徐樹錚抵庫倫後立即發現，陳毅處理外蒙撤治案時根本未抓到要領，向上彙報情況也信口開河。
他於一九一九年十一月十一日給北京政.府的電報就直率地指出：“陳使言過其實，急切功名，而心思不能沉細；自覺明於萬里，其實蔽於目前。其人真實何如，樹錚不敢斷言，惟心目中見爲如此，故實不敢盡情信任……”
所謂將在外，國務院雖有明確指示，不許他過問矇事，似乎他的責任只是戍邊。他根本不理會國務院的意見，自行把外蒙撤治案抓到自己手裡。因爲他已看清楚，把此事交給糊塗蟲陳毅只能是誤國誤民。
十三日他給北京政.府的電報中便明白說出他的決定：“……然敢斷言，經年累月，亦非渠（陳）所能了。蓋渠判事不切，物慾蔽之，初步已蹈荊棘，糾纏不清，此時若樹錚撒手不管，則立即中止耳。如此中止，聽取國家損威失重，非樹錚所忍出也。……鈞電志在撤治，請坐待撤治可也。前電言定否只在三五日內，現佈置已定，不煩一兵一矢，一發而中，幸之幸也。發而不中，樹錚箝口結舌，息影南歸，靜俟陳使辦結之日，敬領溺職之罪耳。”
在這期間，他不只是強奪了陳毅的交涉權，同時他也對外蒙統治者哲布尊丹巴發動攻勢。
他給北京政.府的電報敘述各情甚詳：“昨晚活佛派人請燕，伊柬不如禮，當經拒出。另派蒙總理兼內務長巴特瑪王來請，亦經嚴詞面數活佛之非，婉詞深慰巴王之老而多勞，並告以活佛多病，死期不遠，囑其爲黃教自愛，渠深領感而去。然其人頗具邱壑，亦頗諳外邦情勢，撤治事，多向此人身上加工，定可得手。語之陳使，極以爲然。陳使即囑向喇嘛一派示威，樹錚言邊事與兵事通，不外恩威並用四字，而用恩用威，先後彼此，頗費斟酌。
“以撫蒙而論，蒙性多猜，威則不易近，故必先恩以結之：恐其久而易視也，然後威以折之。蒙無實力，必悚而就範；再待以恩，以結其心，則不思勾結外援，乃永無反側矣。武侯擒縱遺法，可師其意，而稍變通之，以策久遠，非僅今日計也，陳使亦以爲然。此非空言所能了，必時時留意，事事經心，乃得緩緩入手耳。樹錚能否自行其言，仍盼廟算樞謀，隨時督誨，俾獲成效。謹用陳明，伏祈核察。制樹錚。元（十三）”
徐樹錚使出他的混身解數，給“總理”兼內務長巴特瑪多爾濟施加壓力。
據十一月十四日他給北京政.府的電報中詳載：“活佛前最重要者四人，一總理兼內務長巴特瑪多爾濟，一大沙畢商卓特巴，一繃楚克，一棍布，均最高之喇嘛，活佛惟其所左右，王公皆側目而視。王公之贊允撤治，名爲情殷內向，實與喇嘛爭權，事成權歸王公，政.府無大便利。陳使前擬六十三條，雖不適用，確曾煞費經營，而喇嘛從中牽掣，活佛雖大開會議，皆喇嘛令王公分謗之策。蓋會議時，活佛並不質詢可否，但問汝輩不以爲然耶！則王公什人而九高聲應諾而散會矣。陳使雖欲速定，而明知喇嘛爲祟，無術制之。又過聽王公之請，益忤喇嘛不敢相近，牽掣愈力。此樹錚所謂‘聽信陳使自辦，即經年累月亦不得定’也。
“樹錚察知此情，擒賊應先擒王，王公可暫從冷淡，一意向喇嘛市好，俾知依附，然後濟以恩威，期遂吾計。本意與陳使協同妥辦，奈每與晤談，稍及喇嘛，渠即苦口向樹錚代王公求情，一若樹錚與王公有深仇大恨不能相容也者，故前電有‘不敢盡情信任’之說也。自嚴諭岱青王繃楚克後，迭向喇嘛中人日加灌溉。又深知巴特瑪因前充商卓特巴爲活佛所奪，又年輕者皆封親王，而伊只有王銜，心中亦多不平。且現任總理，手執政柄，其人又頗諳外事，可諭以利害，故專意結之以信，感之以情。每於大議場中，當衆極與謙下，尊以老輩，譽以清操，諷以活佛多病，可接其任。看操之日，示以軍規之嚴，軍容之肅，兵士放假觀劇，苦樂與共，俱知軍心之固，期可入我彀中。
