這時，裴仁基正在自己的家中與宇文儒童和崔德本等人談笑風生，以輕鬆愉快的心情等候喜訊。然而不幸的是，他們等來的不是王世充駕崩的佳音，而是兵部尚書雲定興親自引兵包圍府邸的可怕消息。宇文儒童一聽說這惡訊，立即從椅子上彈了起來，臉色刷地變白，握在手中的陶瓷茶具也因抖動而滑落，砰地一聲摔了下粉碎。他神色萬分驚恐，渾身不由自主地抖索了一陣，因爲他清楚自己的計謀已敗露，死期也就臨近了。崔德本見宇文儒童如此驚慌，心裡也直打哆嗦，面部肌肉顫抖了幾下，隨即又一聲長嘆，神情沮喪地倒靠在椅背上。宇文溫站起身，瞧瞧宇文儒童，看看崔德本，見他們那副六神無主的樣子，心裡頭也是惶恐不安。他拔腿就想往後院逃，卻被裴仁基攔住了。
裴仁基畢竟是個身經百戰的沙場老將，即便面對死亡也能鎮定自若。他聽着外面的嘈雜聲，神色平靜地啜飲着手中的好茶，似乎什麼事也沒發生，外面的一切與自己無關。他知道自己在劫難逃，也清楚王世充會怎樣對待自己，但他並不害怕這一切。死，對這位戎馬一生的老將軍來說，是一件相當平常的事，沒什麼大不了的，更不會懼怕。只是令他痛心疾首的是，自己沒能剷除王世充這個亂臣賊子，沒能憑自己的力量復興隋室。爲此，他痛苦地長長嘆了口氣，然後挺起腰板，不緊不慢地朝緊閉的硃色大門走過去。
宇文儒童看到裴仁基要開門，慌忙上前阻攔道：
“將軍，您難道要自投羅網嗎？”
“事已至此，我們還能怎麼樣？”裴仁基掛滿銀鬚的嘴脣微微往上一翹，露出絲苦笑，淡淡地說句，“這是一場你死我活的較量，不是他王世充死，就是我等滅亡。現今王世充安然無恙，那便是我們的死期到了。走吧，老夫還想去看看我的兒子呢。這會兒，他肯定在王世充那兒哪！”
說着，裴仁基愴然一聲大笑，毫不猶豫地推開了那扇圖案精美的格子門。
雲定興常與裴仁基並肩作戰，他對這位老將軍的膽略與驍勇是十分敬服的，也頗有些感情。可如今，他已是皇上的通緝犯，爲了自己的前程，雲定興只能拋卻所有的私人感情，冷麪無情地執行王世充的命令。因此，他略微遲疑了下，就朝手下一揮長劍，命令他們上前捉拿逆賊。
裴仁基高高地挺立在石階上，沒有抽出自己隨身攜帶的佩劍，也看不出有任何反抗的跡象。他只對着面前的士兵仰面朗聲哈哈大笑，接着解下劍鞘一把扔在地上。裴仁基已放棄了反抗，這倒讓雲定興突然感到羞愧難當。他用敬畏的眼光看了眼這位正氣昂然的老將軍，然後命手下將他綁了。
接着，雲定興又沒花多大工夫，就把欲逃跑的宇文儒童叔侄以及崔德本等謀逆者逮捕了。然後，他押着昔日的同僚們趕往宮中。大獲全勝，論理雲定興應該高興纔對，因爲他可以借平定叛亂之功向自己主子邀功請賞，加官進爵。然而，不知怎的，一路上他居然心情沉重，一點喜色也沒有。
沒過多久，裴仁基、宇文儒童等人就被押送到王世充跟前。王世充看到這羣謀害自己的傢伙，不由勃然作色，目露兇光。他高高坐於龍案之前，瞪着那雙凶神惡煞的眼睛，逐一掃視着面前的逆臣，眼神中透着令人不寒而慄的殺氣。好大一會兒後，他才把眼睛釘在裴仁基臉上，恨恨地質問道：
“裴仁基，朕待你一向不薄，何故要反呀？你好好一個禮部尚書不做，爲何要做反賊，哼？”
“裴仁基非反賊，反賊是你王世充！”裴仁基面無懼色地高聲反駁道，“你廢除隋皇，自稱鄭帝，乃竊國之逆賊，人人可誅殺你！”
“大膽，竟敢罵朕！”王世充重重拍了下龍案，厲聲喝斥道，“謀殺皇上，該當何罪！朕慾念你功績，免你一死，然你口吐狂言，罪不容誅！”
“我等起事，實爲剪除你這亂臣賊子，復立隋皇，匡扶隋室。此乃忠臣之所爲，何謂逆賊？”裴仁基正義凜然地回擊道，“我等皆無罪，真正罪大惡極的人是你這個纂權奪位竊取神器的逆賊！你才罪該萬死，天下人人慾得而誅之，欲剝你的皮食你的肉！”
“你，你……”王世充氣急敗壞指着一旁的刀斧手，聲嘶力竭地吼道，“快，快給我拖出去斬了！”
刀斧手得令，一個箭步衝上前，將裴仁基死死拽住。裴仁基不反抗，也不掙扎，只滿懷遺憾地對王世充說句：
“人生固有一死，何足懼哉！只是未能手刃你這逆賊，拯救社稷，而深感痛心！”
說着，他一扭頭，跨出了金碧輝煌的大殿。
隨即，宇文儒童、宇文溫、崔德本等人也被押往轅門。不到半個時辰，他們就同陳謙、裴行儼一道被刀斧手處斬了，首級懸於轅門之上示衆。
王世充平息了這場叛逆，心情非常舒暢，他重賞了段達、雲定興等平叛有功的大臣，又藉此犒勞三軍，穩定政局。儘管宇文儒童、裴仁基等異己勢力已被剷除，朝中再無敢公然反對和敵視自己的人了，但王世充內心還是憂慮不安，擔心羣臣中還會有人出來謀反。因此，他一面加強自己對朝政的掌控能力，一面暗中派遣心腹監視底下的動靜，只要發現有一點異常舉動，就可先斬後奏，格殺勿論。