聯想算力將是數字醫療的發動機
新冠疫情的爆發一定意義上開啓了全球製藥行業的新篇章,製藥企業必須比以往任何時候都更迅速地開發疫苗和治療方法。
通常,開發一種新藥從新藥發現到審批上市需要十多年的時間。然而,自今年初新冠疫情爆發以來,一些實驗室和跨國製藥公司在不到一年的時間內就進行到了疫苗和治療方法的研發後期,以期幫助全人類早日恢復日常生活。
但是許多衛生健康專家認爲,新冠病毒可能不會是最後一次全世界大流行病毒。因此,專家們強調需要開發一個平臺,以便在下一次全球大流行病發生時更快地開發出安全有效的治療方法。
在此背景下,聯想數據中心集團認爲,基於聯想基因組測序軟件的精準施藥或許能夠爲未來解決此類醫學難題提供解決方案。
聯想數據中心集團生命科學、HPC&AI部門全球負責人Mileidy Giraldo近日在接受採訪時表示:“我們的數據中心集團專注於評估最新的高性能計算(HPC)技術,以帶來創新,併爲科學探究節約時間。”。
Giraldo還提到,聯想一直在利用這項技術圍繞“組學分析”在包括基因組學、轉錄組學和蛋白質組學等多個領域建立強大的算力,因爲目前幾乎所有的生物醫學項目都依賴於高性能計算機。“測序和基因組分析成本在過去20年裡已經大幅降低,利用現有技術進行規模化更容易。與1990年第一次基因組測序長達13年和300萬美元的花費相比,整個過程現在只需花費大約1000美元和幾天的時間,時間和成本都大幅下降了。”
Giraldo補充說,在新冠肺炎治療領域,許多公司也一直在使用組學分析來解決未知問題,例如新冠病毒的感染機制和宿主的免疫反應。然而爲了使病情分析更具可擴展性,仍然需要進一步確保基因組分析處理更加快速、成本可控、易於使用和安全。
爲此,聯想集團於11月推出GOAST(基因組優化和可擴展性工具)系統,與目前的傳統技術相比,該系統可以進一步提高成本和時間。傳統上,處理全基因組測序(WGS)所需時間以天爲單位,但GOAST系統配置只需使用CPU,只用不到一個小時就可得出結果。目前其他公司無法做到在不使用昂貴的專業硬件,如GPU和FGPA(現場可編程門陣列)的情況下實現這樣的結果。然而大多數研究機構,包括小型實驗室,都負擔不起使用專業硬件設備的費用。
GOAST提供了兩種方案——GOAST-Base和GOAST-Plus(後者爲升級版)。這兩個系統都提供了一個經過特殊調整的硬件,包括正確的HPC部件、優化基因組學以及預先配置的軟件,以最大限度地利用研究工作中所需的HPC功能。通過使用GOAST系統,實驗室可以利用基因組分析結果來提高生產力和增加產量,同時這個系統也更便宜、更容易操作、更通用。
Giraldo談及GOAST的短期和長期目標時稱,聯想的目標是將這種解決方案提供給需要它的人,最終將其推廣至從小型實驗室到大型製藥公司的各個環節。“同時,我們希望降低操作門檻,任何人都可能創造出一個厲害的解決方案,但如果它很難入門,就很少有人能接受這種技術。因此,聯想希望這項技術是容易學會的。從長期來看,聯想將持續關注最新技術問世,並繼續推動GOAST系統性能的極限。”
中國目前在研究和製造生物製藥和醫療設備方面擁有非常可觀的前景,市場趨勢也正在轉向數字醫療,未來生物製藥行業使用HPC、AI等技術助力藥品開發會擁有事半功倍的效果,聯想集團GOAST系統等一系列解決方案的推出將成爲醫藥與科技領域更緊密結合的奠基石。