王敦大權獨攬，琅琊王氏如同千里冰封覆蓋了整個江東大地，朝廷上下包括司馬皇族皆臣服於其淫威之下。
面對氣焰囂張的王敦，司馬睿採用明暗兩手，表面上裝“孫子”，繼續聽任王敦爲所欲爲。
背地裡卻是後孃打孩子——暗使勁兒，一邊繼續重用王導、郗鑑、陶侃、庾亮等一班舊臣心腹，另一邊則大力培養自己兒子司馬紹，將平滅王敦的希望寄託在英武不凡的太子身上。
但司馬睿很清楚僅靠兒子司馬紹一人絕不是老奸巨猾王敦的對手，因此天子藉助王導之便，將原本自己信任而今卻被王敦罷黜的心腹如郗鑑、庾亮等人紛紛調到東宮任職，以此充實東宮勢力。
與此同時，司馬睿還在積極挑撥王導與王敦的關係，試圖讓兩人徹底決裂。
說起來王導與王敦的關係十分複雜，二人一向是又合作又對抗。
首先，由於王敦性格過於強勢，與各方均有矛盾，十分不適合坐鎮建鄴執掌朝政。這也是王敦在打下建鄴拿下朝廷大權後，卻又迅速返回武昌的重要原因。
因爲王敦十分清楚自己不適合做宰相，他沒有可以容人的氣度，故而王敦需要王導替他穩定朝堂，這是王氏兄弟合作的基礎。
其次，王敦有所求於王導，難道王導就不需要王敦了嗎？自然不是！
就拿此次王敦清除天子心腹的行動中，其實王導是有機會救下大部分人的，但王導爲了日後主掌朝政，他眼睜睜看着一大批對天子忠心耿耿的大臣被王敦殺害而無動於衷。
很難說這裡面沒有王導的私心存在，又或者說他就是‘故意’借王敦之手除去政敵。
最後，王敦與王導之間並非毫無芥蒂，二人之間同樣矛盾重重。他們兩人對王氏的定位不同，王敦一心想將琅琊王氏打造成第二個司馬氏，這纔不遺餘力發動叛亂。
而王導至始至終就沒想過推翻晉室，他只是想通過輔佐司馬氏，讓王家成爲大晉第一士族。
而天子顯然看清了王氏兄弟之間複雜的關係，因此他一直在尋找機會讓兩人反目成仇。
機會很快就來臨了，自永昌元年始，天子身體便一日不如一日。而又經過剛剛過去不久的那場大亂刺激，眼下天子司馬睿除了頭腦還算清晰外，基本上已不能下地行走。
隨着自身不能理事，司馬睿立即下詔讓太子司馬紹代他處理政務，同時還詔封王導做司徒爲輔政大臣，全權幫助太子佐理朝政。
司馬睿下得這道聖旨，重點不在讓太子參與政事，畢竟朝廷大權都在王敦手中，太子參與不參與都沒什麼大不了，其中的關鍵在於王導出任輔政大臣。
按說太子司馬紹已經二十四歲了，曾多次協助司馬睿處理過朝政，再者他又不是五六歲的小孩，因此太子根本就不需要什麼輔政大臣。
而且如果真要選擇輔政大臣，王敦作爲當今朝廷上名副其實的二把手，憑什麼被晾到一邊？
最重要的是王敦需要這個輔政大臣的頭銜，因爲他一直都有心要廢黜英武不凡的太子司馬紹。曾在攻破建鄴時想以不孝的名義廢掉太子，結果找王導商量時，卻又被王導勸止。
如果王敦拿到了輔政大臣的名頭，那他就能名正言順對太子指手畫腳，甚至廢掉對方也不是問題，如同當年受武帝遺詔輔政的霍光廢掉昌邑王一樣。
但是現在天子卻將王導推到了輔政大臣的位置上，要說王敦心中沒有一點兒芥蒂絕對不可能。甚至王敦懷疑這本是王導搞得鬼，畢竟天子與王導之間關係密切不是什麼秘密，他沒理由不懷疑。
