山本一夫帶隊飛速趕到龍魂使者所說的地點時，發現現場已經被人清理過了。不過，仔細觀察還能看出些激烈戰鬥後的痕跡。山本一夫已經知道了那2名超級戰士的代號，東袋狸與西袋狸，最近的幾件莫名其妙的大案都跟他們有關。“他們還沒有走遠，快追，應該是天化組織的接應人馬搶先一步找到了屍體。”山本一夫當機立斷，開始部署嚴密的追捕。而與此同時，憂心忡忡的暴龍和劍齒虎帶着兩具屍體，正在急速撤退，並下令附近的人馬潛伏和轉移。原來，他們沒有等到完成任務的東袋狸、西袋狸及時來會合，就知道事情不對，隨後就去查找，很快就找到二人，只不過已經是兩具屍體了。
劍齒虎有些詫異，“大哥，龍魂使者是怎麼擊斃這兩隻狐狸的，在晚上行動，他們兩個又那麼機警狡猾，按理來說不應該出事纔對。”暴龍嘆了口氣，“超級戰士的作戰方法本來就不按照常理進行，每個超級戰士都有自己獨特的技能，在不瞭解對方虛實的情況下沒有人敢說必勝。現在看來，龍魂使者不一定就是渡渡鳥，這個世界上高手很多，你發現東袋狸的劍傷了嗎？那絕對是個劍道高手攻出來的，可根據我們的資料，渡渡鳥沒有修煉過劍道，除非在他失蹤那5年裡纔開始修習的。”劍齒虎也有些無奈，“算了，把屍體交給組織上層吧，那些研究人員會給我們一些線索的。糟了，秘密調查局的人追上來了，快走。”
當佐藤警官在鬼屋給孩子們做筆錄時，外面已經發生了激烈的戰鬥，秘密調查局這次大舉出動，攻破天化組織在附近的所有據點，不少人員被擊斃俘獲，其中還有幾名高級人員，但暴龍和劍齒虎殲滅了秘密調查局一個小隊帶着屍體順利逃脫了，讓山本一夫大爲惱怒。不過，總的來說，秘密調查局此次收穫不淺，以前很多迷惑不解的奇怪案子在這次行動裡都獲得了答案。
天化組織這次損失慘重，在短時間內不可能恢復如此多的據點和情報人員，若非暴龍和劍齒虎帶回了東袋狸與西袋狸的屍體，二人非受到處分不可。而組織的研究人員感到驚異，東袋狸與西袋狸不但在夜裡攻擊能力最強，而且有絕對的逃生技能，居然還被人如此擊殺，這個龍魂使者比他們預先估計的還要厲害，不過，可以肯定龍魂使者也是超級戰士，身上有着與衆不同的技能，不一定是渡渡鳥，或者很有可能是渡渡鳥的夥伴之類，二人有可能是一起行動的，否則很難在如此短的時間內將二狸先後擊殺，當然這些全部只是推斷。
天化組織決定暗中從東京的各個劍道館查找線索，重點查找在5年前剛剛修習劍道，最近才快速崛起的高手。新莊武平的神怡道場是重點關注對象，用短短5年時間造就一位劍道高手並不是那麼容易的，新莊大師卻絕對可以做到。天化組織能夠猜測到的，山本一夫同樣也想到了，他早就在神怡道場挖好了坑一直等着天化組織和黑暗組織的人往裡跳。
一週以後，千鈞已經爲那夜的行動表示了歉意，靜楊她們接受了他的解釋，也大爲驚歎這個柯南還真會惹事，晚上去探險都能碰到弒父兇手。於是這天晚上，千鈞極力逢迎全力以赴，激戰過後，三女都筋疲力盡y體橫陳，大家一起相擁而眠。第二天，從溫柔鄉艱難起來，吃過香豔的早飯，千鈞正準備送靜楊她們三個各自回家，文良和雲靈過來拜訪。
