沒錯，這艘船，當然也不是什麼普通的船。
白石記得這上面，會發生一起連環殺人案。
二十年前，影子計劃師葉才三帶着他的三個同夥搶劫銀行，這個過程中，他們誤殺了一位名叫鮫崎美海的銀行職員。
葉才三一向只搶劫，不殺人。得知那名職員不治身亡後，他打算去自首。另外三個同夥當然不答應，搶先一步將他射殺墜海。
之後，同夥們將搶來的錢存進了一家銀行的保險櫃。要想取出存款，需要有印章、鑰匙、簽名這三樣東西。
他們三人一人負責一個，打算等上20年，時效一過，就取出錢來分贓。
二十年後——也就是最近——負責簽名的鯨井定雄在報紙上刊登了廣告。
他打算引來並殺死自己的兩名同夥，再從同夥身上拿到鑰匙和印章，獨佔搶來的錢財，順便借這一系列巧妙的殺人計劃，證明自己策劃犯罪的才能並不比葉才三差。
之所以在廣告上使用“古川大”的落款，是因爲鯨井定雄覺得，這是葉才三愛用的假名，另外兩個同夥看到就懂了，而社會大衆卻不懂其中的奧妙，非常方便用來暗中召集同夥。
但他不知道的是，這個假名，其實是用“葉才三”橫過來後的“古”“大”“川”三個字，重新組合成的名字。
所以，看到這一則廣告後，除了鯨井定雄的兩個同夥，其他相關人員也都紛紛混上了船——比如葉三才的女兒，比如當年負責這起案件的鮫崎警官，再比如亡者鮫崎美海的男朋友等等。
另外，由於殺人計劃的某一個環節，還需要有一名偵探，所以鯨井定雄又匿名寄信，請了一位大阪的偵探。
這次的兇手和被害人互掐，屬於歹徒內鬥，白石並沒有接到拯救他們的任務。
但在這一起連環殺人案之外，還有另一個人在搞事——鮫崎美海的男朋友。
鮫崎美海死後，他辭去銀行的工作，一路追查兇手。
這次，看到“古川大”的廣告之後，他有一種能大仇得報的預感，所以帶來了一大箱定時炸彈，打算一旦確認仇人在船上，就用炸彈跟他們同歸於盡。
白石正努力回憶着案情，忽然看到一個人匆匆衝上船，把手裡沉重的公文包放到地上，粗喘着擦汗。
白石看着這個老實人，又看了看他特徵明顯的公文包，心想還真是不經唸叨——這應該就是那位帶炸彈的狠人了。
路過他時，白石順手往男人身上撒了一枚發信器，方便弄清他的房間在哪，之後也好做任務。
安室透看了一眼，有些疑惑。
等走遠了，他正想問，卻聽到松田搶先解釋：“測試性能。”
“……”
雖然不知道是真是假。但隨着松田對那個人的關注，安室透彷彿看到那個路人頭頂，有倒黴的陰雲正在成型。
……
柯南靠推理和直覺一路亂轉，最後竟然真的在港口，遠遠看到了兩個組織成員上船的背影。
他企圖溜到船上，但被盡職盡責的工作人員攔了下來。
柯南只好向工作人員打聽船會開往哪裡，打算換一艘別的船跟蹤過去。
但問完之後，正準備離開時，他卻看到一個很眼熟的黑皮偵探和一個扎着馬尾的高中女生一起，朝這邊走來，看那方向，竟然也像是要上船。
柯南盯着服部平次，眼前一亮。
……
五分鐘後。
服部平次腆着一隻啤酒肚，跟旁邊滿臉尬笑的遠山和葉一起，在工作人員詭異的注視下，出示紙幣，混上了船。
服務員給他們分配了一處雙人標間，遠山和葉放下行李，伸了伸懶腰，準備去甲板上看風景，一路坐車坐得渾身發酸，她想活動一下。
等她走了，服部平次把衣服裡罩着的柯南掏出來：“說吧，爲什麼非要跟着我？”
上一次，在大阪時，服部平次猜出了柯南=工藤新一的真相。在那之後，柯南就把組織的事告訴了他。
雖然這件事比較危險，但那時，柯南的盟友非常稀少——博士不太指望得上，灰原哀則堅定的認爲，知道越多，就越危險，什麼都不肯說。
至於白石……一是這位鄰居非常熱愛和平，萬一被他知道世界上還藏着這麼大一個非法組織，他說不定會感到焦慮，進而做出容易招來危險的事。
二是由於嗜睡症，和那種神奇的事件體質，白石本來就很容易陷入危險。要是在這個基礎上，再加一個組織……柯南想想都覺得替他覺得水深火熱，說不出口。
另外，在某一次柯南找白石要過APTX4869的臨時解藥後，黑貓又來找他“友善交流”了一番，讓他不要再跟白石提組織的事。
以那兩個人之間情報交流的速度，柯南懷疑自己前腳跟白石聊完組織，後腳就會被黑貓綁走送給組織解剖。
因此，那時突然冒出來一個服部平次，柯南就像憋了太久的人終於找到了樹洞，告訴了他一些關於組織的事。
剛纔，柯南去找服部平次想蹭船的時候，因爲旁邊還有遠山和葉在，他沒提自己是在追蹤組織成員，只死皮賴臉的賣萌，說想上船玩。
服部平次知道這個熊孩子的表皮下，裝着的是工藤新一的靈魂。
——看到這麼大一個人連節操都不要了，他猜測是出了什麼大事，所以儘管柯南支支吾吾的什麼都不說，他還是把人帶上了船。
畢竟得到的情報越多，面對危險時，應變能力也就會越強。
現在已經到了船上，周圍也沒有其他人，服部平次覺得，可以問一問柯南上船的目的了。
柯南的臉色也確實無比嚴肅，然而在開口前，有人給他打來了電話。
柯南拿起手機，屏幕上顯示着毛利蘭的名字，他一怔，突然心虛——之前光顧着追人，忘了把自己離開的事告訴毛利蘭和毛利小五郎了。
柯南接起電話想解釋，然而對面傳來的聲音非常斷續。
他一開始以爲是船上信號不好，但走到窗邊，還是聽不清毛利蘭說話。
“你該換一部正經手機了，那個博士做的東西，好像不怎麼靠譜。”服部平次給遠山和葉發了一條短信，提醒她別跑太遠，信息順利發了出去，信號也是滿格的。
他走到柯南旁邊，把自己的手機借給柯南。
然而柯南用他的手機打，信號也還是很奇怪。
柯南勉強解釋了自己現在跟服部平次在一起，沒有走丟，然後掛斷了電話。
等分散到毛利蘭那邊的注意力收回來以後，柯南盯着手機，想起剛纔奇怪的信號，再想起自己之前接觸過誰，臉色刷一下變得慘白。
服部平次盯着他，也是差不多的表情。
他拽下柯南的衣服，兩個人排雷一樣仔細搜索，最後終於在翻下來的衣領夾縫裡，找到了一枚扁平的竊聽器。