“連攜與談，皆謂現公與喇嘛相持不下，非黃教之福，宜勸活佛立功自固，勿久執迷。其實活佛應否，全惟此四人是視。而四人之中，巴年最長，位最高，活佛信任較薄，故屬其盡力以自託於中央，樹錚亦許以全力相輔，巴甚感戴。數往謁佛，往來三數日，佛仍推宕不應，託詞非待會議，既聲言外交有關。昨晚遂與勒限，謂外交有中央政.府在，會議無可待，活佛向來辦事不待會議，今不能獨待，我只責求活佛與執事兩人意見，他有異言，我自當之。執事如此高年，不憚奔走，以謀黃教之安，而活佛罪惡已極，尚不肯發一言，徒令喇嘛假威福以禍王公，王公不平即久，必思報復，爭亂相尋，則黃教已矣！黃教去，蒙古必如散沙，則外蒙已矣！是執事有愛外蒙愛黃教之心，而活佛持之以釀亂也。
“外蒙爲國家領土，我爲外蒙長官，有彈壓地面之責，不能坐視。請往告活佛，明日速應則已，不應當即拿解入京，聽政.府發落。巴又稍以俄人及蒙兵爲言，意在謂如是必致驚恐地方。樹錚謂即有驚恐，是昏佛使然，非我之咎。然執事至此，尚爲此言，意令傾佩，真黃教之主也。渠許再往面佛力勸，更略談其不平之事。樹錚許以事定後，王銜立可冊真，並其弟皆與雙俸。渠更約明晚再見。今晨獨坐默唸，萬一佛再不應，安能經行拿解？當即坐罪彼四人，責以不能善輔活佛，姑作拘禁之狀以恐之，再圖別策，庶剛柔相濟，而不損國家之威。
“正自籌酌，巴忽匆匆而來，握手告語云：昨晚別後，連夜面佛，痛陳利害，繼之以泣，佛感悟，遂允撤治。惟言陳使偏袒王公，所擬條件，決不願用。又前三音諾顏之死，佛之野子襲封，出自陳使指使，而彼今輒舉之以爲佛罪。加汗增入京，佛曾專函令謁大總統，請撤換陳使，故今日之事，佛不願其與聞，亦不願他喇嘛王公預其事，但由樹錚與彼換交商定條件，具呈政.府可矣等語，並縷舉活佛懇代維持往事數件。樹錚以機不可失，遂許以今夜偕其謁佛面商，決不令佛有失體面，或喇嘛王公有何不均。巴稱謝而去。臨行又堅請守密，深盼定後再告他人云雲。俟議定後，詳電馳報。”
一九一九年十一月十五日是決定關鍵的一天，陳毅和車林交涉了十個多月而終歸破裂的撤治問題，竟在這一天解決了。其間如何急轉直下，可以從徐樹錚給北京政.府的三通電報中看出。
徐電一：“北京西北邊署。○密。抄呈大總統、國務院、段督辦、各部鈞鑒：寒（十四）日到巴特瑪寓所議商條件，因仍爲去喇嘛權利，樹錚堅持欲定條例非簡略不可，詳細辦法可另訂辦事章程，或不定條例，但由佛率衆具請撤治，一切辦法統待另商，或派人隨樹錚入京詳定。渠狡展良久，逼之去謁佛。樹錚尋又嚴詞誥諭，謂禍蒙之罪，不在佛而在喇嘛。寬限一日，夜晚須解決，否則拿解者不止一佛，執事雖老，亦當隨行。渠情狀極畏懼，大約一二日內，可見定奪矣。制樹錚。刪（十五）”
徐電二：“北京西北邊署。○密。抄呈大總統、國務院、段督辦、各部鈞鑒：刪電計達，今日巴特瑪召集喇嘛王公全體會議，議定先由活佛蓋印，率衆具呈自請撤治；一切條件辦法，概從另定。飭人來求，今晚不必再逼，日內定即辦妥。樹錚允以不逼，但仍須從速辦結，由活佛派大員隨樹錚入京，覲謁大總統致賀云云。恐其夜長夢多，故必嚴促其速定也。僅此報呈，伏祈察覈。制樹錚。刪二”
徐電三：“北京西北邊署。○密。抄呈大總統、國務院、段督辦、各部均籤：
刪二陳報蒙員會議情形，並求樹錚今晚不必往逼，系都護派人來告，謂蒙員託其轉達。電發後，有人詢巴特瑪何以會議未散，匆匆先歸？答雲：昨徐公限定晚六時晤面，故早歸待之。樹錚即往晤，始悉所定辦法稍有不同，都護是傳聞之辭。活佛簽名蓋印，向無此例；由官府各部長簽名蓋印，聲敘會議公決，活佛允准，請爲代陳政.府。查清室遜政，亦由太后諭內閣與民國大員交接，並非帝后自須具名。夜郎雖小，帝制自娛，佛不具名，亦於外無嫌，慨然允之，並致昨晚魯莽歉意。其公文旦夕即定也。僅此陳明，伏乞察覈。制樹錚。刪三”
兩天後，外蒙古自治政.府準備了兩份自願取消自治呈文送給都護使和籌邊使，請求代轉呈北京政.府。
