此時銀幕中的女主角在夜空下的樓宇之間，奔騰跳躍，想要擺脫特工的追擊。
她的身手靈活，修長的雙腿充滿了爆炸力，緊身皮衣在腳上的高跟皮靴的作用下，更是緊繃在性感高挑的身體上，每一次跳躍總能引得影廳中發出一陣低呼。
許多觀衆緊緊的盯着銀幕，眼神中露出癡迷的神色：“這就是我的女神啊！哪怕是爲了看她，我也要多進幾次影院！”
終於，崔妮蒂擺脫了身後特工的追擊，衝出樓房，向着寬敞的馬路跑去，那邊的電話亭就是她的目標，但另一名特工史密斯已經駕駛卡車等在了電話亭前。
崔妮蒂也露出了猶豫的神色，因爲他察覺到了，那名特工明顯要想等她進入電話亭的時候開車撞擊。
“她爲什麼要在這樣緊張逃命的時候進入電話亭？”這個時候所有的人心中都有一些疑惑，周圍沒有其他人堵截，崔妮蒂完全可以逃往別的地方啊。
這個時候，電話亭中的鈴聲響起，崔妮蒂終於不再猶豫，邁動長度驚人的雙腿，義無反顧的衝進電話亭，拿起了電話。
與此同時，史密斯特工發動卡車，將電話亭撞成了粉碎，廢墟中卻沒有崔妮蒂的屍體。
女主角不可能開場就掛掉，觀衆都知道這一點，不過還是疑惑崔妮蒂是怎麼消失的，而這個時候，特工的話做出來瞭解釋。
“她逃脫了，我們的內線提供的消息非常準確。”
而體味到這個對話的含義的時候，觀衆又不自覺的爲女主角擔心起來，特工的話顯然表明崔妮蒂的夥伴之中出現了叛徒。
開場激烈驚豔的表演之後，主角尼奧出現在了屏幕上，接下來是一系列的文戲，也是交待世界架構重要的一部分，當然和上一世不同的是，裡面少了許多莫名的情節，只是以比較簡潔的鏡頭語言交待出這個世界不同尋常的地方。
那些故弄玄虛的對白和帶着哲學意味的話題，或許會受到影評人稱讚，但普通觀衆可不會喜歡一直看這些東西。
這段情節清晰的交代了出尼奧黑客的身份，以及母體和墨菲斯都在尋找他，在男女主角第一次見面之後，飛快的轉入到了特工追尋尼奧的情節，其中的環宇最新款的彈蓋手機，也讓觀衆眼前一亮。
尼奧沒有按照墨菲斯的指示逃走，最後被特工抓走，審訊中再次上演了不可思議的一幕。
“如果你不能開口說話。”銀幕上的史密斯特工，冷冰冰的對尼奧說道：“打電話找律師又有什麼用？”
尼奧不明白他的意思，但就在下一刻，他的嘴忽然黏在了一起，並且一點點從觀衆眼前消失，最後變成了一個無嘴人！
這一幕讓觀衆們都驚呆了，心中想着史密斯特工是不是擁有超能力。
緊接着，尼奧被按在審訊桌上，史密斯特工拿出一隻電子蟲，蟲子很快就鑽進了尼奧的肚子裡，讓觀衆們更不明白史密斯在做什麼，這實在是有一些詭異。
緊接着畫面切換，尼奧從夢中驚醒，似乎剛剛發生的只是一場夢，只是接下來尼奧和崔妮蒂再次見面時，崔妮蒂用殺蟲器從尼奧身上吸出了那隻電子蟲，證明了史密斯特工所動的手腳，並不是尼奧的夢境。
不過此時觀衆開始疑惑史密斯這麼做到底是爲了什麼，而且影片許多的情節充滿了詭異的感覺，彷彿這個世界隱藏着什麼。
懸念牢牢吸引住觀衆的心思，他們都想知道這究竟怎麼一回事，只有少數看過小說的影迷，此時帶着一些優越感看了看滿臉疑惑的其他觀衆，好不容易纔忍住了劇透的想法。
接下來尼奧終於還是見到了墨菲斯，在兩個人的對話中，這個世界的本質開始展現冰山一角。
這個時候的墨菲斯彷彿就像是一個神棍，他的話也讓人充滿了探知的慾望。
“這個世界是一個沒有知覺的牢獄？母體無處不在！如果你想脫離夢魘，去真實世界看看……”
尼奧最終沒有忍住心中的好奇，決定去看看墨菲斯所說的真相，而吞下藥丸後，尼奧發現這個世界似乎變得扭曲了起來。
這個時候，觀衆們都知道了，尼奧他們所在的世界是夢魘，是牢獄，另一個真實的世界在等着他們！
接下來，畫面轉換，觀衆看到了完全不一樣的世界，在類似培養槽的設施中，一個人掙扎的爬了起來，他身上插滿了管槽！
雖然光頭光身，但觀衆還是一眼認了出來那是尼奧。
畫面隨着尼奧的視角轉動，周圍是無數類似培養槽的設施，除了偶爾亮起的閃電，從地面到半空再到高空，都是一片漆黑，其中還能看到飄動的厚厚的烏雲和塵埃，完全是一副末日般的景象。
“歡迎來到真實世界！”墨菲斯說出了這句話，而且伴隨着影片情節的推動，尼奧回到了真實的世界，漸漸恢復了正常，一個真正的世界隨着墨菲斯的訴說展現在了人們的面前。
母體！電子信號！真實的世界！矩陣世界……一個個答案從在墨菲斯口中說了出來，讓許多的觀衆恍然大悟的同時都忍不住吃驚，同時心中冒出來了這樣的一個念頭：如果這就是真實的世界，那真實就實在太過殘酷了，那些生活在矩陣中的人，跟行屍走肉有什麼區別？
這個時候，不少的觀衆目光掃向手中的可樂和爆米花，忍不住冒出來了這樣的想法：“我們看到的，喝到的這些……不會也都是電子信號吧？”
然而此時一些讀過小說的觀衆卻忍不住露出神秘的笑容，因爲他們知道，目前這些讓觀衆大吃一驚的“真相”，其背後的一切更爲驚人，整個《黑客帝國》反轉每一次讓人大吃一驚的同時，又會讓許多人覺得在情理之中。
當然，後面的這些保羅也不會在第一部拋出來，此時觀衆們的注意力，也很快就被影片轉移了，《黑客帝國》小說的賣點在真實和虛幻的思考上，其中甚至還有大量的故弄玄虛的哲學和神秘學的探討，而電影卻絕對不是，它的目的是帶給觀衆一場無與倫比的視聽盛宴。