原來，文良想要去郊外森林秘密基地看昆蟲，雲靈當然不同意，她想去逛街，文良不得不服軟。雲靈認爲一個人去沒什麼意思，就過來約靜楊她們三個。結果，幾個女孩都決定先去逛街，千鈞和文良對視無言。幸好，宮本由美和高木警官一起過來了，千鈞急忙請他們進來，覺得高木警官今天非常帥氣，連他與由美一同前來的醋意都忘記了。
千鈞弄明白了，“原來如此，高木警官，這麼說來你是奉命追捕一名逃犯了。”高木警官點頭，“是啊，糟糕的是我根本沒見過這名逃犯，只知道他叫做岡村寧二，手上也只有一張他的身份證複印件。”由美笑着補充，“這名逃犯是5年前的累犯了，佐藤帶回的那個昭夫5年前無意中看見他行兇殺人，經過證實的確就是岡村寧二。”高木嘆氣，“這傢伙手上都有好幾條人命了，警方一直在通緝他，可是這幾年他就突然銷聲匿跡了。”文良奇怪，“咦，高木警官，那爲什麼這個如此艱鉅的任務落在你身上了？”
由美好笑，“本來是佐藤警官主動請纓的，高木警官立即響應去做美和子的助手，可最近秘密調查局那邊搞出很多事情，目暮警官不得不親自過去善後，就讓佐藤警官負責他手上的一個大案。”大家全明白了，雲靈笑道，“所以，這個追捕逃犯的案子只能交給鬥志昂揚的高木警官獨立負責了，你是來找新一和千鈞求助的吧。”高木有些垂頭喪氣，他本來想跟在佐藤p股後面協助，還可以找機會一親芳澤，沒想到事情會變成這樣，他現在騎虎難下了。
千鈞摸着下巴，“好了，振作一點，高木警官。不過，現在新一不在，而且說真的，追捕逃犯的事情，他也並不是特別擅長。這樣吧，我跟你一起去找這個傢伙好了。我的運氣一向很好的，我與新一合作時都是我擒獲逃犯的。”文良一聽，立即來了精神，“沒錯，多個人好辦事，高木警官以你現在的職位也沒有別的手下吧，我也去好了。”
高木警官不得已，只好接受了千鈞和文良的建議，三人準備一起出發去追捕逃犯。千鈞讓由美開車陪靜楊、小雅、直子、雲靈去逛街，家裡的黑閃這兩天也託由美過來照顧。路上，高木警官叮囑千鈞和文良不要亂行動，只要負責找到岡村藏身之處就行，那傢伙可是亡命之徒。千鈞和文良一向膽大慣了，自然有些不以爲然，這次行動文良也帶了把武士刀防身。三人先到了岡村昔日居住的地方進行調查，他的妻子還在那裡居住。
當然，調查的結果也沒什麼線索，鄰居的回答也是沒有見到岡村，他的妻子也聲稱多年沒見到丈夫了。失去了這條線索，高木已經沒有辦法了，千鈞覺得岡村妻子有些不對勁，他家裡的一些擺設好像感覺有男人來住一樣。所以大家晚上就在那裡盯着，沒想到還真發現了一個黑影出現，三人分頭堵擊，費了好大勁纔將其擒獲。結果這人不是岡村，而是岡村妻子的情夫。不過，他無意中聽人提起說好像見過岡村。三人就前往尋找這個曾經見過岡村的人。
幾經周折，問了幾個相關的人，繞了很多冤枉路，在週日上午，高木等三人來到米花神社，可是他們找了半天，還詢問了那位年老的豆垣久作社主，也沒發現岡村的任何消息。偏偏這時候，高木的警車還拋錨了，三人無奈到附近一家修理廠求助，見到了修理廠漂亮老闆娘，她非常熱情請他們到會客室休息，她讓人把車拖過來修理。三人休息一會兒，決定出去到附近轉轉，看有沒有線索。走到門口，來一位帶着孩子的年輕婦女，她是個來給丈夫送午飯的，順便帶剛上幼兒園的孩子開開眼界，看看他爸爸工作的修理廠。
