中小企業被忽視 彭明輝：設「研發基金」助扶植
全國中小企業總會理事長林秉彬感慨，中小企業佔臺灣企業總數的97.7%，吸納臺灣78%的就業人口，是對經濟發展貢獻最大的族羣，但目前三位總統候選人都未提出對中小企業實質的「照顧」政策。對此，清大動力機械系教授彭明輝提議，可以成立「研發基金」扶植中小企業。
彭明輝在部落格上寫了一篇《一個「研發基金」的倡議》，指出「政府給大財團的錢，到底有幾％流注到中小企業？假如把這些錢直接給中小企業，是不是可以創造更多的就業機會？」他提出當全球普遍發生青年失業潮，有必要思考：「臺灣的首要目標是追求GDP的成長而犧牲就業率？還是要發展中小企業來促進就業？甚至培植優秀的中小企業來從事研發，以便同時提升GDP與就業率？」
彭明輝指出，臺灣政府以爲中小企業沒有研發能力，但在亞洲新興國家和韓國的競爭下，沒有研發能立的中小企業將很難生存，「政府並沒有積極在檢討如何修改相關政策，以便讓有能力且有心於研發的中小企業得到必要的挹注。」
他提出三合化學股份有限公司負責人周治忠，以個人經歷提供的具體案例。周治忠是清大工化第一屆畢業生，留學美國後回臺服務，後來自創三合化學，十幾年前，他大幅投入研發，希望取得關鍵技術的突破性發展後，可以得到政府協助，取得轉型所需要的資金，「後來該公司發展出生質燃料關鍵技術的酵素轉酯化技術（ET Process; Enzymatic Transesterification Process），並取得美國專利（US 7473539）與歐洲專利（EP1637610），但是在進一步向潛在金主證實其專利之商業價值前，他必須要建造一示範工廠（Demonstration plant）。偏偏，在這階段他的資金已經用罄。」
而經濟部各種研發補助，對於中小企業設定額度都太低，無法支持難度較高、資金需求也較高的研發，周治忠想以專利向銀行貸款，但是國內智財評估制度和專業能力尚在起步階段，無法解決他的困境。
彭明輝舉出英國的例子，「英國皇家學院（Royal society）有募集而來的非營利基金The Royal Society Enterprise Fund，專門協助有商業潛力、科學卓越性，且友善環境的小公司，讓他們可以用基金去發展與成長。而且靠着皇家學院各領域的傑出專業人才，來評估與遴選有潛力的小公司，有機會比商業化的創投在更早期看見這家公司的潛力，也有機會加速科學研究成果的商業化」，重點是「造福人類，而不是造福財團或創造GDP」。
彭明輝表示，周治忠希望能在臺灣發起如英國的這樣一個「私人合資的非營利公益基金」，獎勵中小企業從事有助於臺灣社會發展的研發。他呼籲有興趣或意願者可與他或周治忠聯繫。