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漕運如此重大的事宜，孤軍奮戰是不可能有什麼成效的，必須要有官府和百姓的配合，此次漕運任務的順利完成，得益於鄭家軍的強悍，可是這樣的情形只是暫時的，鄭家軍不可能長時間從事漕運事宜，鄭家軍有自身的任務，不斷髮展強大才是其目前該做的事情。
早在動手之前，鄭勳睿就有着深遠的計劃，第一步是嚴懲作惡多端的官吏，以及漕幫，在此基礎上樹立起來漕運總督府的威望，但也要維持地方官府的正常運轉，應該說這一步的目的基本達到了，被鄭勳睿訓斥的近五百官吏回到地方之後，變得格外的老實，老老實實做事情，再也不敢打漕糧的主意，對於漕運總督府下達的文書以及告示，都是不折不扣的執行，這些官吏也維持了地方官府正常的運轉，讓各地慢慢平靜下來。
第二步就是官吏必須配備到位了。
漕運總督府六房的司吏、典吏以及承差，幾乎都更換了，文坤成爲了正八品的知事，統管六房，當然在重大的事情方面，文坤還是要及時給鄭勳睿稟報的，而且在處理日常事物的時候，也是充分尊重徐望華的意見建議。
但這僅僅是開始，地方官吏的配備，以及衛漕兵丁的調整，同樣要着手進行，畢竟漕運牽涉到方方面面，而且僅僅是官府的動作，也是不行的，既然打掉了漕幫，那就應該有相應的地方組織來協調漕運的相關事宜，畢竟官府的官吏對漕運不可能特別的熟悉。俗話說得好，隔行如隔山，大明的官吏，對商賈事宜都不是特別的熟悉，這是因爲體制緣故造成的，短時間之內也不可能改變。如此的情況之下，就必須有民間組織出面來協調漕運的事宜。
這第二步是整治是否能夠成功的關鍵。
所以鄭勳睿的絕大部分精力，都放到這上面了，他的計劃是很深遠的。
漕運並非最爲重要的事宜，說起來就是利用京杭大運河貫穿南北的物資交流，這個任務並不是很複雜，無非是掌管此事的官吏，以及民間的某些協調組織，產生了邪念。加之這裡面有東林黨人插手了，讓漕運變得異常的複雜，也變得黑幕重重，一旦斬斷了其中的利益鏈條，漕運就能夠變得簡單了。
鄭勳睿的主要精力，還是在鄭家軍的建設方面。
此次端掉了十大漕幫，順帶也清除了一些名不見經傳的小漕幫，鄭家軍繳獲了三千萬兩白銀。這些銀子可以做大事情了，同時鄭勳睿和鄭家軍都來到了南方。淮安靠近南京，鄭勳睿計劃的壯大鄭家軍實力、潛心研發火器的計劃，可以開始考慮和實施了。
讓鄭家軍成爲一支無堅不摧的軍隊，這纔是鄭勳睿最爲要緊的事情。
相關的奏摺早就送到京城去了，不過皇上的聖旨和吏部的敕書遲遲沒有下來，鄭勳睿也不好催促。這期間他接到了楊廷樞的來信，楊廷樞仔細說了京城裡面的波動，說到朝野對淮安發生的事情，還是有着很多議論的，但是皇上沒有專門提及此事。早朝也沒有議論這件事情，幾個押解到京城的知府，關在大理寺的監牢裡面，暫時也沒有人理睬。
京城裡面如此平靜的局面，應該是在鄭勳睿的預料之中的，他早就做過前期的準備事宜，寫了好幾封信，穩住了某些人的情緒，要不然出現這麼大的事情，京城裡面豈不是炸鍋了。
聖旨和敕書遲遲不下來，鄭勳睿想到了東林黨人。
淮安的動作，應該是威脅到東林黨人的根基了，且不說京城，就說南方，東林黨人引以爲豪的黃道周都親自出面了，可見東林黨人是察覺到了危險的，只不過沒有地方着手。
當然鄭勳睿有着絕對的信心，這一次的動作，迅雷不及掩耳，東林黨人不可能做出很好的準備，也想不到其他的辦法來應對，不僅僅是這樣，一旦做好了第一步和第二步的所有事宜，接下來鄭勳睿就要開始對準南方的那些士大夫和商賈了。
所以鄭勳睿不着急，耐心等待皇上的聖旨或者是吏部的敕書。
十一月初一，吏部的敕書終於到了。
史可法出任巡漕參政，馬士英出任督催參政，粟建成出任押運參政，三人的品階皆爲從三品。
樑興力出任巡漕御史，趙單羽出任督催御史，兩人的品階皆爲正七品。
