三年時光，明教勢力席捲天下，兵鋒直指大都，元朝內部一片混亂，然而明教拒不受降，讓他們想出賣元帝求個活命都無法實現。
當年這些人作威作福，肆意殺戮漢人，形勢不妙立刻投降，你以爲明教的人都是老好人？他們不是對內嚴酷對外慈祥的腐儒，仁義道德這句話，只會對自己人使用。
元朝朝廷裹挾了大都的漢人百姓，想要與之同歸於盡，他們放出話來：“只要明軍攻城，城中的漢人就會全被斬首！”實際上他們還是想求得一個投降的機會，奈何天下已定，黃超對他們失去了耐心。
黃超夜入大都，他落在大都一家三層高的酒樓頂上，浩瀚的精神力籠罩了整個大都。這些年，黃超的內力已經修煉到至深境界，龍虎交匯，生生不息，同樣他的精神力越來越強，尋常一二流的武者，都已經抵禦不住他的念力，會被他直接操控內臟和大腦。
當他的念力找到一個個目標，只需要在對方腦子中輕輕一動，對方就會直接殞命。元朝的皇帝也沒有龍氣或國運護體，和路邊的乞丐一樣，都是普通的凡人。
當黃超的念力掃過皇帝的寢宮，黑暗中有一個頭發花白的老太監、兩個頭頂凹陷的番僧被驚動，他們飛快地巡視皇帝寢宮中的動靜，但是沒有發現刺客的蹤跡。
老太監步入元帝寢殿，在牀邊叫了一聲：“陛下？”他沒有聽到對方的聲息，神色大驚，撥開帷帳一看，元帝已經死了。
這三個是元朝的高手，流落出去可能是個麻煩。黃超微微一笑，在空中凌空虛踏，似慢實快地步入皇宮之中。他縱身落在元帝寢宮附近，立刻被三人發現。
守衛皇帝的人，素質都很高。一看黃超不是好人，就猜到他是明教刺殺皇帝的刺客。他們也不大喊大叫，直接把黃超圍在中心，一言不發地下起殺手。
對付黃超這種高手，就算大喊叫來護衛又怎麼樣，他們三人擋不住，再多的護衛也沒用。
黃超呵呵一笑，心說你們這幾個人會玩啊，二話不說就是|幹，真是痛快乾脆！他抽出倚天劍，難得沒有在動手之前互相嘲罵，直接與對方拼命。
老太監內功深厚，陰冷毒辣，身法恍如鬼魅。太監之身本來就不完整，想練成高深武功，往往都要走陰森一脈。至於身法快捷，主要還是爲了護駕方便。那兩個番僧修煉上乘佛門內功，陽剛雄厚，同時二者膂力驚人，大手印配合之間，勁風簡直讓人窒息。
元庭三位絕頂高手，兩人強攻，一人伺機奇襲。對付單獨的刺客真是手到擒來，難怪元朝倒行逆施，那些“武林大俠”也沒有割下元帝的狗頭。
黃超見識了他們的武功，不再留情，倚天劍氣暴漲三尺，無堅不摧，一旋身就將三人腰斬。老太監退得最快，胸腹部被切開一個巨大傷口，但還留了一口氣在。
“閣下……”
黃超一劍刺去，劍氣離劍飛射，將他頭部貫穿。事到如今，還有什麼好說的。
隨着一個靜悄悄的夜晚過去，大都就被黃超一人解放。上至元帝，下至大都的小官，全都老老實實地死在了牀上。
明軍一輪猛攻，大都城牆就被佔領，等四門開放，他們才發現，大都之中的能管事的人全都死光了。黃超事了拂衣去，然而功與名卻被天下熟知。這種力量，人們堅決地把他當作是明尊降世。
說起來也很搞笑，那麼多人穿越到古代裝神弄鬼，被人當成活神仙；可是到了黃超，他卻覺得殊爲無趣，恐怕他是衣食無憂，不需要騙吃騙喝吧。
不久之後，明教徹底平定天下，建立新朝，國號爲“明”，日月教早已經被黃超改組，減少了迷信愚昧的宗教成分，成爲一個成熟的政治團體。而明教則被大多數人信仰，成爲他們的精神寄託，儀式和教條被大大減少，重要的是追求自身的完善和自律。他在大都五年，處理政事，讓天下一切走向正軌。
他將大事託付給自己的弟子。申通成爲明教和日月教的教主，中通和圓通出任左右二使，匯通、天天、周芷若、殷離成爲四大法王，張無忌回到武當接受了張三丰的衣鉢。這一羣人是天下最強的絕頂高手，難得他們關係非常密切，江湖勢力被大爲壓制，已經沒有人敢縱武逞兇。
少林寺又是宣佈封寺百年，然而他們算錯了一件事，那就是黃超的壽命……等到黃超銷聲匿跡，少林寺切實地關了百年大門，傳承的精神已經斷絕，被後輩弟子上交國家。
黃超回到回到華山，少問世事，修煉金丹大道。他坐擁天下，天下間的奇珍異寶、佛道經典、武功秘籍、珍貴藥材都如流水一般送入華山，爲黃超節省了大量精力。
他的武功已經邁入不可名狀的境地，神通不假外求，他甚至分不清自己用的是異能還是武功，他的能力在境界的不斷提升中，融匯一爐。本來通過外界刺激獲得的異能，漸漸也成爲黃超完全掌握的能力。
這日春光明豔，萬物更始，小昭步履輕快地走上朝陽臺，崇敬地望了一眼懸崖邊盤坐的黃超，清脆說道：“公子，我帶午飯來了。”
黃超收回心神，他時常閉關在靜室之中，只以清水解渴；有時也會在露天思考，近距離感受自然變化。每當他在外面，小昭總會準時送來食物、熱水毛巾等等，有這個小侍女，的確讓他省心不少。
黃超目光柔和地看了小昭一眼，當年立志報恩，堅決留在華山的小女孩，已經長成亭亭玉立的大美女。她皮膚白皙，五官嬌俏，因爲玄功有成，所以眼睛明亮有神，晶瑩如玉。黃超道：“小昭，近十年過去，你已經這麼大了。何必要在山上，陪我這個老傢伙？下山去吧。”
這樣的對話早就出現了數次，每次小昭都會找個感恩黃超的理由，然後留在華山。
小昭嘴脣一翹，眼中起了一層薄薄的水霧。她悶悶不樂地說道：“公子，小昭不想離開華山。小昭只想在您身旁做一個小侍女，請您不要把小昭趕走……難道是我哪裡做的不好？”
黃超搖頭，目光寧靜而悠遠：“如果是爲了報恩，這麼多年也夠了。小昭，你應該有自己的生活。”