作爲光復軍曾經的主力，各地方武裝警察部隊依舊是保護和維持安徽地面穩定，防範外敵入侵的基石和核心。爲了能夠維持光復軍軍心穩定，不讓突然從主力野戰軍變成地方守備部隊的失落情緒影響軍心士氣，除了因爲表現優異而被抽調加入種子部隊的戰士們之外，王進並沒有對原光復軍各部進行過大的調整，只是爲了需要做出一小部分改進而已。
武裝警察部隊每一個分區都有一個總隊（旅級），下轄三個分隊（乙種團級）。每個支隊下轄三個步兵營；山炮、機炮、通信、特務各一連；工程、輜重、衛生各一排，暫編2500人，清一色漢陽造仿毛瑟1989式步槍，這樣的裝備水平在國內算得上非常的精銳。
經過軍事擴大會議和新光復會核心會議討論決定，整個新光復會控制區域分爲五大塊二小塊七大軍分區，包括皖東、皖南、皖北、皖西、皖中五大核心軍分區，還有淮上和鄂西兩大特別軍分區，由之前的獨立旅七大旅長分別兼任七大軍分區司令一職。
七大軍分區之下，先暫編十七個武警支隊，即：安慶武警部隊、徽州武警部隊、寧國武警部隊、池州武警部隊、阜陽武警部隊、六安武警部隊、宿州武警部隊、滁州武警部隊、合肥武警部隊、蚌埠武警部隊、毫州武警部隊、壽州武警部隊、廣德武警部隊、和縣武警部隊、泗縣武警部隊、英縣武警部隊還有淮上武警部隊。
這些分散在不同地區的武裝警察部隊，按照地區情況的不同擁有一個到兩個乙種團不等的編制人數。爲了徹底掌握武警部隊的控制權，軍政部規定各軍分區司令三年任滿必須換崗，除非有戰事需要不得在一地連任兩屆。
這只是限制高級軍官手中權力的招數，在針對普通士兵的掌控方面，除了繼續加強思想道德和文化教育之外，軍政府還特別在安慶、合肥、壽州、蕪湖和貴池等五地建設新兵集訓基地，凡是武警部隊官兵每隔一段時間都必須在五大集訓基地輪流進行整編訓練。
而作爲光復軍的模範部隊，安徽按照北京方面的要求新近成立的安徽新軍第一、二師和安徽獨立旅，這三支部隊超過三萬精銳，是光復軍戰力當中真正的精華所在，王進是一定要牢牢掌握在自己手中的。爲此他根本就不在乎外界對他‘任人唯親’的批評，也要將師長和旅長之位交給王單南、王單北還有王單西三位親信心腹。
至於王單東，由於之前他在治理地方和帶兵練兵上面表現出了不錯的才華，王進乾脆就將安徽武裝警察部隊總參謀長一職讓他來坐，主要負責各軍分區武裝警察的管理訓練和督察等等日常事務，幫助王總司令牢牢掌握住武裝警察部隊的控制權！
與兵制整編相呼應的，光復軍後勤部，裝備部等等關係密切的軍事部門也紛紛跟着做出相應的調整出來。總之就是一句話，光復軍整編事宜千頭萬緒，隨之牽動的各方面利益關係和麻煩不計其數，整個軍政府忙得不可開交一地雞毛。
雖然光復軍的整編事宜麻煩異常，而且其中之花費也是驚人得很，但爲了光復軍的整體戰鬥力能夠快速提升，加強新光復會以後在國內事務中的影響力和競爭力，甚至更進一步的發言權，必要的損失和浪費真的很難避免。
以王進爲首的安徽軍政府和明白這一點，所以並沒有在這方面縮手縮腳吝嗇小氣。有時候軍政府的資金週轉不靈之時，王進還會從自家腰包裡掏出白花花的大洋，以借貸的方式借給軍政府暫時度過難關。所以安徽就給了外人一個非常有錢的印象，沒見他們在大力整編部隊發展軍備的同時，也沒有影響境內經濟發展的速度嗎？
對此，一些眼紅的傢伙們除了羨慕嫉妒恨之外，就只能拼命的詆譭安徽軍政府。說什麼怪話的人都有，最常見的就是大罵安徽王進已經投靠了袁世凱，是革命黨中的罪人和叛徒。更惡毒一點的直接向孫中山先生打小報告，希望中山先生能夠親自出面給安徽放一放血……
當然除了那幫眼紅之輩上不得檯面的小手段之外，那些和王進交好或者自詡資格老的老革命們，最近一段時間來往安徽更爲頻繁。不用多說，他們的目的就是向王進和安徽軍政府打秋風。隨着北京袁世凱對於臨時政府人事權和財權掌握得越來越緊，南方各省革命黨中已很有一些人的日子快活不下去。留給他們的選擇真的已經不多，要麼得到安徽軍政府這樣大財主的資助，要麼解散部隊回家養老，要麼就是積極投靠北京袁世凱……
對於外界的紛紛擾擾，王進沒有太過放在心上。嘴長在別人身上，他們愛怎麼說就怎麼說。在忙完了光復軍整編最初一段忙碌的日子之後，他的生活一下子變得輕鬆起來。平時只需要把握好安徽政局的大方向不出問題，沒事的時候帶着一票閒得蛋疼的諮議局議員們四下走訪查探，看到不平之事就伸手管一管日子倒也過得清閒自在。
閒來無事的時候，他最喜歡做的事情就是陪着妻子和孩子，出出遊讀讀書認認字，一家人團團美美溫馨無限。也許是在外混跡的日子實在太長，心中對家人有一絲愧疚也很眷念家的感覺，也許是因爲他穿越而來對於這個世界總有一絲不自然的陌生感，需要家人的溫暖和關懷，總之他現在在家的日子過得真不賴。
可惜這個時代太混亂，平靜沒有勾心鬥角的生活離王進這廝太過遙遠。他在合肥家裡整整的窩了兩個來月，直到1912年4月中旬，他終於被北京來的一封密電驚動，不得不從溫馨的家裡脫身處理這份突如其來的‘國事’……