藏的戰爭，能夠迅速平定戰局還好，如果不能迅速解決戰端，而陷入泥潭的話，如果是一拖幾年的話，恐怕東北這一隻惡狼就會再一步強大起來，一旦戰事開啓，恐怕難以兼顧。
“告訴左良玉，讓他維持西藏現狀五年。”朱影龍看了左良玉的奏摺，什麼也沒有說，直接給了軍機閣這麼一個交代。
左良玉接到軍機閣的命令，唯有苦笑，這仗都快要打起來了，還要維持現狀五年，怎麼維持？
裝扮成香客的顧實汗一行平安抵拉薩。達賴贈給顧實汗“丹增卻傑”（意爲持教法王）稱號。顧實汗與五世達賴、四世班禪秘密商議，決定由顧實汗率大軍從新疆前來青海，稱消滅白利土司頓月多吉，繼而進軍西藏消滅第悉藏巴。
阿爾斯蘭被殺後，他手下的一萬蒙古鐵騎部分跟隨顧實汗和碩特部，他們大多是阿爾斯蘭的心腹，就算回去之後，也會被清洗，自然不會傻到回去等這被砍頭，還有一部分是土謝圖汗的部將，這一部分是土謝圖汗的人自留在拉薩，被藏巴汗待爲上賓。
由於左良玉的有些介入，甚至隱晦的告誡土謝圖汗不要介入西藏宗教之爭，土謝圖汗似乎有些悔悟，與頓月多吉和第悉藏巴有了些疏遠，只不過那支被派往拉薩的軍隊也沒有召回，只是保持克制了許多。
加上土謝圖汗親自去西寧拜見了左良玉，得到左良玉的親自接見，這就使得顧實汗有些顧慮，原本打算連土謝圖汗一起滅掉的，形勢逆轉之下，顧實汗不敢輕易出兵，害怕明廷會和土謝圖聯合起來，到時候就非他所能敵。
而左良玉再上書朝廷，讓額璘臣以邁達哩活佛的名義邀請四世班禪和五世達賴訪問青城，額璘臣的背後是大明朝廷，班禪和達賴訪問青城顯然如果沒有大明朝廷的允許是不可能成行的，這一次訪問意義重大，黃教爲此得了一點喘息之機，藏巴汗也不敢在黃教兩位教宗大人出訪之機在背後搞什麼小動作，若是惹起大明來，對頓月多吉和藏巴汗來說都沒有好處，因此西藏地區戰爭的陰雲很快就消散不少，左良玉成功的穩定了西藏地區目前的格局，雙方暫時相安無事。
宗教之間的戰爭是最狂熱，最瘋狂，最沒有理性的戰爭，但是矛盾的是，人活着如果沒有一份信仰，沒有一份追求，那就跟行屍走肉一般，所以西藏問題根本就是一場長期的戰爭，短期的征服只是對肉體的一種消滅，對精神和文化的征服卻是一場持久戰，後金則不同，沒有狂熱的宗教信仰，只是一個十分野蠻的民族，雖然自謗也有千年的傳承，對於一個野蠻的民族，肉體的征服是最直接的，西藏比後金更落後，更野蠻，但是條件跟落後，百姓更愚昧，因此需要更長的時間才梳理，而且更復雜，因此對於西藏，朱影龍決定還是將其放在解決後金皇太極之後來解決。