真菌研究小幫手 影像變化一把抓

中央研究院分子生物研究所助研究員薛雁冰團隊，開發一套影像分析軟體工具「真菌形態追蹤器」，可「定量」描述真菌生長，幫助科學家對真菌型態及其生長的定量進行分析。（中研院提供／李侑珊臺北傳真）

真菌於地球上幾乎無所不在，包含酵母、黴菌等微生物以及菇類都屬於真菌，跟人類生活息息相關。自然界中約有超過500萬種不同的真菌，其中大部分爲絲狀真菌。

如果你曾經把麪包放到發黴，有天驀然回首，會發現麪包長出一塊一塊的黴菌菌絲，但很難精準描述其生長速度、生長範圍、菌絲長度。由於缺乏有效定量分析方法，儘管絲狀真菌多樣性極高且普遍存在於大自然中，科學家們對於大多數的真菌種類之型態、或其生長的瞭解十分有限。

中央研究院分子生物研究所助研究員薛雁冰團隊研發「真菌形態追蹤器」，可在單一影像中，計算真菌孢子的數量、量測孢子的形狀大小，更能觀察錯綜複雜的菌絲生長樣貌，例如菌絲總長度、分叉數目、菌落面積等。同時，也能借由分析縮時影像紀錄觀察真菌菌絲隨着時間所發生的變化；更重要的是，軟體比起利用傳統人工方式計算，可以更快速地收集到準確的量化數據。

這個電腦視覺技術可比較野生型真菌和突變型的真菌，兩者菌株生長情況有何不同？並且可以非常精確的做定量的測量描述。

薛雁冰表示，當團隊發現不同菌株之間，看似有生長差異，但是卻很難用定量的方式來描述時，「真菌形態追蹤器」便能夠提供一個快速的方法，精準分析菌株差異，瞭解菌絲長度密度、菌絲分枝數量與菌落面積。當有了這些資料，就有機會了解真菌生長如何被基因調控。