拿破崙在和約簽署之後，馬上開始制定針對明軍的計劃。早已開始注意明軍的拿破崙，已經搞清楚了明軍現在的情況，可以說是十分強大，佔盡了優勢，北面的波羅的海，南面的地中海，西面的大西洋都是明軍的勢力範圍，歐洲在戰略上實際上已經被明軍包圍了，對拿破崙來說，可以說這樣的起點很是糟糕。但是拿破崙畢竟是拿破崙，經過一番研究，拿破崙已經做好了反擊的計劃。在拿破崙看來明軍現有的軍事存在，可以說是以海軍爲首的，所以當下要做的事情，首先就是要消滅明軍的海軍，尤其是波羅的海和地中海的艦隊，至於大西洋艦隊，拿破崙認爲明軍的大西洋艦隊雖然在針對歐洲的艦隊中最爲強大，但是遠不及地中海艦隊和波羅的海的艦隊威脅大，因爲大西洋艦隊如果想要攻擊歐洲就必須要從海峽發起攻擊，但是整個歐洲的西海岸，北面是荷蘭，中間是法蘭西，南面則是葡萄牙和西班牙，這些國家都有不弱的艦隊，就算明軍大西洋艦隊要攻擊歐洲，也要先擊破這些艦隊，而這些國家的艦隊都是歷史悠久的海上老牌強國，不是明軍一天就可以擊破的。而波羅的海和地中海的艦隊就不一樣了。
拿破崙認爲明軍的波羅的海艦隊簡直就是懸在歐洲腦袋上鍘刀，明軍的地中海艦隊則是歐洲腳下的一顆炸彈，對於明軍佔領伊斯坦布爾，拿破崙對件事是如鯁在喉，明軍攻佔伊斯坦布爾，就等於是打開了從東面進攻歐洲的大門，地中海艦隊可以隨時從歐洲的南部進行攻擊，那裡正是歐洲最柔軟的地地方，所以拿破崙計劃中的攻擊最先從這兩個地方攻擊。波羅的海和地中海的攻擊是海上的，作爲歐洲第一章一陸軍強國，法國不可能不在陸地上作出反擊的部署。陸軍的反擊部署，拿破崙決定從斯坦布爾開始攻擊，只要攻下了伊斯坦布爾，明軍在東面針對歐洲的陣線就要後退到中亞。與此同時，北歐的瑞典也集中兵力開始向俄羅斯境內發動攻擊。另外神聖羅馬帝國和波蘭也將兩國的陸軍集結起來向烏克蘭方向的俄羅斯推進。南面的陸軍反擊則是重點，由法軍和奧匈帝國合力完成，因爲這裡要奪取土耳其的重鎮——伊斯坦布爾。
在制定好反擊的戰略之後，拿破崙馬上開始了制定對具體的每一個方向的反擊計劃。首先就是明軍的波羅的海艦隊。明軍在攻佔了波羅的海的俄羅斯方向的各個炮臺堡壘之後，就利用俄羅斯在這裡以前的基礎，建立大明的波羅的海艦隊。經過幾年的建設，波羅的海艦隊已經擁有了七百多艘戰船，大部分停泊在聖彼得堡芬蘭灣的塔林和赫爾辛基，近幾年來，明軍的攻勢集中在南面，對這裡並沒有太多的安排，所以這裡的艦隊大多時候都在訓練，沒事就在波羅的海巡視一番，來顯示自己的存在，但是除了瑞典沒有事的時候，小小的被挑釁一下，基本上沒有什麼事。
爲了抽調人員組建大西洋艦隊和地中海艦隊，明軍從這裡抽掉了不少人員，以至於波羅的海現在的水士素質普遍不高，大多是老弱殘兵。爲了對波羅的海的明軍艦隊進行消滅，拿破崙制定了一個偷襲計劃：由一個商人向俄羅斯最西面的那個在明軍控制之下的所謂的共和國提出要在俄羅斯採購一大批的毛皮，由於數量巨大，要用海運的方式運輸，要帶一百多條前來裝載，爲了不引起誤會，事先照會明軍的波羅的海艦隊，以免引起誤會.請明軍給予放行，已進入芬蘭灣進行交易，明軍對於這種事情一定不會有什麼戒心，這個時候就派船出擊，都是僞裝成商船的戰船，出發以前先以商船的速度行駛，當到達中線之後，突然加速，在一天之內趕到塔林和赫爾辛基，對明軍的波羅的海艦隊發動偷襲，爭取一舉消滅明軍的波羅的海艦隊.
