大修陵墓
同治5年，咸豐帝的定陵完工。按清制，他的兩位皇后慈安、慈禧的陵墓只可在定陵附近選址，並只能建一座皇后陵。當時便定下給兩位皇太后建一座陵，棺槨並排奉安。慈禧看了奏摺很生氣:“哪個陵裡葬兩個太后，連妃園寢的妃子還都各自爲券，這不是明着欺負我們姐妹？”承修大臣們只好提出，仿照雙妃園寢的樣式，在陵的後院東西並排各建寶城、寶頂、下建地宮。將平頂山改名“普祥峪”，爲慈安萬年吉地；菩陀山改“菩陀峪”，爲慈禧的萬年吉地。
光緒21年8月，東陵守護大臣爲討好慈禧，上奏朝廷說慈禧陵因連年雨水，多有糟朽，急需修整。慈禧命親信慶親王和兵部尚書榮祿爲承辦大臣。結果，陵內建築無一不修，大殿和東西配殿都從原來的揭瓦維修改爲拆後重建！此次大修工程浩大，到光緒25年已撥款150萬兩，以後的款項更是個無底之謎。中間，八國聯軍侵華使工程停頓，慈禧回京後，再次來到工地親自檢查。
1908年10月18日，工程在歷時13年重修後終於完工(巧的是4天后慈禧去世)。僅三殿所用的葉子金達4592兩！陵內的丹陛石，爲高浮雕加透技法雕成，圖案爲“龍在下，鳳在上”。隆恩殿周圍的69塊漢白玉板處處雕成“鳳引龍追”，74根望柱頭打破歷史上一龍一鳳的格式，均爲“一鳳壓兩龍”，暗示她的兩度垂簾。