漂亮老闆娘笑着提及，這女人的丈夫是她工廠最厲害的修理師傅，是5年前到這裡來的，他們夫婦的結合還是她給牽的紅線，他們夫妻非常恩愛。高木警官就問了那位師傅的名字，老闆娘說叫山木。高木搖了搖頭，打算離去。千鈞隨口問這個山木以前的經歷，老闆娘也奇怪了，不知道這個山木以前是幹什麼的，他自己也從未仔細提及過。文良就建議過去看看，於是老闆娘就帶大家去見山木師傅。
讓高木警官大爲失望的是，這個山木與自己那張照片的岡村不大像。幾個人隨便瞎聊了幾句，問了一些5年前的情況，也沒覺得有什麼不對，就打算離開。這時候，千鈞突然回頭，大喊，“岡村寧二！”那人下意識地答應了一聲，大家都是一愣，文良立即大喊，“岡村，你站住，我們是警察。”岡村一見暴露，飛快逃跑，三人立即分頭堵擊，只留下不知所措的老闆娘與岡村的新妻子。
岡村對附近的地勢非常熟悉，幾次甩開了三人的追蹤，但還是在米花神社不遠的地方，被千鈞追上，這時候的岡村已經累得像死狗一樣了。隨後過來的文良，與千鈞一起將他制服，等了好一會兒，高木才氣喘吁吁地趕到，給岡村戴上了手銬。岡村苦笑，“沒想到我改名換姓逃了這麼久，還是被你們抓住了。哎，算了，我只希望你們不要把我以前做的事情告訴我兒子，是我對不起他們母子。”事情順利解決，三人都大爲欣喜，尤其是高木，他本來都打算放棄了。
他們在帶着岡村向修理廠走去時，看見目暮警官開車帶着人向這裡趕來，大家都奇怪目暮警官怎麼這麼快就得到了消息了。高木跑到路上揮手大喊，目暮警官停車下來，“高木，你怎麼在這裡？這傢伙是誰？”高木警官一愣，“目暮警部，你不是來接應我的嗎？我抓到岡村了。”這次輪到目暮警官吃驚，“什麼？你抓到那個逃犯了？就是這傢伙，太好了，高木，沒想到你這麼能幹啊，居然這麼短時間就抓到了犯人。”
千鈞和文良上前詢問，“目暮警官，你不是來接應高木警官的啊？那怎麼到這裡來了？”目暮警官苦笑，他根本就沒指望高木能抓到這個犯人，讓高木去不過是讓他積累些經驗，他也沒想到岡村竟然還在東京轄區內。目暮揮手讓隨來的警員把岡村先帶回去，讓大家一起跟他去命案現場，原來這裡發生一起謀殺案，地點就在米花神社。等千鈞見到柯南他們時，就全明白了，死神到了。
原來，毛利小五郎擔任某一偵探連續劇的顧問，電視劇的名字大概是《暗笑的脅迫者》。由於劇情需要一行人前往米花神社拍外景。隨同前來的人員有導演權藤武敏，扮演殺人兇手的女主角大明星衝野洋子，洋子的經紀人山岸榮一，帥氣的偶像派男演員那智真吾扮演死者，攝影助手安西守男，隨同前來戴着眼鏡的漂亮女助理豆垣妙子，負責ad的島埼裕二，以及其他的一些工作人員。
電視劇拍完後，小五郎對洋子大獻殷勤，洋子都有些不好意思了。權藤武敏稱讚因爲有小五郎指導，電視劇才這麼成功，大叔洋洋自得說事實也好像如此，柯南好笑他又開始得意忘形的吹噓了。那智真吾非常喜歡玩火柴組合遊戲，見小蘭長得漂亮，就刻意上前套近乎，讓柯南大爲惱怒，嘲笑他是善於逢迎的傢伙。
