由於十八世紀對音樂家很不尊重，以致才能洋溢的莫扎特只能在皇室貴族間卑微的生存，雖然莫扎特一向就像頑童一樣，天真活潑，愛開玩笑，不過在他的心裡實際上隱藏了一片陰影。
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在寫信給他父親時常常提到有關死的問題，透露了他心中真正害怕的陰影，他對英年早逝已有了預感。
莫扎特會有當時的成就，幾乎是他的父親一手栽培出來的，所以莫扎特一生之中都以他的父親爲中心，他父親去世時正是莫扎特在譜寫唐．喬凡尼的時候。
莫扎特在他父親活着時候處處違揹他的心意，與薩爾斯堡大主教交惡之事讓他父親的立場十分爲難，他的父親是屬於舊派的作曲家，他不贊成莫扎特的作曲方式；對於莫扎特的婚姻他父親也不同意，在維也納看見了康絲坦茨的作爲之後，更是對莫扎特的結婚十分的不諒解。
父子間的想法與作法背道而馳，他的父親完全失望而在無慰藉的情況下去世了，莫扎特對此感到內疚與痛苦始終不能解脫，深刻的痛苦在他日後的作品上表露無遺。
莫扎特在維也納的經濟情況日漸拮据，因此他想要到外地去試試運氣，於是一七八九年他訪問了布拉格萊比錫德勒斯登柏林等都市。到了柏林他應召前往皇宮，莫扎特一共呈獻了三首絃樂四重奏給普魯士王腓德烈．威廉二世，並且博得褒揚。
一七九零年冬天他回到了維也納，那時維也納奧皇約瑟夫二世駕崩，雷奧液德二世即位，莫扎特所受的待遇每況愈下。新皇的加冕典禮定於法蘭克福舉行，音樂是由意大利的薩里耶裡作曲。
薩里耶裡是在宮中與莫扎特競爭的對手，薩里耶裡是貝多芬的老師。莫扎特並不死心，決定前往法蘭克福再試一次運氣，他親自演奏了新的鋼琴協奏曲，無奈何到場的人數並不多，這首曲子被稱爲加冕協奏曲，從此莫扎特的命運自此開始越來愈慘。
一七九一年莫扎特的劇院經理朋友達．朋特委託他寫一出德語歌劇，這一家劇院不是皇室的高級人士所聽的，而是在維也納郊外的中下階級的流行德語劇院。
莫扎特並不以對象爲平民而拒絕，反而高興的接下任務，他長久以來就希望能再寫一部德語的歌劇。達．朋特爲讓莫扎特專心作曲，特別把公園裡一間漂亮的小屋子租下來給莫扎特住，當時他的妻子正外出療養，因此莫扎特可以十分愉快專心的完成這一部歌劇魔笛。
魔笛在首演時大爲轟動，爲了答謝觀衆的愛護，他親自指揮。莫扎特在魔笛接近完成之時的某一天半夜突然來一位身披黑色披風的男子請他寫一部安魂曲，莫扎特當時嚇了一跳，認爲這一位男士是死神，但因爲實在是缺錢用，只好硬着頭皮答應下來。
或許是預感死之將至，也或許是這位黑衣人的安魂曲委託事件，魔笛的後半段曾經出現過類似安魂曲的曲風。由於魔笛的成功，莫扎特差一點忘了這件事情的約定，突然一夜那名男子又再度出現來催促他早日完成，後來才知道這位灰衣男士是瓦賽克伯爵的僕人萊特蓋普。
這位公爵有將別人的作品當做自己創作發表的可恥習性，後來伯爵在妻子的忌日親自演奏莫扎特所作的安魂曲，萊特蓋普則是伴奏者。
莫扎特對此人此事感受到強大的壓力，日日夜夜在思索着安魂曲的歌詞，因爲他的身體本來就不健康，再加上常常夜裡作曲的苦工，他的身體更加的嬴弱，這時他已經感覺到他在爲他自己作一首安魂曲了。
到了十一月，莫扎特己經是病得無法起身，不過他仍然未放棄自己的這份責任，依然照樣的工作。爲了趕在約定時間交出曲子，莫扎特常常一邊流淚一邊作曲，以致病情急遽的惡化，終於在十二月的夜晚寫到第三部時，莫扎特感到力不從心無法再繼續提筆了。
他覺悟到自己的大限已至，立即招呼弟子朱斯麥瑞前來枕畔，指示曲子的未完成部份。莫扎特終於撒手西歸，莫扎特死後，未完成的安魂曲由朱斯麥瑞繼續完成。
當他死時家中分文不剩，只好把他埋葬在十分廉價的平民公墓內，遺體首先放在當初他與康絲坦茨結婚的史德芬教堂然後前往墓園，但是因爲遇到暴風雪，送葬的人只好半途折返，只留下莫扎特孤單地被埋在無名墓園內。第二天再去確認他的墓地時卻永遠無法找到了，因此莫扎特之墓就成了一個永遠的謎。
過了很久，當世人公認莫扎特爲曠古未有的偉大音樂家時才動員在墓園作調查挖掘，結果仍然是無功而返，最後只好隨意選個地方替他立了個墓碑，算是對他的敬仰。
他的弟子朱斯麥瑞遵照了莫扎特的願望把安魂曲補寫完畢，以後每逢後世紀念莫扎特時都是演奏此曲，聽者無不動容。
像是天嫉英才此話應用到莫扎特是十分恰當的，他一生坎坷，終身貧困，但他始終是樂觀與赤子之情。那時代的人對他的一些言詞與作風無法茍同，對他的音樂也只是欣賞，但莫扎特死後有知的話他應該可以安息，因爲世人們己從他的作品中洞澈真情了。
雖然是英年早逝，莫扎特的音樂才華卻是史上難見的，他對歌劇交響樂協奏曲室內樂獨唱曲鋼琴曲合唱曲等各種音樂形式皆擅長。從小活在大人世界裡的莫扎特，長期在宮中生活接受大家的讚美，以致於長大後的人格變得詭譎複雜。
他說話總是口無遮攔，往往把自己對其他音樂家的評斷全盤托出且少有讚詞，舉措高傲，眼高於頂，在音樂界難以交到真心的朋友。
莫扎特絕對是熱愛生命及人類的，這可從他的最後一部歌劇魔笛中看到。由薩拉斯特羅唱出來：誰都要寬恕敵人，不喜歡這個教義的人，就不配做人。
雖然精神上與生活上常處於困頓的狀態，但是他的作品依舊具有純粹音樂的性質。在貝多芬白遼士肖邦等人的音樂中，多少都能瞭解他們的生活情緒與經驗，但是莫扎特的所表現出來的只是音樂的至真至善與至美。