白文選的猶豫和態度，白明修是一清二楚的。
在白文選參與的第一次南明小朝廷的朝會上，白明修就很乾脆地拋出了“軍改”的方針。
“……由澳洲的經驗來看，軍隊在未來都將以火器化爲主。火器會變得越來越厲害，不管是戰馬、盾車都無法阻擋強大的火槍和火炮。逆賊吳三桂此時已經在雲南點兵，兩路進發，估計最多三四個月，就會抵達阿瓦城下。如今之計，我軍必須加速組建新軍。爲今之計，不能再拘泥於誰的部屬誰的部屬，大明若亡，誰都沒有好結果。所以，本宮要將明軍按照新法，編制爲不同部隊。”
白文選才不會信太子這樣的話，在他看來這就是明顯地奪兵權了，他出言反對道：“殿下，如您所言，與吳三桂的大戰迫在眉睫，這個時候卻要打散重組軍隊，用咱們都看不懂的東西去管軍隊，這個太過冒險了啊。”
面相只有十四歲的白明修雙目含着精芒，望向白文選，道：“鞏昌王，冒險與否，有本宮說了算。”
白文選覺得有些棘手，他還是想找些什麼話來反對，但是他卻看到，就連李定國都盯着自己，明顯是站在了太子的那一邊。
而朝會的與此同時，白明修授意手下趙旭、林正等人，將白文選的手下們給請到了一間大宅中，名義上是請各位同袍吃酒。可是吃到一半，白文選的部將張國用想要離開的時候，卻被林正給阻攔了。
“幹嗎，還不讓人走了嗎？你們是什麼意思？”張國用驚怒地道。
林正簡單地道：“奉太子殿下之命，籌組大明新軍，集合各部軍官進行封閉培訓，所有人不得私自離開集訓地。”
張國用大怒：“這是將我們軟禁了起來！”
林正一板一眼地道：“培訓就是培訓，之後學習成績好，考覈好，是能夠升官的。”
這話的潛臺詞是，如果不好好幹，不能讓太子殿下滿意，你也就別幹了。
一時之間，阿瓦城居然再度顯得有些混亂了，白文選軍中幾乎大小的首領都被抓了去，甚至李定國軍中也有一些不聽招呼的人，還想鬧出亂子，最終被李定國親自出面給提走了。
儘管李定國也覺得白明修的做法有一些冒險，但是現在李定國已經對白明修存在了一種迷信，甚至覺得白明修的雷厲風行手段，正是一位皇帝所需要的。而且在這個節骨眼上，整頓軍隊也確實是不可缺少的。
白明修有忠於自己的警衛連、鐵炮足輕和蠻族兵作爲“憲兵”，把不老實的傢伙都收拾了一遍，基本上鬧了一天的時間，明軍只能老老實實地接受改編了。這個過程跟白明修想得差不多，並不算多麼順利，如果沒有李定國的支持，他肯定搞不下去。
白明修清點明軍裝備，現有燧發槍2000支、火繩槍1000餘支，至於那些三眼銃之類的東西，白明修直接從正規軍序列裡剔除掉了，而是扔給了蠻族兵。蠻族兵在山野之地作戰，不需要組成什麼線列，所以能一次擊發的三眼銃之類的火槍就夠用了。
依靠着強力手段，白明修還是拉出了一個近代化明軍的架子。白明修很直接地給了這支軍隊一個新的番號——“大明覆國軍”。明軍可戰之兵員額爲14000多人，白明修將其劃分爲了線列步兵、重步兵、長矛兵、山地步兵、弓箭手、遊騎兵和炮兵。具體編組如下：
大明覆國軍陸軍線列步兵第一團、第二團、第三團，裝備燧發槍和火繩槍。每個團下屬四個營，每營下屬三個連，每個排32-36人。線列步兵總員額：3521人。
大明覆國軍陸軍重步兵第一團、第二團，士兵披甲，使用的主要武器是刀盾一類冷兵器，編制跟線列步兵是類似的。重步兵總員額：2208人。
大明覆國軍陸軍長矛兵第一團、第二團，裝備4.2米左右的長矛，士兵披輕甲。編制也跟線列步兵類似。長矛兵總員額：1860人。
大明覆國軍陸軍山地步兵第一團、第二團，是由白明修的蠻族兵組成的，武器裝備緬刀，以及一些中式火器。編制類似線列步兵，總員額1967人。
大明覆國軍陸軍弓箭兵第一團，主武器爲弓弩，編制上每個中隊100名弓手，大隊下屬5箇中隊，弓箭兵第一團總員額1146人。
大明覆國軍陸軍遊騎兵第一團、第二團、第三團、第四團，主要披甲使用冷兵器的騎兵，編制上一個遊騎兵團下屬8個騎兵連，每個騎兵連約100人。騎兵總員額：3366人。
大明覆國軍陸軍炮兵第一團，主要裝備李定國和白文選軍中各種弗朗機炮、虎蹲炮等威力不大的“輕型”火炮，加上白明修兌換的M1844拿破崙6磅炮，炮兵團編制下屬炮兵營3個，員額僅有345人。
在白明修新組建的這支半近代又半中古的軍隊中，真正的主力是線列步兵團，白明修甚至還將鐵炮足輕給拆開了，送到各部去做小軍官，林正作爲線列步兵第一團的團長。再就是四個騎兵團，白文選軍中有大量的戰馬，正好方便了白明修組建了掩護線列步兵的騎兵團。騎兵可以執行衝擊，並且在側翼進行騷擾，還可以進行追擊，是白明修現在戰術裡不可缺少的部分。
至於長矛兵，則是白明修跟古斯塔夫學的了。長矛兵組成的“野豬毛”陣可以有效的對抗騎兵，而且長矛兵列陣的威勢還是很足的。
至於重步兵、弓箭手這類兵種，完全是因爲白明修沒有足夠多的火槍，只能先行保留一些這樣的中古軍隊。當他的火器保有量增加之後，白明修還會徹底地替換掉長矛兵，所以長矛兵、重步兵和弓箭手這種編制基本上只能算是暫時編制。
白明修爲了打造明軍的真正炮兵，還特意用所剩不多的金手指幣，兌換了18門價格高達100幣的拿破崙6磅炮，系統告知他，如果他之後兌換了相關圖紙，這個價格還會降低一些。但好歹明軍擁有了算是可以看的炮兵火力。