善良溫柔的豆垣妙子與頗有氣質的島埼裕二訂婚，下個月將舉行正式婚禮，大家都給以善意的祝福，只有戴着骷髏手錶的安西守男露出不懷好意的笑容，“結婚前的人怎麼看都像朵花，不過那只是一種幻覺罷了。”豆垣妙子臉色大變，島埼裕二大怒上前要教訓他，被妙子及時勸阻，島埼裕二惱怒，“安西只會說一些惹人討厭的話。”安西冷笑，“那只是一般論，我又不是特別指你們。你沒必要這麼生氣吧。”這時，他的骷髏手錶發出鬧鈴聲，安西稱是上個月特地去美國買的。
大家在收拾東西時，豆垣妙子的祖父豆垣久作來看望了妙子，叮囑電視臺的人把這裡收拾乾淨，又疼愛地問了妙子幾句後離開。妙子告訴小蘭爺爺就是這個神社的住持。到了傍晚的時候，柯南提醒小蘭給園子要那智真吾的簽名，小蘭驚呼差點忘了，急忙拉着柯南跑到樹林裡面尋找。剛巧，他們一起發現了安西守男在樹林裡面拿着緋聞照片威脅自戀任性的那智真吾，被隨後過來的島埼裕二發現後，小蘭急忙說對不起，倒拖着柯南跑出樹林，可憐的柯南。
等到安排大家住店的時候，那智真吾卻不肯住米花旅館這種二流的旅店，然後獨自離開去住帝丹旅店，柯南嘲笑他不要臉。大叔與權藤是酒逢知己，在送酒大姐和女店員的陪同下，二人喝得非常盡興。安西守男說要去保養攝影機，豆垣妙子說回家一趟，二人先後離開，因爲要買幫權藤武敏買東西，島埼裕二也隨後出去。洋子稱讚小蘭還很年輕，現在還不用化妝。洋子問起了小蘭的幾個同學，“就是那對雙胞胎，還有一個叫直子的女生，你們幾個都那麼年輕漂亮啊。”小蘭有些不好意思，“那對雙胞胎是新莊大師的孫女，一個叫靜楊，一個叫小雅。不過，洋子小姐，你真是太過獎了。”
衝野洋子和小蘭爲了出去方便，去屋裡換衣服，柯南同學大飽眼福，看到二女換衣服的全過程，臉都紅透了，心裡直癢癢。換裝的洋子戴着帽子，非常的帥氣，洋子說小蘭有點神經質，開玩笑的。他們三個走出來時，碰到了已經回來的豆垣妙子，她好像到神社見自己的爺爺豆垣久作剛剛返回。隨後大家見到了戴着骷髏手錶與帽子的安西守男，他繞了一圈又走了，豆垣妙子露出驚詫莫名的表情，讓柯南覺得很奇怪，小蘭也說妙子的表情好像看到鬼一樣。
三人在逛街買東西回來時，洋子還特意給柯南買了雪糕。經過米花神社，發現那裡有些奇怪的人影動靜，就一起跑過去觀看，衝野洋子發出尖叫，安西守男死在血泊中，衣服和紅色的帽子都掉在四周。隨後趕到的就是島埼裕二，還有那智真吾與情婦荻山律子。毛利小五郎趕到後，馬上控制住現場，並打電話通知了目暮警官。隨後其他人包括社主豆垣久作也都到了。
目暮警官見到小五郎後，有些無奈，“毛利，爲什麼每次你都出現在兇案現場？真是的，不是讓你沒事的話就待在家裡嗎？”毛利呵呵笑着上前解釋了自己這次前來協助拍攝電視劇的。高木警官也上前來協助進行搜查取證，很快證實了兇器就是拍攝時用的刀子，兇器上沒有指紋，鑑識人員證實了刀子被擦拭過。小蘭和洋子都說當時太暗了，那個人影連男女都分辨不出來。當時的時間是十點半，那麼犯案的時間應當是10點鐘到10點半之間。
目暮警官和毛利小五郎發現了地上留下的血字留言，翻譯過來是石獅子的意思。毛利偵探認爲石獅子就是指的神社出身的豆垣妙子，而妙子在他們喝酒時出去了大約1個小時。妙子說自己回家了，可她的爺爺剛好出去了，不能替她作證。由於她沒有不在場證明，千鈞和文良都贊成大叔的推理。