外蒙自治政.府請求撤消自治的呈文：“外蒙自前清康熙以來，即隸屬於中國，喁喁向化，二百餘年。上自王公，下至庶民，均各安居無事。自道光年間，變更舊制，有拂蒙情，遂生嫌怨。迨至前清末年，行政官吏穢污，衆心形益怒怨，當斯之時，外人乘隙煽惑，遂肇獨之舉。嗣經協定修約，外蒙自治告成，中國空獲主權之名，而外蒙官府喪失利權。迄今自治數載，未見完全效果，追念既往之事，今人誠有可嘆者也。
“近來俄國內亂無秩，亂黨侵境，俄人既無統一之政.府，自無保護條約之能力，現已不能管轄其屬地，而布里雅特等任意勾結土匪，結黨糾夥，迭次派人到庫，催逼歸從，擬行統一全蒙，獨立爲國，種種煽惑，形甚迫切。攘奪中國宗主權，破壞外蒙自治權，於本外蒙有害無利，本官府洞悉此情。該布匪等以爲我不服從之故，將行出兵侵疆，有恐嚇強從之勢。且唐努烏梁海向系外萱所屬區域，始則俄之白黨，強行侵佔，拒擊我中蒙官軍，繼而紅黨復進，以致無法辦理。
“外蒙人民生計，向來最稱薄弱，財款支絀，無力整頓，槍乏兵弱，極爲困艱。中央政.府雖經擔任種種困難，兼負保護之責，乃振興事業，尚未實行。現值內政外交處於危險已達極點，以故本官府窺知現時情況，召集王公喇嘛等屢開會議，討諭前途利害安危問題，冀期進行。鹹謂近來中蒙感情敦篤，日益親密，嫌怨悉泯，同心同意，計圖人民久安之途，均各情願取消自治，仍復前清舊制。凡於扎薩克之權，仍行直接中央，權限劃一，所有平治內政，防禦外患，均賴中央竭力扶救。當將議決情形，轉報博克多哲布尊丹巴呼圖克圖汗時，業經贊成。
“惟期中國關於外蒙內部權限，均照蒙地情形持平議定，則於將來振興事務及一切規則，並於中央政.府統一權，兩無牴觸，自與蒙情相合，人民萬世慶安。於外族共和，共享幸福，是我外蒙官民共所期禱者也。再前訂中蒙俄三方條約，及俄蒙商務專條，並中俄聲明文件，原爲外蒙自治而訂也，今既自己情願取消自治，前訂條件當然概無效力。其俄人在蒙營商事宜，將來俄新政.府成立後，應由中央政.府負責另行議訂，以篤邦誼而挽利權。”
十一月二十二日，徐世昌豪邁地以大總統身份發佈明令，接受外蒙自治官府的請求。
令雲：“核閱來呈，情詞懇摯，具見博克多哲布尊丹巴呼圖克圖汗及王公喇嘛等，深明五族一家之義，同心愛國，出自至誠。應即俯如所請，以順蒙情。所有外蒙博克多哲布尊丹巴呼圖克圖汗應受之尊崇，與四盟沙畢等應享之利益，一如舊制，中央並當優爲待遇，俾其享共和之福，垂於無窮，本大總統有厚望焉。此令！”
由於徐樹錚超人的才能和靈活的應變能力，當然更是因爲“五萬大軍”的強大威懾力。他僅在庫倫住了二十二天（10月29日到達庫倫，11月21日驅車回京），即成功地使蒙古自動撤銷自治。
當然也有“不識時務”的。對於那些有“反”心的，徐樹錚的策略是請他們“喝茶”，在外蒙古門哥託草原擺下“鴻門宴”，殺一儆百。誰都知道，這小徐殺起人來從來是不眨眼的。
有一支“膽大包天” 軍隊，一開始居然叫囂要與徐樹錚的大軍一戰，這支軍隊，就是外蒙古武裝中的僱傭兵，一支由俄國顧問蛻變成的白俄匪徒。不過，他們只是虛張聲勢，還沒和徐軍交手，就作鳥獸散。
這也就是說，我們那位都護使陳毅，用了那麼多的時間，花費了那麼大的努力，沒有辦成的事。徐樹錚僅用了二十二天，不但把事情辦成，而且結果要好得不知要強多少倍。
人們不能不驚歎這位小徐的雄才大略，無論如何，這是個不可多得的人才，不管幹什麼都能幹出名堂。所謂不能流芳萬世，也必能遺臭萬年。像徐這樣的人，如果能把他的才智，用在幹好事上，譬如此次治理蒙務，實是國家民族之幸。當然，這樣的人幹起壞事來，也更可怕。
徐樹錚這一次的愛國之舉，得到報界高度稱讚，稱他爲“中國決心要不惜一切代價保衛外蒙失土的兩個愛國者”之一（另一人是孫中山）。