按照隆崎的計劃，毀掉了重生島，斷絕了和人類的所有關係之後，接下來隆崎就要去那幾個城市，把當時他們實驗的誕生品清除掉，然後再把他們建立的秘密實驗室也毀掉。等一切都回歸到零的時候，隆崎便可以進入他的新計劃了，就是對活着的人直接對其大腦進行改造。
隆崎來到了特洛伊城找馬誠。對於現在的馬誠來說，隆崎根本就像他的神一樣，不管隆崎叫他做什麼他都會願意做。但是，當隆崎說到：“對不起了，你們不能再繼續存在在這個世界上了……”的時候。馬誠完全失控了，“什麼，你當時給我的設置裡面根本就沒有這條信息啊，我已經按照你的計劃，建立了實驗室，並且已經開始進行實驗了，雖然現在成功的實驗品並不多……”
“因爲你們本來就是不應該出現在這世上的東西，這個我也是在惡魔那裡聽說的。你們的出現擾亂了人與另外的世界的平衡，因爲你們身上沒有靈魂……”
“惡魔？靈魂？你到底在說什麼？我根本無法理解你說的話，你只要告訴我我接下來怎麼做纔是正確的就行了。”
“我必須要糾正我犯下的錯誤啊，你們是我罪惡的產物啊，更可以說是我爲了追求更理想的世界而誕生的失敗品。放心吧，在你們之後，會出現比你們更強大的人類的。其實你們根本就不能算是人類。”隆崎拿起了一根玻璃試管，將一頭敲碎了，然後朝馬誠走了過去，“你知道嗎？你之前就是這樣死的，你在重生之前就是這樣被玻璃割破了喉嚨死掉的。現在麻煩你也像之前那樣消失掉吧。然後你只會死去，你不會去天堂也不會去地獄，因爲你根本就沒有可以去那些地方的靈魂，你根本就只是一具行屍走肉……放心吧，你的實驗室我也會清理掉的……安息吧……”隆崎將試管往馬誠的喉嚨刺了進去……
隆崎將馬誠的屍體處理了一下，整理成了自殺的樣子，甚至利用他的儀器把他死前大腦裡的影像都重新編排了一下。之後，隆崎找到了馬誠的秘密實驗室，他發現進度真的很快，已經在培養那些準備拿來替換的肉體了，隆崎查閱了一下他的實驗資料，發現還沒有成功的案例，隆崎也就不用再去找那些馬誠創造出來的行屍走肉了，他直接毀掉了整個實驗室。因爲他們的實驗室本來就是建造在很隱蔽的地方，所以警方也根本不會發現什麼。最後警方只能發現馬誠的屍體，但是案件會以自殺結案……
當隆崎在馬誠那裡看到實驗進度之後，他迅速地趕到了北星市，因爲他知道，馬誠是他比較早的實驗成功品，他的能力遠遠不如後面才誕生的王芳還有陳武。北星市的王芳說不定會比馬誠的進度快上很多。
到了北星市，隆崎順利的找到了王芳。但是當隆崎看到王芳的作品的時候他大爲震驚。王芳不止已經建立了實驗室，而且她已經通過實驗創造了自己的一班人手，大概有十幾人之多。隆崎沒想到王芳的進度盡然如此的快，他也在想，陳武的進度又是什麼樣子的。
當隆崎跟王芳說到和馬誠一樣的事情的時候，王芳的表現更加令隆崎震驚，王芳可以說是完全服從地喝下了毒藥。但是她在服毒之前對隆崎說：“我的全部行動都是按照你的計劃進行的，你創造了我們，就像我們的神一樣，如今我們已經被神拋棄了。我不能理解你的想法，但是我也有我的想法，既然有神靈，更有子民，爲何還要毀掉自己親手創造的世界？”
看着王芳飲完了毒藥之後，隆崎對她說：“我也對你們深感抱歉，在你們分出去之後，我對自己做了一件很恐怖的事情，你知道現在的我是什麼嗎？我現在眼裡的世界根本跟你們不一樣，我甚至能看到那些積聚在人類身上的惡魔。”隆崎把自己的右手伸到了王芳的眼前，“你看着我這隻手，它有沒有什麼特別？”
王芳搖頭，因爲他只是看到了一隻人類普通的手。
“但是你知道我眼裡能看到什麼嗎？我能看到很多的東西漂浮在我的手的周圍，那些東西人類是看不到的。我在所有的普通的人類身上都能看都這種東西，但是在你們一點也看不到，那些東西估計是和靈魂直接聯繫的吧。所以你們根本就不能稱爲人類啊。不知道你們一直留在這個世上的話，到了最後會變成什麼樣，或者在某一天，你們會突然對這個世界做什麼事情，那樣我是不允許的，因爲我要創造的是完美的人類，完美的世界。在我眼裡，你們並不完美。所以，銷燬吧。”
“什麼惡魔？什麼靈魂？在你給我們設定的大腦裡面這些東西根本就是不存在的。如果說你現在要我們接受這些東西也基本是不可能的。我還是退出吧。”說完這些話之後，王芳倒在了地上。
隆崎也像處理馬誠一樣除了了王芳的屍體，然後處理掉了她的實驗室，連同王芳的實驗成果也一同清理掉了。
隆崎鬆了口氣，終於只剩下拉特拉斯城的陳武了。
陳武可以說是隆崎的實驗品中大腦最發達的人了。隆崎對他所做的成果很期待。當來到拉特拉斯城遇到陳武的時候，他十分興奮地告訴隆崎：“我的實驗完全成功了，我可以讓你看看我的成果，對了你當時不是還有個朋友死了嗎？現在我已經完全把他重造了。”當陳武口裡的這個人出現在隆崎的眼前的時候，隆崎真的是目瞪口呆。他眼前的這個人是琪峰！
“身體機能已經提升到極限了，大腦的超人的大腦。對這種實驗成品還滿意吧，我們的隆崎大人？”陳武對隆崎說。
隆崎看到眼前的琪峰，想起了自己的過去，以前跟琪峰在一起的回憶迅速從隆崎的大腦裡涌了出來，而最後一個畫面是，琪峰跟柯柱間一起葬身火海。那個時候雖然義無反顧，但是他還是差點流下眼淚。