出於謹慎，目暮警官開始詢問大家的不在場證明，權藤武敏與小五郎在一起喝酒可以證實，小蘭、柯南與洋子一起逛街也沒有問題，山岸榮一也一直在旅店沒有出門。剩下有嫌疑的就是，那智真吾、荻山律子、島埼裕二、豆垣妙子4人，島埼裕二現在手裡還拎着買來的東西，店員可以證實他確實到店裡買了東西，由於他出去的時間在犯案時間內依然有可能作案，但是他在十點15分後就回到了旅店，之後沒有出去，而洋子和小蘭看到人影時是在十點半。豆垣妙子回到旅店後沒有離開，洋子和小蘭確認當時安西守男還活着，毛利偵探的頭上都是汗。
那麼，最大的嫌疑就是那智真吾和荻山律子，首先那智真吾不肯隨大家一起住旅店的理由太牽強了。高木警官從死者身上拿到了可疑的照片，裡面全是他們兩個在旅店偷情的豔照，而荻山律子偏偏是位有丈夫的名演員，山岸榮一對演藝圈的事情最清楚很快證實了這件事情。千鈞立即斷定，“目暮警官，很明顯，這對j夫y婦被死者威脅了，剛纔我問過柯南了，他親眼看到安西守男在樹林裡要挾那智真吾，他們兩個晚上莫名其妙地跑到這裡來，又說不出所以然來，那麼兇手就呼之欲出了。”目暮警官詢問小蘭，得到了證實。
毛利偵探認爲石獅子可能是那智真吾的外號，那智真吾大怒，“我這樣的帥哥，會有石獅子這樣粗俗的綽號嗎？”柯南也剛巧發現，那個死者留言被人改動過，去掉多餘的一筆，留言就是帥哥。柯南故意說這個片假名寫錯了，左邊沒有連寫。經柯南提示，小五郎和目暮警官也都發現了這一點。
那智真吾見大家懷疑，只好實話實說，他確實受到了安西的威脅，雙方約好了今晚在米花神社碰頭，他打算拿錢買回偷情照片，誰知道他和律子趕到時，就發現安西已經被人用刀殺了，湊巧看到了地上的留言，爲了不讓人懷疑，慌亂中他只好加了兩筆，將帥哥改成石獅子。還沒來得及取回照片，就聽到了洋子和小蘭走過來的聲音，他只好帶着情婦匆忙逃走。洋子和小蘭也明白過來，原來她們聽到的聲音就是那智真吾和荻山律子逃走時的聲音。
目暮警官詢問，“喂喂，你們有沒有別的證人？”荻山律子惱怒，“拜託，警官，你見過有人偷情，還找人作證的嗎？”目暮警官無語了，小五郎冷笑，“警部，兇手就是那智真吾，荻山律子幫情夫作證不能作數，應該是他們與安西的條件沒談好，就殺了安西滅口。”這個推理得到了千鈞和高木、文良等人的一致認可。
目暮警官點頭，讓他們不要再試圖狡辯了，請二人跟自己去警局一趟，二人驚怒，拼命否認，但還是被幾位警員推搡着向警車走去。柯南已經發現了破綻，知道情況不對，趕緊麻醉了小五郎，於是沉睡的小五郎推理秀出現，“等一下，目暮警官。”目暮警官只好讓大家暫停，回頭看見毛利偵探這個樣子，有些惱怒，“喂喂，毛利，難道還有什麼不對嗎？剛纔的推理也是你做出來的。”
“哈哈，不好意思，目暮警官，我剛纔也被真正的兇手騙過了。那智真吾他們並沒有撒謊，的確在那之前安西守男已經被人殺死了，命案是發生在十點以前的。目暮警官，你再仔細看看那個留言，他在那智真吾改寫之前，實際上已經被人改寫了一次了。”目暮警官有些疑惑，經過大家觀察和毛利的提示，“等一下，如果去掉這幾筆的話，那留言就是豆垣了。難道兇手是豆垣久作？”大家都看向那位年老的神社社主，“不是他，目暮警官，那把刀只有點電視劇組的人才能拿到。真正的兇手是豆垣妙子。”