王敦很快就展現了當朝第一人的威勢，在天子詔封王導爲司徒後不久，他又‘下旨’免除了王導身上揚州刺史的職位，並加自己爲揚州牧。
王敦這一番舉動惹惱了王導，王導氣量再大也不能容忍被人當衆打臉，更何況那個人還是自己曾幫了不少忙的堂兄。
至此，司馬睿的離間計算是成功了，王導、王敦從此貌合神離，基本上分道揚鑣。
天子在成功挑撥了王導與王敦的關係後，並未收手，反而繼續在暗中拉攏其他人。
由於王敦掌握大權之後，只重用他信任的心腹或者王氏族人。
因此，司馬睿將拉攏的對象放在了王氏族人——江州刺史王彬、荊州刺史王舒身上。
王舒曾經一度與王敦走得很近，因爲他自己就是靠王敦發跡的。
而王敦也極其看重王舒，曾不止一次對外人表示：“我有兩個弟弟，一者爲王導，另一者爲王舒，王舒自幼克己復禮，剛正不阿，其品行實乃高雅之士，相比其弟王遂，實在勝過幾籌。老夫年少時便極其賞識王舒，有朝一日定會提拔他。”
王敦十分欣賞王舒，更是在掌握大權後將重地——荊州交付對方手中。
但王敦卻不曾料到，他所賞識王舒早已不是那個對他言聽計從的堂弟，王舒有自己的利益訴求。經過觀察之後，王舒發現王敦身體虛弱，根本活不了幾年。而一旦王敦病故，所有王敦黨羽將樹倒猢猻散，進而被朝廷清算。
爲了避免日後被遭難，王舒在王導的牽線下很快就搭上了太子司馬紹，成爲天子爲司馬紹拉攏到的另一個重要幫手。
如果說王舒是暗中投靠了朝廷，那麼江州刺史王彬就是公開反對王敦了。王彬之所以如此反感王敦，最大的原因則是周顗之死。王彬與周顗是非常要好的朋友，當初王彬也曾爲救周顗苦苦哀求王敦，但最終還是沒能救下週顗性命。
自此王彬便視王敦爲仇人，多次在公開場合抨擊王敦，搞得王敦很是惱火，甚至一度想要暗殺掉王彬。
而王導也曾擔心王彬安全，曾多次暗示他不要公開反對王敦。
但沒想王彬脾氣硬，對王導提醒睬都不睬，一副任殺任剮由王敦悉聽尊便的樣子。
王敦看到這個不要命的堂弟，也無可奈何。
上次因暗殺王棱已經讓王氏族人對他離心離德，因此即便王敦恨不得剁了王彬，但爲了不搞得衆叛親離，再加上王彬能力出衆，素有聲望，不得不放對方一馬。
同時爲了拉攏王彬，王敦還讓他掌控江州。
就這樣在不知不覺當中，天子已暗中將手伸到了荊、江二州，而這兩州又都是王敦根基之地。故而別看攻破建鄴後，大將軍王敦威風八面不可一世，但其實已埋下了失敗的隱患。
在天子暗中發力的同時，太子司馬紹同樣不甘示弱。他一邊從司馬睿手中接過不少忠於朝廷的勢力；另一邊則悄悄操練士兵，培養選拔武將，集聚糧草，爲最後戰勝王敦做準備。
太子任命庾亮、庾冰兄弟以及郗鑑等人爲東宮臣屬，尤其引足智多謀的郗鑑作爲自己的心腹。司馬紹此舉遭到不少原東宮屬官非議，認爲郗鑑在此次叛亂中表現不佳，沒有資格再擔任重職。
但是司馬紹卻不這樣認爲，他以爲郗鑑表現不佳並非對方之過，主要是周札投降太快，不但讓朝廷措手不及，連郗鑑也失去了襲取王敦後路的機會。
至於後來主動放棄兵權苟全性命，在司馬紹看來這更是一個成熟、理智的人最明智的選擇。在大局已定的情況下，連天子都放棄了反抗，更何況郗鑑？留得有用之身，才能東山再起！(。)