原作的世界觀設定（必看）
本作可能會用到，或者修改的。
首先按照GX裡說的，現在整個是分爲12個次元，以12個不同的宇宙存在，對應着12個星。然而6Ds中又出現了負等級只是正常次元中的負面世界，就像鏡子一樣（大概）。現在又出現了zexal中的階級，由於還沒有具體說明，所以不好推斷。再加上蟹爺說同調是人類進化的象徵（這並不假），而Z裡面沒有同調，但是科技卻比6Ds要先進。所以推測，要麼是平行空間（難道超出了12次元！！），要麼恭喜Z－ONE爺爺！你的目的達到了！！
咳咳！重回話題。人類所居住的只是12次元中其中的一個次元，其他的次元就不用多說了吧，就是決鬥精靈的世界。這從GX中，十代他們不停地穿越不同次元尋找約翰可以看出，雖然都有決鬥怪獸的存在，但是所在的次元不同。每一個次元都有通向下一層或者上一層的門（就是暗約翰和凱撒決鬥時身後的那個門），這也可以進一步說明12次元的等級之分是存在的。
然後再回到10000年之前，也就是亞特蘭提斯文明還存在的時候。那個時候按照達姿所說，人類與決鬥的精靈是共存的，那我們也就有理由相信當時並沒有分成12個次元，而是一個整體。至於之後發生了什麼事情導致分裂出12個次元，以至於這個宇宙中沒有精靈，那就不知道了。但是可以肯定的是這個次元是主要的。（難道是被吉爾伽美什的Ea劈了？？）
大體的世界觀就到這裡。
決鬥怪獸，最古老的遊戲，古埃及在3000年前將決鬥怪獸視爲決定命運的儀式。任何人都可以召喚決鬥怪獸，而從埃及記憶篇中我們可以知道，決鬥怪獸反映的是人類的心靈。但是有魔物也有精靈。從這一點可以看出，亞特蘭蒂斯事件之後，雖然精靈們離開了，但是依舊與這個次元有着微妙的聯繫。人心的善惡，反映出召喚出的是魔物還是精靈。
在古埃及王朝衰敗後，就埋藏於地下。直到佩格薩斯將它們挖掘出來製成遊戲卡片。從此，異世界的精靈們有了與這個世界真正的連接方法。而且，人類更加可以創造出新的決鬥精靈，新生俠就是很好的例子。
再說說光與暗的問題。個人認爲按照遊戲王的世界觀來說，宇宙中應該分4種勢力。1.正義的黑暗。代表人物：遊戲，十代。。代表人物：黑暗大邪神，DARKNESS。3.守護之光。代表人物：光之創造神。4.毀滅之光。代表人物：齋王琢磨（毀滅之光），光之金字塔。
最後來說最難說的歷史問題。
跳過DM，GX的正常走向不提，6Ds完全與前面銜接不上。起先我以爲是平行空間，但是從劇場版來看，遊戲的DM十代還是存在的。又從Z－ONE的回憶中可以看出，他所查閱的遊星的資料直到暗印者爲止就沒有了。隨即與同學討論得知，之後的一切都是Z－ONE弄出來的。
正常的歷史，零點反轉依舊發生，而遊星在沒有紅龍的幫助下打敗了4位覺醒的暗印者（米絲蒂，魯道加，鬼柳，迪馬克），之後依然組成了5Ds隊，並自行領悟了加速同調和三角加速同調，只不過歷史記載的三角加速同調的怪獸是宇宙耀變龍（コズミック?ブレイザ??ドラゴン）。
然後到了未來，人心被**所支配，同調被引向了錯誤的方向，導致MOMENT製造機皇帝滅世。在Z－ONE地努力無果下，最後世界只剩下了4個人類Z－ONE，阿波利亞，帕拉多克斯，安提諾米。他們4基友（誤），研究着如何改變世界，最後的結果是需要回到過去。但是此時的他們都已經是花甲的老人，除了Z－ONE以外的其他人都死去了，於是Z－ONE製作了他們的複製人，並將它們送到了過去。
這裡不得不提的是，以上並沒有出現紅龍。因爲當時紅龍.根本不存在。
當世界毀滅時，鏡頭中出現的那輪類似夕陽一樣的球體，成紅色狀。在紅龍的力量的相互撞擊下（傑克第一次對戰遊星，星塵對真紅）時，海馬公司的MOMENT曾經發生過能量超標的現象。因此，可以將紅龍與MOMENT聯繫起來。而且最後的紅球可能就是MOMENT的意識終端。
MOMENT可以讀懂人心，因此可以推斷出MOMENT讀出了最後那4人的嘆息，以無上的神力……開玩笑的！將紅龍送回了過去。
然而回到過去的途中出現了差錯，紅龍一部分力量在回到了10000年前（可能是在亞特蘭蒂斯文明消失以後的事件段），被地縛神同化成紅蓮惡魔（也就是羽蛇神庫庫爾坎的樣子），結果被傑克的前世（姑且這麼認爲）用燃燒之魂封印（比普通地縛神的封印NB多了）。
按照《Steins；Gate》的觀點，就是世界分支成了β世界線。與原α世界線的走向不同。
然後過了5000年，除了紅蓮惡魔以外的地縛神破除封印，紅龍率領着手下們再次封印了它們。戰鬥中的古代妖精龍受傷封印，生命洪流龍在5000年的時光中被遺忘。（PS：黑羽龍不是紅龍的手下。）所以嚴格來說，是6龍印者，5條龍。（受不了K社的黑歷史啊！！！！！！！！）
然後3000年前，星之民的信仰開始了。
與紅球派出的紅龍不同的是，Z－ONE讓阿波利亞的分身們回到了正確的時間點，也就是零點反轉的時間段，並暗中控制了一切。而之後就如同劇情一樣，沒有什麼好講的吧。
雖然是β世界線，但是Z－ONE與紅龍改變歷史的方向不一樣。Z－ONE希望毀滅新?童實野市，紅龍希望選出領導人，將世界引向正確的發展。
這也是之後爲什麼會發生弧形搖籃事件了。
個人認爲，其實Z－ONE的心理也不想毀滅新?童實野市。不然他爲什麼派安提諾米下來幫助遊星，還放下了流星龍石板。從Iliaster三皇帝的對話中可以看出，降下流星龍石板的，不是紅球，而是Z－ONE。也許Z－ONE的潛意識裡也希望正牌的遊星來阻止自己吧。