所有人都大吃一驚，小蘭惱怒，“爸爸，我不是說過嘛，我和洋子小姐離開時，豆垣小姐一直在旅店，而那時安西守男還活着呢，她有不在場證明的。”“當然，如果你看到的是真正的安西守男的話，她的不在場證明才成立。”洋子也愣了，“毛利先生，你的意思是？”“我仔細問過柯南了，你們當時只看到一個貌似安西的男子從裡面出來，是通過他的骷髏手錶和帽子才認定他是安西的，其實那時候安西守男已經被殺死了，所以當時豆垣小姐纔會露出驚訝的表情吧。”
小蘭和洋子也恍然大悟，千鈞忍不住詢問，“毛利大叔，那假扮安西守男的是誰？誰又把留言改成了帥哥？”毛利偵探嘆了口氣，“是深愛着妙子的島埼裕二，他取走了已死的安西的骷髏手錶並假扮成安西守男，通過這種方式故意把兇案發生時間向後進行了延遲，爲的就是給妙子做出不在場證明。改動留言的人也是他，原因只有一個，想幫助自己的未婚妻脫罪。在這之後，又搶在前面將手錶等物放回死者的原處。目暮警官，你仔細看看死者手錶的表面，只有那裡沒有血跡的，那是被擦拭後的結果。我說的沒有錯吧，島埼先生。”
島埼裕二惱怒，叫囂着，“我纔是真正的兇手，不管妙子的事情。”毛利偵探嘆氣，“你並不是兇手，現場的血跡濺得到處都是，你身上卻沒有一點痕跡。在這裡有時間換下血衣並且洗掉血跡的人只有豆垣妙子。”豆垣妙子流着淚走過來，承認了自己纔是真兇，與島埼裕二摟抱在一起痛哭起來。島埼裕二也承認了刀子上的血跡和指紋也是他擦去的。
豆垣妙子是一個有着不堪回首過去的女孩，因爲在高中時父母的早喪和年少叛逆，所以一度和一些狐朋狗友攪在一起，在不經意間泄漏了家中也是神社中神器的秘密，結果神器被偷，而看管神器的杉山先生也因自責而自殺，她因此非常害怕、懊悔而沒有說出實情，從此給她留下了無法擺脫的陰霾……多年後，當她準備正準備步入婚姻，邁向新的幸福時，那個偷了神器的無恥無賴安西守男竟舊事重提，還以此勒索威脅，忍無可忍之下，她選擇了用刀威脅，以保護來之不易的幸福，但她沒想到，對方竟窮兇極惡的衝了過來，混亂間意外失手殺了那個人渣。
事情發生後，她匆忙離去，安西臨死前在地上寫的是是豆垣，被島崎裕二看到了，於是改成了帥哥，這樣就可以將罪名嫁禍給那智真吾，而自己又特意假扮了死者，意圖幫妙子矇混過關。可是留言又被趕來的那智真吾看到了，於是又添了兩筆改成了石獅子。
目暮警官最後將島埼裕二、豆垣妙子二人一起帶走，毛利偵探清醒過來，在千鈞的提醒下，知道了案件的簡單真相，在洋子面前又洋洋自得起來。可是這次大家的心情都有些沉重，絲毫沒有破獲案件後的喜悅。後來，經過陪審團和辯護律師的求情，豆垣妙子因防衛過當誤殺安西守男被法庭判處2年徒刑，島埼裕二因故意包庇兇手、嫁禍他人、僞造證據妨礙警方辦案，被警方拘役2個月以示警告，那智真吾也受到警方口頭警告，倒是他與荻山律子的緋聞愈演愈烈了。毛利偵探因破獲該起血跡留言兇殺案，警視廳給以b級獎勵。
尾聲，岡村因多年的幾次行兇，被法庭判處20年徒刑，原配妻子正式與之離婚，反而是後來那位妻子心甘情願等他出獄，並含淚答應會把他們的孩子撫養長大。高木警官因抓獲多年在逃犯被警視廳大力嘉獎，他付出的代價是保舉千口文良參加持槍的培訓和考試。;