關於地中海的方向，拿破崙打算使用雙管齊下的方法：水陸並進！在海上集中法蘭西的南部艦隊，意大利的艦隊，還有奧匈帝國的艦隊，三支艦隊合力嚮明軍的地中海艦隊實施攻擊，但是與波羅的海不同的是，地中海上的反擊要在大白天光明正大的進行：由三國聯合嚮明軍提出訪問埃及的計劃，並有意向埃及的大明商人採購一大批的大明奢侈品，作爲回去饋贈的禮品。當三國艦隊行進到大明地中海艦隊的駐紮地時，突然發起進攻，以極大的突然性對其發動攻擊，一定能將其消滅在亞歷山大和塞得港的明軍地中海艦隊。一旦擊破了明軍的艦隊，就馬上向埃及展開登陸。埃及作爲針對歐洲的商品集散地，並沒有太多的軍隊，如果可以攻下埃及，那可就意義重大了，足可以使明軍的戰線後退上千裡。除了這些，拿破崙還沒有忘記一件事情，那就是命令葡萄牙和西班牙必須將直布羅陀海峽封死，在消滅明軍的地中海艦隊之前，不許一條船進來。這樣做的目的就是要截斷大明水師大西洋艦隊和地中海艦隊的聯繫，好各個突破.
至於歐洲的西海岸，拿破崙則打算以防守爲主，但也是進攻性的防守，南部由西班牙和葡萄牙的聯合艦隊對大明水師進行攻擊，法國艦隊則在中部進行策應，以兩國兵力合力對明軍艦隊進行攻擊，勝則繼續攻擊，明軍集中大部隊緊急的時候，則退回港口和岸炮一起防禦，等明軍攻擊乏力或者天黑之後在進行攻擊，用這種方法將明軍艦隊吸引到歐洲沿岸形成膠着戰，拖住明軍。這個時候，由荷蘭的艦隊爲主的北歐艦隊，則由荷蘭開始南下，穿過英吉利海峽對正在歐洲西海岸進行攻擊的明軍艦隊進行包圍，這樣就形成了一個海上夾擊的狀況，這樣就算不能夠全部消滅明軍的大西洋艦隊也能夠重創大明的大西洋艦隊，明軍的大西洋艦隊一旦被重創或者擊敗，馬上就聯合三國艦隊向美洲發動進攻，從明軍手中奪回美洲的殖民地。南部的法國，意大利，還有奧匈帝國的艦隊則在擊破明軍地中海艦隊後，全力從三國運兵至土耳其，組成大軍和駐紮在土耳其的明軍遠征軍作戰，盡全力把戰線往東面退。
除了戰術上的安排，還有武器方面的，拿破崙研究了明軍的各次大戰，發現明軍沒有一次不是仰仗其強大的火力優勢取得了勝利，不光是炮兵，單兵武器的火力密度也很大，可以說明軍的巨大勝利主要是仰仗其火力的強大。拿破崙學的就是炮兵，也是靠着在土倫戰役中高超的炮兵指揮而展露頭角的，平時就稱大炮爲炮兵之神，面對明軍這種同樣注重炮兵火力的對手，拿破崙自然將更加重視炮兵的作用。爲了抵消明軍的炮兵優勢，拿破崙下令各國以最快的速度建造火炮，並且迅速在部隊部署，爲了這一點，拿破崙事先聲明，如果那個參戰國的炮兵密度達不到法軍的炮兵火力，那麼戰後將沒有資格分享勝利，意思就是說，如果哪個國家的炮兵達不到要求將不能夠參加對勝利果實的瓜分。各國聽到拿破崙的聲明後，馬上開始部署自己的炮兵，並且盡全力建造火炮，實在不夠就向法國購買，經過一段時間的準備之後，反明歐洲同盟軍算是建立了，拿破崙的反擊計劃也制定好了，現在只剩下調兵遣將進行反擊了，拿破崙給這個攻擊計劃起了一個名字，叫拿破崙計劃！
相對於拿破崙的枕戈待旦，明軍則因爲攻佔了英國而進入了休整期，拿破崙的軍事天才卻在這個時候發動了突然地襲擊，這次襲擊規模遍佈半個世界，明軍淬不及防，遭到了遠征以來最慘重的失敗