曹馳出任巡漕主事，顧夢麟出任倉場主事，文坤出任漕運總督府知事，三人的品階皆爲正八品。
馬祝葵出任淮安府知府，羅昌洛出任揚州府知府，李長順出任廬州府知府，黃輝旭出任鳳陽府知府，馬代坤出任徐州知州，李攀龍出任山陰縣知縣。
鄭錦宏兼任衛漕都指揮使。
史可法原爲西安府知府，馬士英原位延綏巡撫，粟建成原爲秦王府長史司長史，其中的史可法和馬士英，是鄭勳睿早就想着帶到淮安的，至於說粟建成，那是他與秦王朱存樞之間的秘密協定，團結一切可以團結的力量，這是鄭勳睿的風格。
樑興力和趙單羽，兩人以前分別是溧水縣主薄和句容縣主薄，正八品，這次調整爲巡漕御史和督催御史，成爲正七品的官員，連升兩級。
曹馳和顧夢麟，以前就是陝西巡撫衙門的知事，此次跟隨到淮安來，出任巡漕主事和倉場主事，表面上看還是正八品，但職責完全不一樣了，特別是顧夢麟，要知道漕運的倉儲事宜，都是倉場主事直接管轄的，官雖然不大，權力不小。
馬祝葵、羅昌洛、李長順、黃輝旭、馬代坤和李攀龍等人，都是鄭勳睿擔任延綏巡撫時候的得力干將，此次全部抽調到淮安來，幫助鄭勳睿掌控四府三州。
如此的做法，讓鄭勳睿有些愧對文震亨，畢竟這一次的抽調，讓文震亨失去了不少得力的干將，不過早在這之前，鄭勳睿就給文震亨寫信說明情況了，相比較來說，淮北的地位遠遠要比陝西重要。
如此調整之後，鄭勳睿牢牢掌控了漕運的所有事宜，漕運最爲關鍵的幾個環節，分別是巡漕、督催、押運和倉儲，這些位置上面，悉數都是鄭勳睿的心腹，再說四府三州，最爲關鍵的四府，新任知府全部都是鄭勳睿信任的官員，三州之中，徐州的位置最爲重要。
至於說山陰縣，其重要性更是不言而喻，乃是漕運總督府衙所在地，也是漕運碼頭所在地，這裡的知縣，必須是鄭勳睿的心腹。
此外大調整的就是鄭家軍。
鄭錦宏以鄭家軍總兵的身份，兼任衛漕都指揮使，管控衛漕兵丁，楊賀、劉澤清、洪欣濤、洪欣貴、洪欣瑜、王允成出任鄭家軍副總兵，其中楊賀主管鄭家軍日常訓練，協助鄭錦宏做好軍士招募事宜，側重於管理斥候營，劉澤清主管鄭家軍後勤供給，側重於管轄騎兵營，洪欣濤駐紮在陝西，負責與草原部落互市的事宜，洪欣貴主管騎兵營，洪欣瑜主管親兵營，王允成主管步卒。
蘇從軍、蘇蠻子和王小二等人，皆升任鄭家軍參將。
鄭凱濤出任鄭家軍遊擊將軍。
可以說，此次吏部和兵部的敕書，讓鄭勳睿獲得了完勝，他充分把握住了一切的機會，已經牢牢掌控了整個的淮北以及漕運事宜，而且通過這次的機會，加強了鄭家軍的建設。
可不要小看這樣的調整，他爲鄭勳睿日後的發展，奠定了堅實發的基礎。
播得秋風，纔有夜雨，這是鄭勳睿辛苦運作的結局。
張鳳翼能夠出任內閣次輔，楊一鵬能夠成爲內閣輔臣，這裡面都有鄭勳睿的功勞，與內閣首輔溫體仁之間，鄭勳睿也是很注意關係的，更加重要的是，鄭勳睿與秉筆太監高起潛的關係很是融洽，這是不容小覷的關係，讓鄭勳睿能夠在皇上心目中留下好的印象。
鄭勳睿很明白，距離他羽翼豐滿還有一段時間，但架子已經搭起來了，接下來就看下一步該如何的努力了，淮北乃是大明最爲富庶的地方之一，鄭家軍在這裡立足，能夠得到充足的補給，有了銀子，才能夠大規模的發展和建設鄭家軍，一旦鄭家軍具有了不俗的規模，那麼他就可以徹底決定自身的命運了。
當然，後面的路還很是艱辛，從北方傳來的消息，以及文震亨的來信，鄭勳睿得知了，逃離四川的李自成和張獻忠等人，再次開始在山西、河南以及湖廣一帶活動了，而且規模還不小，至於說後金韃子，遭遇上次的敗績之後，絕不會善罷甘休的，短時間的休整之後，肯定會有大動作，畢竟皇太極掏出了一千多萬兩白銀，這不是小數目，對於後金會有着很大的影響，皇太極急切期盼得到彌補。
敕書宣佈之後，鄭勳睿有了一直豪邁的心思，他感覺到面前的道路突然變得寬闊了，今後的選擇也更多了，是繼續維持大明王朝的統治，忠於皇上，還是另立爐竈，重頭再來，讓大明王朝興旺發達，屹立世界之巔，變成了比較現實的問題了。