然而，事情卻出乎了葉雲的預料，加斯在得知聖櫃也就是二型文明的事情解決了之後卻並不願意帶着阿薩人離開，畢竟他們現在還未找到合適的星球，況且宇宙太過遼闊，誰也不知道離開了元星之後會遇到什麼，以他們現在的科技，離星際航行還是有所差距的。
加斯不願帶阿薩人離開，還想徹底統治元星，這帕克斯自然不會答應，畢竟在帕克斯看來，他們雖然是由人類結合科技培育出來的，但他們依然是由人類胚胎生長而成，只不過是後天利用了一些藥劑跟科技手段，這才得以擁有漫長的壽命，但本質上他們依然是人類，從他們自稱阿薩人就能看出，因此帕克斯他並不想讓阿薩人跟普通人類徹底決裂。
加斯雖然是帕克斯復活的，但他畢竟是一個ai，他思考的方式跟人並不相同，他在被複活之後就沒有了人的感情，現在的他一切都只靠數據說話，因此，在計算出由亞人統治元星更爲有利於文明的發展之後，他接管了阿斯嘉特的控制權，企圖困住葉雲他們，就連知道了加斯只是個人工智能的古瑞德都拒絕了執行這個命令，不過加斯擁有控制納米裝甲的能力，因此古瑞德直接就被他控制住了。
不過可惜，在阿斯嘉特重型武器不能使用的情況下，僅憑一兩架納米尖兵根本就不是葉雲的對手，對葉雲他們出手的加斯僅僅堅持了三秒就被葉雲冰封了。
雖然葉雲沒有直接幹掉加斯，但帕克斯卻還是將加斯重啓了，而重啓之後的加斯已經不能算是加斯了，現在的他雖然還擁有加斯的記憶，但在重啓之後他就只是一個叫做加斯的人工智能而以，一個只會聽從命令行事的人工智能。
一個星期之後，古瑞德成爲了阿薩人的五大長老之一，頂替了加斯的位置，他將帶領阿薩人離開元星，進入茫茫宇宙當中尋找屬於阿薩人的家園，而阿薩人當中，除了瑞，帕克斯跟赫雅之外，只有海拉留了下來，因爲她要留下來尋找消失了的託瑞斯，而亞人駕駛着方舟離開元星之後，阿斯嘉特就成爲了聯合軍的總部。
聯合軍入住阿斯嘉特之後，憑藉阿薩人留在阿斯嘉特的科技跟武力很快就掌控了整個元星，而掌控元星之後聯合軍第一條命令就是停止採集塔的運轉，並開始治理元星的生態，現在整個元星的生態因爲阿薩人之前不計後果的開採，已經變得異常惡劣，如果不治理的話，用不了多久元星的生態就會崩潰。
當然，這些都跟葉雲無關，他對元星上的這些事都不感興趣，他現在正忙着讓赫雅幫他升級魔幻手機跟打造屬於他的納米核心呢，畢竟魔幻手機的本體就只是一部普通的手機，他現在已經漸漸用不上了，而現成的納米盔甲他又不想用，畢竟他是修煉之人，直接將核心植入這樣的方式並不適合他，所以要修改一下。
在赫雅幫葉雲升級魔幻手機的硬件並修改納米盔甲的設定時，葉雲也帶着米婭他們離開了聯合軍，他之前就答應過米婭他們要帶着他們去找他們的族人的，現在終於閒下來了，自然不能食言。
葉雲記得原劇中米婭他們族人所在的地方其實離聯合軍的分部基地並不遠，一個就是在基地外羣山的某個紫霧區中，他們依靠變種人不懼紫霧的特點，從紫霧區當中找到了一個類似於颱風眼的安全地帶，從新修建了村子，不過葉雲也記得，變種人的族長已經投靠黃昏組織了，而黃昏組織就是一開始運送瑞那艘飛船的亞人艦長。
葉雲收走聖櫃的事情除了聯合軍的夏克以及葉雲他們幾個當事人之外，並沒有其他人知道，因此葉雲估計，黃昏組織跟金蝰蛇應該都還在打它的主意，而現在阿薩人已經離開，知道聖櫃所在的就只有瑞他們幾個了，當然，葉雲知道，他也是這些人的目標之一，因爲藍雀就聯繫過他好幾次。
想到這裡，葉雲忽然覺得自己很笨，爲什麼自己要去找呢？既然變種人的族長跟黃昏組織有聯繫，那他直接等他們上門，然後去問不就行了？還傻乎乎的去找。
想明白這一層關隘的葉雲雖然依然帶着米婭他們在紫霧區外尋找，但卻暗中發出消息，自己找到了聖櫃的線索，而黃昏組織想要得到聖櫃這個無盡的能源，因爲黃昏組織的老大霍伊以爲聖櫃其實就是用來控制戴森球的（用來包裹恆星開採恆星能的人造天體），而金蝰蛇的羅烈則認爲聖櫃擁有讓人起死回生的能力，但是可惜，聖櫃其實是元星遠古文明離開之後留下來守護元星的裝置，隔斷恆心能源就是爲了避免呢元星出現太高等級的文明，而納米核心就是用來守護聖櫃的，只不過不知道發生了什麼原因，聖櫃的防禦系統出現了問題，導致了原本跟地球類似的元星出現瞭如此巨大的改變。
劇中霍伊就親自啓動了他以爲是戴森球的聖櫃，而聖櫃啓動之後直接放出了遮天蔽日的紫霧，遮蔽了恆星的光芒，讓元星陷入了黑暗當中，啓動他的霍伊也成爲了聖櫃清除前來阻止他的瑞的武器，最後還是瑞融合了海拉，古瑞德，曼德斯他們的核心，然後在糖心他們的幫助下才打敗了複製了他所有數據的複製品，不過可惜聖櫃當時已經啓動，因此瑞他只能將自己當成容器，複製了聖櫃的數據，成功的控制了恆星屏障，讓元星這才恢復了光芒，但是他也因爲吸入了太多的數據跟能源（紫霧），化成了光。
不過劇中並沒有說瑞死了，葉雲記得光芒閃過之後，糖心他們也被拉入了一片白茫茫的世界當中，糖心看到瑞衝上去想要抱他，但卻從他的身體穿過，而當糖心問他到底怎麼了的時候，瑞告訴他們，說：“可能我並不在這裡，這是我在這個次元的投影，我自己也搞不清楚。”
按葉雲的理解，瑞當時應該已經超越了這個維度，成爲了另一個維度的生物，因爲劇中瑞還說他能看到這個世界的過去，並且他要到未來去找赫雅，然後就消失了。
當然，這都是劇中的事情，現在這些都不會發生，因爲這個所謂的聖櫃正安靜的躺在他的儲物戒指當中，而在葉雲散發出聖櫃消息的時候，一些有些人悄然將目光投向了沒有絲毫掩藏行蹤的他們身上。