朝廷之中的暗流，文震孟不可能不知道，但作爲內閣次輔，他必須顧全大局，有些時候就必須讓鄭勳睿忍受委屈了，幾年時間以來，鄭勳睿的所作所爲以及取得的成績是擺在眼前的，文震孟很清楚，鄭勳睿的能力比他強太多，可惜這樣的人才，註定是要遭受打擊的。
浙黨和東林黨之間，已經有聯合的味道，這主要是內閣首輔溫體仁在盡力的拉攏人才，穩固自身的地位，譬如說在洪承疇負責剿滅流寇的事情上面，就是東林黨的提議，得到了溫體仁的贊同，要不然皇上也不會下旨。
不過朝廷之中，東林黨和浙黨之間的鬥爭還是存在的，可一旦牽涉到某個方面的利益，兩方面往往能夠找到一致之處，聯合起來發力，對待鄭勳睿的態度，就是最好的說明。
其實鄭勳睿的能力，溫體仁也是認可的，最關鍵的問題在於，鄭勳睿與東林黨勢不兩立，也不願意攀附浙黨，這就註定在朝廷之中成爲孤獨的一派，遭遇兩方面的打壓，東林黨和浙黨都很清楚，一旦鄭勳睿真正的強大起來，他們都討不到好，所以還不如趁着現在，狠狠的打壓鄭勳睿，讓鄭勳睿在朝廷之中沒有出頭之日。
這是一種很可怕的現象，這種現象的出現，也促使文震孟深思，他以前所奉行的道理是不是正確的，也正是因爲這樣的反思，讓文震孟對鄭勳睿有了更加深刻的認識，鄭勳睿不攀附任何人，更是不願意加入到所謂的東林黨和浙黨之中，這是很難得的選擇。
最讓文震孟寒心的，還是姚希孟的變化，兩人本來是情同手足的關係，可以說是無話不談，可因爲鄭勳睿的事情，兩人之間的關係出現了裂縫，更加零文震孟沒有想到的是，姚希孟竟然加入到對付鄭勳睿的隊伍之中，究其原因，無非是自身的顏面受到了不值得一提的傷害，到了這個時候，文震孟對姚希孟那種迂腐的態度，已經非常不滿了，他甚至認爲，姚希孟當年所謂的和閹黨做鬥爭，是不是也包含有其他的味道。
當初討論讓洪承疇負責剿滅流寇的時候，姚希孟是大力支持的，而且是沒有什麼緣由的支持，可是看看如今的結局，南陽府城被攻陷，曹文詔戰死，三千關寧鐵騎被斬殺，如此慘烈的結局，姚希孟這個時候不說話了。
張溥、楊彝、張採、吳偉業、吳昌時、龔鼎孳等人，都是當年被文震孟看好的，特別是其中的張溥和吳偉業等人，可是看看他們進入到朝廷之中的表現，文震孟唯有感慨自己看錯人了，偌大的年紀，見識還不如鄭勳睿。
出於性格上面的原因，也處於根深蒂固的認識，文震孟不願意和他人爭執，在他內心裡面，還是有着讀書人爲上的認識，不管是浙黨還是東林黨，都是讀書人，既然大家是讀書人，那就要顧及到自身的顏面，至於說和閹黨之間的鬥爭，文震孟是不會客氣的。
內閣討論洪承疇奏摺的時候，文震孟沒有發表什麼意見，他不想讓鄭勳睿撿這個爛攤子，崇禎元年至今，流寇一直肆掠，唯有鄭勳睿出面的時候，徹底壓制了流寇，讓流寇四散而逃，面臨被剿滅的結局，可就是這種大好的局面，卻被朝中別有用心的人利用了。
文震孟認爲，這個時候鄭勳睿不能夠參與到剿滅流寇的事宜之中，這明顯就是渾水，若是鄭勳睿立功了，明顯會遭遇到不少人的嫉恨，若是不能夠徹底剿滅流寇，朝中某些人更是有話說，所以最爲明智的選擇，就是繼續擔任陝西巡撫。
內閣討論完畢，文震孟就給鄭勳睿寫信了，這一次寫信，和以往有很大的不同，他將自身的分析，以及朝廷裡面的諸多情況，全部都寫出來了，如何判斷這些局勢，如何做出選擇，文震孟沒有在信函裡面表露，他相信鄭勳睿自身能夠做出最好的選擇。
文震孟也感覺到了溫體仁的進攻，好幾次在皇上的面前，溫體仁毫不客氣的彈劾了他，只不過皇上沒有聽從，溫體仁在內閣首輔位置上面，接近兩年的時間，勢力慢慢的建立起來，態度和以前也不一樣了，如此情況之下，文震孟不知道自己還能夠在內閣次輔位置上面多長的時間，必須趁着這個機會，將所知道的情況告知鄭勳睿，讓鄭勳睿做好一切的準備。
最爲氣憤的要算是楊廷樞了，他和鄭勳睿之間的關係，誰都是知道的。
出任詹事府少詹事，接近兩年的時間，期間內閣曾經提出建議，讓楊廷樞到南京去主持翰林院的事宜，這個建議被內閣次輔文震孟否決了，這表明不僅僅是有人想着對付鄭勳睿，也想着對付和鄭勳睿關係最好的他了。
剿滅流寇的大好局勢毀於一旦，楊廷樞感覺到憋屈，可惜他無能爲力，退出應社之後，很多的壓力讓他喘不過去來，被提拔和重用的事宜，也看不見苗頭。
這一次，楊廷樞忍不住了，直接給皇上奏摺了，矛頭直接指向了張溥和張採等人，說兩人身爲監察御史，不能夠全面瞭解情況，貿然提出了彈劾奏摺，致使朝廷誤判，導致剿滅流寇的事宜，遭受了巨大的波折。
寫出這個奏摺，表示楊廷樞和張溥、楊彝、張採、龔鼎孳、吳昌時、吳偉業等人的矛盾公開化了，也等於是和東林黨的爭議公開化了。
楊廷樞已經無所謂了，有些時候過於的維護團結的局面，得到的只是打壓，關鍵的時刻必須站出來反擊，鄭勳睿遠在陝西，不好提出來彈劾，那麼他就來做這些事情。
楊廷樞彈劾的奏摺，在朝中引發了共鳴，儘管很多人都知道，讓洪承疇負責徹底剿滅流寇，不是張溥等人能夠決定的，但彈劾奏摺是張溥和張採等人首先提出來的。
一場辯論在早朝的時候展開，楊廷樞義憤填膺，絲毫不顧及張溥等人的顏面，一連串的詰問，讓張溥等人無法自圓其說。
可惜皇上最終還是沒有責罰張溥等人。
但楊廷樞的作爲，爲他贏得了讚譽，這些話有人早就想着說出來了，致仕考慮到實際的問題，沒有說出來罷了。
內閣的意見終於出來了。
皇上的聖旨，讓所有人吃驚。
五省總督洪承疇繼續負責剿滅流寇事宜，延綏巡撫盧象升出任湖廣巡撫，協助洪承疇剿滅流寇，左僉都御史馬士英，兼任延綏巡撫，原河南巡撫王鐸調到南直隸，出任南京右副都御史，詹事府少詹事楊廷樞，敕封左僉都御史，出任河南巡撫，原湖廣巡撫唐世濟，出任都察院右都御史。
這裡面的馬士英和王鐸兩人，無疑是受到責罰的。
馬士英在都察院多年，而且是實際負責都察院事宜的左僉都御史，按說下一步就能夠成爲左右副都御使的，或者是成爲六部的侍郎，如今卻被派遣出任延綏巡撫，這可不是什麼好差事，之所以出現這樣的情況，恐怕是承擔了都察院當初彈劾的失誤。
其次就是王鐸，出任南京都察院右副都御使，表面上看成爲了三品的官員，可實際上就會排斥出核心圈子了，到南京都察院，等同於養老，什麼事情都做不好的，如此的安排王鐸，肯定是牽涉到南陽府城被流寇攻陷的事宜，這等於是王鐸承擔了責任。
至於說唐世濟、盧象升和楊廷樞等人，都是受到提拔或者重用的，唐世紀不用說了，成爲了二品的高官，不如到朝廷核心圈子裡面了，盧象升出任湖廣巡撫，比較之前的延綏巡撫，責任完全不一樣了，至於說楊廷樞，出任河南巡撫，已經是封疆大吏，職責更加重要了。
唯一讓人看不懂的是洪承疇，沒有遭受到任何的責罰，穩如泰山，有人認爲，這可能是洪承疇在剿滅流寇的戰鬥之中，表現很是不錯，戰略部署沒有出現什麼失誤，曹文詔的隕落，責任沒有怪到洪承疇的頭上。
皇上的聖旨，在朝廷之中引發了一些私下裡的議論，但這些議論在很短時間之內就消除了，畢竟私下裡議論這些事情，若是被皇上和內閣知曉了，那是要遭受到責罰的。
楊廷樞到河南省上任之前，文震孟專門找到他了，兩人進行了一次長時間的交談，交談結束之後，走出來的楊廷樞，臉上帶着震驚和恭敬的神情，通過這一次的交談，楊廷樞明白了很多，當然也清楚今後該怎麼做了。
離開京城的那一天，楊廷樞經過了仔細的思考，給鄭勳睿寫去了一份長信，今後他也難以給鄭勳睿說京城裡面的情況了，此次離開京城，短時間可能不要想着能夠回到京城，再說河南處於剿滅流寇的漩渦之中，他上任之後，有很多事情需要處理。
楊廷樞曾經對朝廷沒有要求鄭勳睿再次負責剿滅流寇的事宜，耿耿於懷，可是通過一番交談之後，他才明白其中的道理，也感覺到自身的認識不夠深入，沒有能夠認真分析朝廷如今是什麼局面了。